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PhysChem套件日志P(P)

分配系数计算

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日志P(P)概述

从化学结构预测辛醇-水分配系数

ACD/日志P(P)从结构上预测分配系数,这是疏水性的一种度量。

使用ACD/LogP(P)收件人:

  • 计算分配系数(logP(P))对于中性分子
  • 识别结构的亲水性和疏水性碎片
  • 用实验测量训练算法
优点

日志中需要的所有内容P(P)属性计算器

准确可靠的结果

  • 通过可靠性指数、数据库中类似结构的显示以及原始实验数据的文献参考,轻松评估结果的准确性
  • 利用广泛培训数据库中的知识(>12000个化合物)

更深入的见解

  • 轻松创建散点图、浏览、筛选、排序、排序和优先排序复合库

3日志P(P)一机多用计算器

  • 一个软件应用程序中三种算法的结果:Classic、GALAS和Consensus

可使用内部数据进行自定义

  • 从商业产品中获得内部模型的准确性。使用实验测量的日志P(P)将适用领域扩展到专有化学空间的价值观。
  • 为每个项目构建一个训练集,以实现微调的准确性

根据化学结构计算辛醇-水分配系数(logP)

类似结构见实验值。

从三种预测算法中选择。经典算法提供了计算协议

它的工作原理

使用日志以秒为单位进行预测P(P)

请求咨询或演示

  • 1绘制/导入结构
  • 2审查结果并作出决定
  • 报告为PDF或复制/粘贴
产品特点

分配系数(对数P(P))计算器功能

  • 预测日志P(P)从结构(在应用程序中绘制,或从第三方绘图包复制/粘贴);SMILES字符串;InChI代码;导入的MOL、SK2、SKC或CDX文件;或在内置词典中按名称搜索
  • 三种预测算法:经典(默认计算器)、GALAS(全局,根据相似性进行局部调整)和共识日志P(P)基于其他两个模型。
    了解算法
  • 不同模型中预测精度的估计。
    • 经典
      • 最终日志95%置信区间的结果P(P)价值和增量贡献
      • 内部培训库中提供的化合物的所有可用实验数据和文献参考
    • 加拉斯
      • 可靠性指标
      • 在训练库中显示5个最相似的结构,并提供实验值和文献参考
    • 共识

      • 在训练库中显示5个最相似的结构,并提供实验值和文献参考

  • 详细的计算协议列出了所有起作用的官能团、碳原子以及通过脂肪族、芳香族和乙烯基系统的相互作用(经典)
    • 单击协议条目以突出显示结构上的相应实体
  • 分子的颜色高亮显示,以突出亲水/疏水亚结构(GALAS)
  • 计算日志P(P)属性,并使用内置工具对结果进行排序、筛选、绘图和排序。
    • 设置用户定义的标签颜色
    • 以数字方式过滤结果
    • 按升序/降序值对结果进行排序
  • 查看历史中先前计算值的结果
  • 将结果报告到PDF
  • 下载日志的QPRF和QMRF文档P(P)(加拉斯)
  • 用实验值训练模型,以改进对专有化学空间的预测
    • 创建并选择不同的训练库进行计算,或切换到内置算法
部署/集成选项

选择适合您的部署选项

桌面/厚客户端

安装ACD/日志P(P)在个人计算机上访问胖客户端,它提供了完整的图形用户界面和访问算法训练工具。

批次

计算日志P(P)在用户干预最少的情况下,对成千上万个化合物进行测试。批量部署与Microsoft Windows和Linux兼容。插入公司内部网或工作流工具,如Pipeline Pilot。

Percepta Portal/瘦客户端

使用基于浏览器的应用程序预测日志P(P).KNIME集成组件可用。在企业内部网或云上托管。适用于Linux和Windows操作系统。

使用日志的更多原因P(P)

分配系数预测测井技术信息P(P)

可训练日志P(P)计算器

您可以使用实验测量的日志P(P)用于在ACD/Log中训练算法的值P(P)提高预测准确性,并使模型与您的化学空间或项目更加相关。

即使你不是计算化学家或软件工程师,也可以训练经典算法和GALAS算法。共识模型自动使用应用于底层算法的训练数据。

日志是如何生成的P(P)计算值?

经典算法

基于>12000个实验日志P(P)值,经典算法使用了隔离碳的原理。

GALAS算法

GALAS模型是全局的,根据相似性进行局部调整。该算法基于超过11000个化合物的训练集,并为log提供值D类这是根据最相似化合物的数据进行调整的。

共识模型

共识模型使用经典算法和GALAS算法。每种算法在其执行最可靠的化学空间区域中权重更大。

计算日志时P(P)比实验更准确

预测日志P(P)在以下情况下,可能比实验测量更准确:

  • 日志P(P)该值超出了通过传统实验获得的可靠测量范围(+8到-3)。
  • 互变异构体存在。在大多数情况下,日志P(P)不能测量每个互变异构体的值。
  • 化合物包含酸性和碱性基团(例如,氨基酸、肽、核苷)。由于这些分子在任何给定的pH值下以各种离子形式存在,未电离形式的浓度可以忽略不计。

日志的一般信息P(P)

分配系数是多少?

分配常数(P(P))是衡量中性(不带电)分子的亲水性(“亲水”)或疏水性(“怕水”)的一个尺度。它表示化合物在这两个不互溶相(通常是辛醇和水)中不同溶解的趋势。分配系数也称为K现在辛醇/水分配系数。

日志P(P)预测模型将该值估计为对数比(logP(P),堵塞P(P),或AlogP(P)). 分配系数是化合物疏水性的定量描述。

日志之间的区别是什么P(P)和日志D类?

类似于日志P(P)(或堵塞P(P)),日志D类也是疏水性的描述符,但它不仅限于描述中性分子。日志D类是考虑到pH依赖性的电离化合物疏水性的度量。

日志是如何生成的P(P)研发中使用的价值观?

疏水性(由对数确定P(P))可以帮助解释或预测化合物的行为,并在许多行业中有用:

药物-日志P(P)帮助药物化学家评估药物相似性。在药代动力学中,它可以帮助确定ADME概况——药物的吸收能力、成功达到预期目标、代谢和排泄能力;并在药效学中了解靶受体结合。

农药-K现在这些值用于帮助开发除草剂和杀虫剂。分区值有助于确定化合物是否会到达其预期作用部位以及环境污染的可能性。

环境分配系数用于模拟土壤和地下水中溶解的疏水性有机物的迁移,以帮助评估水道污染以及对动物和水生生物的毒性。

消费品——在化妆品、染料、家用清洁剂和许多其他产品的配方中使用了对分区的理解。

 

新增功能!

日志中的新增内容P(P)2022版

  • pH选择器工具,帮助您选择色谱分离的最佳pH值
  • 能够将训练库导入所有主要文件类型的PhysChem Suite
  • 简化的“上下文帮助”