BUSseq公司
scRNA-seq数据未知子类型的批效应校正
生物导体版本：释放（3.19）
BUSseq R软件包适用于一个可解释的贝叶斯层次模型，即scRNA序列数据的未知子类型批效应校正（BUSseque），用于在存在未知细胞类型的情况下校正批效应。BUSseq能够同时纠正批处理效应、聚类细胞类型，并处理计数数据的性质、过度分散、丢失事件以及scRNA-seq数据的细胞特定测序深度。使用BUSseq校正批次效应后，校正值可用于下游分析，就像所有细胞在单个批次中测序一样。BUSseq可以整合从不同scRNA-seq平台获得的读取计数矩阵，并允许在一些但不是所有批次中测量细胞类型，只要实验设计满足我们手稿中列出的条件。
作者：宋方达[aut，cre]
，陈嘉明〔aut〕，魏莹莹〔aut〕
维护人员：宋方达<sfd1994895 at gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“BUSseq”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“BUSseq”）
细节
| 生物视图 |
BatchEffect（批次效果）,贝叶斯主义者,群集,实验设计,特征提取,基因表达式,排序,单个单元格,软件,统计方法 |
| 版本 |
1.10.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.14（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=3.6） |
| 进口 |
单细胞实验,总结性实验,S4载体,gplots（gplots），gr设备，方法，统计，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/songfd2018/BUSseq |
| 错误报告 |
https://github.com/songfd2018/BUSseq/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
