AHMassBank公司

AnnotationHub的MassBank注释资源

生物导体版本：释放（3.19）

为AnnotationHub提供捆绑在CompDb SQLite数据库中的MassBank代谢物/化合物注释。CompDb SQLite数据库包含一般化合物注释以及代表化合物离子碎片模式的碎片光谱。MassBank数据检索自https://massbank.eu/massbank网站并使用来自CompoundDb Bioconductor包的辅助函数处理为可重新分发的SQLite数据库。

作者：约翰内斯·雷纳

维护人员：约翰内斯·雷纳（Johannes Rainer）。欧洲大学的Rainer

引文（从R中输入引文（“AHMassBank”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“AHMassBank”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“AHMassBank”）

为AnnotationHub提供EnsDb数据库	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	注释Hub软件,质谱学,软件
版本	1.4.0
在生物导体中	生物柴油3.17（R-4.3）（1.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.2）
进口	注释中心数据(>= 1.5.24)
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/jorainer/AHMassBank
错误报告	https://github.com/jorainer/AHMassBank/issues

建议	仿生风格,针织物,批注中心(>= 2.7.13),rmarkdown公司、方法、，复合Db(>= 1.1.4)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	AHMassBank_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	AHMassBank_1.4.0.zip
macOS二进制（x86_64）	AHMassBank_1.4.0.tgz
macOS二进制（arm64）	AHMassBank_1.4.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AHMassBank
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/AHMassBank
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/AHMassBank/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/AHMassBank/
软件包下载报告	下载统计信息