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主页>SCOP层次结构>谷氨酰胺合成酶,N-末端结构域>TaxViz-谷氨酰胺合成酶,所有王国中的N末端结构域
TaxViz显示了跨主要分类王国的域分布,以及每个王国中的生物体。
每个节点代表单个分类群或有机体的特征。节点分层排列在同心环中。位于中心的父分类单元递归地向外指向其子分类单元。这个圆的大小表示在给定的分类群。对于单个生物体,它给出了域的实际数量。
每个节点代表单个分类群或有机体的特征。节点分层排列在同心环中。位于中心的父分类单元递归地向外指向其子分类单元。分类群的名称和每个有机体的平均域数显示在分类节点旁边。 分类群 节点有5种类型:总体、域、王国、子王国和物种。“总体”节点显示生命树中每个生物体的平均域数。整体节点由三个“域”(或超王国)节点包围:真核生物、细菌和古生菌。域节点被“王国”节点包围,例如真核生物王国的后生动物。最大的王国(就完全测序的生物体而言)包含“亚王国”节点。最大的王国包括后生动物、巨齿目、蛋白菌、放线菌和硬脊菌。剩下的王国和次王国包含“物种”节点。请注意,物种节点不包括我们分类为菌株的任何生物体。一个例子可能有助于说明分类群的层次结构。这个智人(人类)物种存在于哺乳动物亚王国、后生动物王国和真核生物领域。 导航 通过选择外部分类群节点,可以查看分类群中的有机体。有机体的名称以及有机体中包含该结构域的蛋白质数量显示在有机体节点旁边。从这里,您可以通过单击有机体节点来查看每个有机体的域分配详细信息。 最小/最大域出现次数 通过选择最小或最大节点,您还可以分别查看域数最少和最多的生物体。最小/最大域出现率始终适用于所有生物体。 模型生物 模型生物链接显示了遗传研究中经常使用的选定模型生物。 节点大小 在不同的分类群中,域的出现经常有很大的差异。为了同时显示大型和小型节点,有必要对节点大小使用对数刻度。对于分类群,节点半径等于分类群中每个有机体的平均结构域出现次数的对数。对于生物体,节点半径等于生物体中域数的对数。有一个例外。当平均结构域出现次数或生物体中结构域的数量等于1时,半径设置为对数2的一半。 节点颜色 节点的颜色代表它所属的超级王国,并在图形的图例中详细说明。