hellblaues Banner,auf welchem zahlreiche Kreise abgebildet sind,在denen verschiedenste Blüten zu sehen sind。在布卢门广场的Mitte des Banners sind die drei Blumen platziert,die den Startbildschirm der Flora-Incognita-App ausmachen。

生物。AI.大学观察与整合(生物AI)

Jana Wäldchen博士

Unsere任务

Die Forschungsgruppe帽子drei Schwerpunkte:a) Automatisierte Artbestimmung,b)u berwachung der biologischen Vielfalt und der Funktonsweise vonØkosystemen und c)bürger:innenwissenschaft(公民科学)。Unserübergeordnetes Ziel ist es,das globale Biodiversitätsmonitoring zu vereinfachen,zu beschleunigen und zu verbessern,indem wir die automatisete Artbestimung mit Citizen Science-Initiative verbinden。

自动化Artbestinmung

Ein Schwerpunkt der Forschungsgruppe“生物、人工智能、大学观察与整合”就是一个例子Weiterentwicklung der automatischen Artbestimung公司(瓦尔德琴与梅德,2018年)。
Die laufenden Forschungsarbeiten haben zur Entwicklung创新家Methoden geführt,Die eine Brücke zwischen Informatik und Botanik schlagen。Besonderes Augenmerk滞后于Auswertung verschiedener pflanzenartenspezifischer Bildperspektiven(Rzanny等人,2022年、2019年、2017年)。Dieser Ansatz ermöglicht ein umfassenderes Verständnis von Pflazenmorphologie und-merkmalen,wodurch die Genauigkeit automatisier Systeme zur Artbestimung erheblich verbessert wurde。Ein bedutendes Ergebnis dieser Forschung is die Entwicklung der埃格布尼斯·迪赛尔·福尚是恩特维克隆德的遗体Flora Incognita应用程序,die für die interaktive automatische Bestimmung von Gefäßpflanzenarten entwicket wurde undüber 16.000 Arten erfasst(Mäder et al.2021)。
Darüber hinaus arbeitet die Gruppe aktiv an Methoden zur(达贝尔·希诺斯·阿尔贝特)DNA与Bilddaten für die automatische Artbestimung与分类法Klassifizierung合并,insbesondere für taxonomisch anspruchsvolle Artengruppen(Kösters等人,准备,Karbstein等人,2023)。在Zusammenarbeit mit dem iDiv und dem UFZ Leipzig entwicket die Gruppe außerdem einen Monitoring-Ansatz zur artspezifischen Analyse von Phytoplanktonproben(Dunker等人,2018年)。

Die wichtigsten Publikationen公司:

 

Forschung zur Biodiversität und zur Funktonsweise vonØkosystemen生物多样性

Aufbauend auf dem umfangriechen Datensatz der Flora-Incognita-App,der von Citizen Scientists generiert wurde,wurde die Forschung der Gruppe ausgeweitet und konzentriert sich nun auf die Analyse von op机会主义者Daten zum Pflanzenvorkommen。在过去的分析中,我们用makroökologische Muster mit Flora Incognita-Beobachtungsdaten einer einzigen Vegetationsperiode nachweisen(Mahecha et al.,2020)。
Außerdem haben wir untersucht,inweweit op机会主义Daten das systemische phänologische Monitoring ergänzen können(Katal&Rzanny et al.,2023)。Eine europoweite Studie zeigte,dass oppositistische bürgerwissenschaftliche Pflanzenbeobshtungen räumliche und zeitliche Gradienten der Phänologie aufdecken(Rzanny et al.,2024)。Diese Untersuchungen unterstreichen die wertvollen Erkentnisse,die op机会主义Daten liefern können,und bereichen damit unser Verständnisökologischer und phänologischer-Muster auf breiterer Ebene。
Im Rahmen des neu eingerichteten PollenNet-Projekts werden wir die Pollenverbreitung过敏原Pflanzen vorhersagen。Diese Studienbereich sind entscheidend für die Erweiterung解封Wissensüberökologische Dynamik,die Erhaltung der biologischen Vielfalt und die allgemeinen Auswirkungen von Pflanzenarten aufkosysteme und menschliche Gesundheit。

Die wichtigsten Publikationen公司:

 

公民科学、教育与知识共享

Erfolgreiche wissenschaftliche Arbeit gehtüber die wissenschaftliche Gemeinschaft hinaus and erstrekt sich auf den Wissens-and Technologietransfer in Gesellschaft hinein。Insbesondere das Projekt Flora Incognita在海滩和祖斯普鲁奇发现。
Mit der Flora Incognita App erfschen wir Methoden der effectiven Wissensvermitlung in verschiedenen Formen(Abzeichen,Storytelling und mehr)(Bebber und Wäldchen,2024,Wäldechen et al.,2022)-dieser Aspekt war seit Anbeginn des Projekts in Teil der Strategie。Als Ergebnis dieser Bemühungen hat die App durch Fernsen,Presseberichte und die aktive Nutzung von Social-Media Plattformen breite Anerkennung und internationale Sichtbarkeit erlangt。
Dieseßffentlichkeitsarbeit hat nicht nure eine weite Akzeptanz der App ermöglicht,sondern auch ein gro \223,es Interesse an den wissenschaftlichen Arbeiten der Forschungsgruppe geweckt。Im neuen Projekt“Walddoktor”werden将发布Kommunikations战略,包括Waldsterben und Baumkrankheiten ausweiten und die Möglichkeiten eines Citizen Science-Projekts zur Erfassung von Waldschäden untersuchen。

公共图书馆:

Die wichtigstenöffentlichen活动

Seit Begin des Projekts stehen wir in einem 1:1-对话mit Nutzer:innen und Interessierten beiöffentlichen Veranstaltungen,wie z.B.:

  • Wissenschaft MS博物馆
  • auf urbaner植物学展览“Krautschau”
  • zur interaktiven Ausstellung auf der回复:publica-Konferenz
  • 吕尔·莱勒的bei车间:innen
  • Wissenschaft国家图书馆
  • beim Ilmenauer Wissenschaftssommer公司
  • zur DBU“Woche der Umwelt”
  • 在einer Gemeinschaftsschule im Projekt“Wiese”

  

MASTERARBEITEN公司

Bildbasierte automatische Erkennung von Bäumen公司
Arbeit的欲望?杜·Interesse(Du Interesse),《自动舞曲》(das Thema der automatischen Artbestimung zu erhalten)中的艾因布利克(Einblicke)?Wenn Du nun noch植物学家Grundkennnisse mitbringst,bist Du bei uns genau richtig。在未上任的Masterarbeit kannst Du selbstständig einen wissenschaftlichen Bilddatensatz erstellen,und damit analysis Arbeiten durchführen,zum Beispel Bildklassifikation basierend auf Feature-Vektoren。Damit kannst Du schließlich Strategien erarbeiten,wie die bildbaseerte Artbestimung von Bäumen noch besser funktitionieren kann。回答者:Michael Rzanny博士迈尔

团队

     

 

项目

     
Flora Incognita++Bürger:innen dokumentieren Pflanzenvielfalt公司

Flora Incognita++Bürger:innen dokumentieren Pflanzenvielfalt公司

嗯den Wandel bzw。德国生物科学研究所Vielfalt sichtbar zu machen,ist Artenkenntnis der Schlüssel-nicht nur für Expert*innen,sondern für-alle Menschen。Wir haben die App“Flora Incognita”entwicket,die mit Hilfe moderner Bildverabeitungstechniken wie tiefen neuronalen Netzen und einem“连接数据”-Ansatz Standortinformationen(z.B.Phänologie,Standort,Datum und Uhrzeit)und morphologische Merkmale von Pflanzen zur halbautomatischen Artenbestimung nutzt。Die gesammelten Daten dienen dem监测von Pflanzenarten und der Phänologie。 
Die App wurde 2018 veröffentlicht und wurde bis 2022失去了500万马尔亨特拉丹。Sie ist kostenlos für先生网间网操作系统和imGoogle Play商店埃尔塔利希。Weitere Informationonen发现Sie auf derFlora-Incognita-网站.
NaturaIncognita-Schaffung einer工作流平台für AI-basierte Artbestimung

NaturaIncognita公司-
Schaffung einer人工智能基础工作流平台

Um dem Verlust der biologischen Vielfalt entgegenzuwirken,werden Datenüber den Stand und die Veränderung der biologistchen Viel falt für viele Lebensformen benötigt。在diesem“KI-Leuchtturmprojekt”sollen die best henned Rahmenbedingen für die automatisete Artbestimung des Projekts“Flora Incognita”erweitert werden,um eine automatische Bestimmung für-andere Artengruppen zu ermöglichen。
Die Workflow-Plattform des Projekts wird einen Service zur Artbestimmung anbieten,der auf den neuesten Methoden des maschinellen Lernens basiert工程流程平台。Zu den Pilotprojekten gehören bereits浮游植物、Schmetterlinge和Pilze。
生物多样性领域的KI4Bidiv-Künstliche Intelligenz

KI4Biodiv-生物多样性领域的Künstliche Intelligentz

在diesem Projekt geht es darum,verschiedene Benchmark-Datensätze zu erstellen,Trainingsalgorithmen für die automatische Artbestimmung weiterzuentwicketln,die Ergebnisse zu interpretieren und kontextbezogene Informationonen In den Erkennung sprozess einzubesiehen。

我是Bereich des Arten-und Bestandsmonitorings werden Trainings algorithmen und Netzwerkarchitekturen speziell für Fernerkundungsdaten angewendet und weiterentwicket。

我是Bereich der Modellierung werden KI-basierte Modelle entwicket,die sowohl den räumlichen als auch den zeitlichen Kontext auf verschiedenen Skalen berücksichtigen。
更好的杂草

更好的杂草

Ziel des Projekts ist die Entwicklung eines Rahmens für nachhaltiges Unkrautmanagement durch autonome Unkrauterkennung,KI-gestützte Bestimmung von Unkrautirten und geocreferencerte Unkraoutvertilungskarten,die standortspezifischen Merkmale des jeiligen Feldes berücksichtigen。Auf der Grundlage dieser Karten werden管理战略。
 
     

维希蒂格·普布利卡蒂翁

蔡司理工学院(25)

1
Zeitschriftenartikel公司
Tristan Nauber、Ladislav Hodać、Jana Wäldchen和Patrick Mäder,“模拟树木分支结构生长的生物假设参数化”,《树木生理学》(2024).
2
Zeitschriftenartikel公司
Michael Rzanny、Patrick Mäder、Hans Christian Wittich、David Boho和Jana Wäldchen,“机会主义植物观测揭示了物候的时空梯度,”npj生物多样性, 5 (2024).
三。
Zeitschriftenartikel公司
Anke Bebber和Jana Wäldchen,“Flora Incognita–mehr als Pfanzenbestimmung”,《未上任的Zeit中的生物制品》54(1), 29-31 (2024).
4
Zeitschriftenartikel公司
约翰·保罗·布拉迪肯(John Paul Bradican)、萨尔瓦多·托马塞洛(Salvatore Tomasello)、弗朗西斯科·博斯库蒂(Francesco Boscutti)、凯文·卡布斯坦(Kevin Karbstein)和埃尔维拉·霍兰德(Elvira Hörand),“黑毛茛物种复合体中南欧分类群的系统基因组学:苹果不会离树很远”,《植物》12(21), 3664 (2023).
5
Zeitschriftenartikel公司
Negin Katal、Michael Rzanny、Patrick Mäder、Christine Römermann、Hans Christian Wittich、David Boho、Talie Musavi和Jana Wäldchen,“缩小差距:如何采用机会主义植物观测进行物候监测”,《植物科学前沿》14, 1150956 (2023).
6
Zeitschriftenartikel公司
Kevin Karbstein、Christine Römermann、Frank Hellwig和Kathleen Prinz,“受环境变异性影响的种群规模影响了白三叶的遗传、性状和植物表现,”生态学和进化13(8) ,e10376(2023)。
7
Zeitschriftenartikel公司
Jana Wäldchen、Hans-Christian Wittich、Michael Rzanny、Alice Fritz和Patrick Mäder,“迈向更有效的识别钥匙:人们识别植物物种特征的研究”,《人与自然》4(6), 1603-1615 (2022).
8
Zeitschriftenartikel公司
罗尔·范·克林克(Roel van Klink)、汤姆·奥古斯特(Tom August)、伊夫·巴斯(Yves Bas)、保罗·博德斯海姆(Paul Bodesheim)、阿莱塔·波恩(Aletta Bonn)、弗罗德·福瑟伊(Frode Fossöy)、托克·霍耶(Toke T.Höye)、埃尔克·琼杰恩斯(Eelke Jongejans)、迈尔斯·H.M.门茨(Myles H.M.Menz)、安德烈亚·米拉尔多(Andrea Miraldo)、托马斯·罗斯林(Tomas Roslin)、海伦·罗伊(Helen E.Roy)、艾伦内乌斯·鲁钦斯基(Ireneusz。Bowler,“新兴技术革新了昆虫生态学和监测”,《生态学和进化趋势》37(10), 872-885 (2022).
9
Zeitschriftenartikel公司
Kevin Karbstein、Salvatore Tomasello、Ladislav Hodac、Natascha Wagner、Pia Marinček、Birthe Hilkka Barke、Claudia Paetzold和Elvira Hörandl,“解开Gordian结:利用大毛茛物种复合体的基因组数据解开网状多倍体植物进化”,新植物学家235(5), 2081-2098 (2022).
10
Zeitschriftenartikel公司
Negin Katal、Michael Rzanny、Patrick Mäder和Jana Wäldchen,“植物物候学研究的深度学习:系统文献综述”,《植物科学前沿》13, 805738 (2022).
11
Zeitschriftenartikel公司
Bernhard Schmid、Martin Schmitz、Michael Rzanny、Michael Scherer-Lorenzen、Peter N.Mwangi、Wolfgang W.Weisser、Andrew Hector、Roland Schmid和Dan F.B.Flynn,“在生物多样性实验中移除从属物种以模拟观测现场研究”,草地研究1(1), 53-62 (2022).
12
Zeitschriftenartikel公司
Michael Rzanny、Hans Christian Wittich、Patrick Mäder、Alice Deggelmann、David Boho和Jana Wäldchen,“31种禾本科植物的基于图像的自动识别:最相关的观点”,植物科学前沿12, 804140 (2022).
13
德国蔡司理工学院
Jaak Pärtel、Meelis Pártel和Jana Wäldchen,“植物图像识别应用程序在北欧证明了高精度”,AOB PLANTS13(4) ,plab050(2021)。
14
Zeitschriftenartikel公司
Patrick Mäder、David Boho、Michael Rzanny、Marco Seeland、Hans Christian Wittich、Alice Deggelmann和Jana Wäldchen,“The Flora Incognita app–interactive plant specification identification”,生态学和进化方法12(7), 1335-1342 (2021).
15
Zeitschriftenartikel公司
David Boho、Michael Rzanny、Jana Wäldchen、Fabian Nitsche、Alice Deggelmann、Hans-Cristian Wittich、Marco Seeland和Patrick Mäder,“植物区系捕获:收集结构化植物观察的公民科学应用”,BMC生物信息学21, 576 (2020).
16
Zeitschriftenartikel公司
Michael Rzanny、Patrick Mäder、Alice Deggelmann、Minqian Chen和Jana Wäldchen,“花、叶或两者?如何获得合适的图像用于自动植物识别”,《植物方法》15, 77 (2019).
17
Zeitschriftenartikel公司
Marco Seeland、Michael Rzanny、David Boho、Jana Wäldchen和Patrick Mäder,“训练和未训练植物物种的植物属和科的基于图像的分类”,BMC生物信息学20, 4 (2019).
18
Zeitschriftenartikel公司
Susanne Dunker、David Boho、Jana Wäldchen和Patrick Mäder,“结合高通量成像流式细胞术和深度学习,以高效物种和浮游植物生命周期阶段鉴定”,BMC生态学18, 51 (2018).
19
Zeitschriftenartikel公司
Jana Wäldchen和Patrick Mäder,“基于图像的物种识别的机器学习”,《生态学与进化方法》9(11), 2216-2225 (2018).
20
Zeitschriftenartikel公司
Hans Christian Wittich、Marco Seeland、Jana Wäldchen、Michael Rzanny和Patrick Mäder,“推荐植物分类群以支持现场物种鉴定”,BMC生物信息学19, 190 (2018).
21
Zeitschriftenartikel公司
Jana Wäldchen、Michael Rzanny、Marco Seeland和Patrick Mäder,“自动植物物种识别——趋势和未来方向”,《公共科学图书馆·计算生物学》14(4) ,e1005993(2018)。
22
Zeitschriftenartikel公司
Jana Wäldchen和Patrick Mäder,“利用计算机视觉识别植物物种:系统文献综述”,《工程计算方法档案》25(2), 507-543 (2018).
23
Zeitschriftenartikel公司
Michael Rzanny、Marco Seeland、Jana Wäldchen和Patrick Mäder,“为自动植物识别获取和预处理叶片图像:理解努力和信息获取之间的权衡”,植物方法13, 97 (2017).
24
Zeitschriftenartikel公司
Marco Seeland、Michael Rzanny、Nedal Alaqraa、Jana Wäldchen和Patrick Mäder,“利用花卉图像进行植物物种分类——局部特征表示的比较研究”,PLoS One12(2) ,e0170629(2017)。
25
Zeitschriftenartikel公司
Jana Wäldchen、Angelika Thuille、Marco Seeland、Michael Rzanny、Ernst Detlef Schulze、David Boho、Nedal Alaqraa、Martin Hofmann和Patrick Mäder,“Flora Incognita–Halbautomatische Bestimmung der Pflanzenarten Thüringens mit-dem Smartphone”,图林根的Landschaftspflege und Naturschutz53(3), 121-125 (2016).

Konferenzbeitra(1)

26
Konferenzbeitra公司
Marco Seeland、Michael Rzanny、Nedal Alaqraa、Angelika Thuille、David Boho、Jana Wäldchen和Patrick Mäder,“基于图像的植物物种分类的花颜色描述”,见第22届德国色彩研讨会(FWS),德国伊勒梅瑙由K.-H.Franke(2016)编辑,第145-154页。

Hochschulschrift-硕士(1)

27
Hochschulschrift-大师
Viktoriya Demchyk,Darstellung von Biodiversität in Social Media anhand des Praxisbeispiels der Pflanzenbestimmungsap《植物的识别》,耶拿弗里德里希·席勒大学硕士论文,2023年。
苏尔Redakteursanscht