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提出了一种用于蛋白质二级结构描述和分析的粗粒度几何模型,该模型仅使用C的位置α原子。通过分段多项式插值构造了一条连接这些位置的空间曲线,蛋白质骨架的折叠由连续C处连接Frenet框架的一系列螺旋运动来描述α位置。使用SCOPe蛋白质结构数据库的ASTRAL子集,导出二级结构元件的螺旋参数阈值,并证明后者可以在Cα模型。为此,与广泛使用的决策支持计划(定义蛋白质的二级结构)计算结果表明,与所有纯C的系综相对应的参数分布αRCSB蛋白质数据库中的结构与ASTRAL数据库中的相匹配。预计该方法将有助于开发低分辨率数据的结构重新定义技术。

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用于Chimera可视化的1a6g三维管模型。

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用于Chimera可视化的2k4t三维管模型。


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