CRISPball公司

交互式CRISPR屏幕可视化、探索、比较和过滤的闪亮应用


生物导体版本:释放(3.19)

一个闪亮的应用程序,用于可视化、探索、比较和过滤用MAGeCK RRA或MLE分析的CRISPR屏幕。功能包括带有点击标签的交互式绘图、绘图美学的完全定制、数据上传和/或下载等。快速轻松地浏览CRISPR屏幕结果,并在几秒钟内生成高质量的公开数据。

作者:杰瑞德·安德鲁斯,雅各布·斯蒂尔

维护人员:杰瑞德·安德鲁斯(Jared Andrews)<Jared.andrews07 at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“CRISPball”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“CRISPball”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“CRISPRball”)
CRISPBall快速入门 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 CRISPR公司,图形用户界面,质量控制,ShinyApps公司,软件,可视化
版本 1.0.0
在生物导体中 生物C 3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.4.0),闪亮BS
进口 DT公司,闪亮的,网格,复杂热图,交互式复杂热图,图形,统计,ggplot2,巧妙地,闪亮小工具,小贩,闪耀的(shinyjqui),同上顺序,矩阵统计,颜色选择器,闪亮的牛仔裤,MAGECK稀释液,绕圈子,PCA工具、utils、grDevices、,html小部件,方法
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/j-andrews7/CRISPball网站
错误报告 https://support.bioconductor.org/
查看更多
建议 仿生风格,msigdbr公司,depmap(深度映射),水塘,RSQ网站,我的基因,测试那个(>= 3.0.0),针织物,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 CRISPRball_1.0.0.tar.gz(中文)
Windows二进制 CRISPRball_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64) CRISPRball_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) CRISPRball_1.0.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CRISPball网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/CRISPRball
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CRISPRball网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/CRISPball网站/
软件包下载报告 下载统计信息