CRISPball公司
交互式CRISPR屏幕可视化、探索、比较和过滤的闪亮应用
生物导体版本:释放(3.19)
一个闪亮的应用程序,用于可视化、探索、比较和过滤用MAGeCK RRA或MLE分析的CRISPR屏幕。功能包括带有点击标签的交互式绘图、绘图美学的完全定制、数据上传和/或下载等。快速轻松地浏览CRISPR屏幕结果,并在几秒钟内生成高质量的公开数据。
作者:杰瑞德·安德鲁斯,雅各布·斯蒂尔
维护人员:杰瑞德·安德鲁斯(Jared Andrews)<Jared.andrews07 at gmail.com>
引文(从R中输入引文(“CRISPball”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“CRISPball”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“CRISPRball”)
细节
生物视图 |
CRISPR公司,图形用户界面,质量控制,ShinyApps公司,软件,可视化 |
版本 |
1.0.0 |
在生物导体中 |
生物C 3.19(R-4.4)(<6个月) |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
R(>=4.4.0),闪亮BS |
进口 |
DT公司,闪亮的,网格,复杂热图,交互式复杂热图,图形,统计,ggplot2,巧妙地,闪亮小工具,小贩,闪耀的(shinyjqui),同上顺序,矩阵统计,颜色选择器,闪亮的牛仔裤,MAGECK稀释液,绕圈子,PCA工具、utils、grDevices、,html小部件,方法 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/j-andrews7/CRISPball网站 |
错误报告 |
https://support.bioconductor.org/ |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。