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在标题复合体中,[CuI(C9H(H)20N个2S)]·0.6小时2O、 铜I原子位于三重旋转轴上。部分被占据的水分子在反转中心被扰乱。每个Cu中心与三个S原子结合N个,N个′-二丁基硫脲配体和I在扭曲的四面体环境中。北半球...I和C-H...在复合分子中观察到相互作用。分子间N-H...S氢键将分子连接成平行于ab公司平面。

支持信息

到岸价

晶体学信息文件(CIF)https://doi.org/10.1107/S16053687044649/ci2443sup1.cif
包含全局数据块,I

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CCDC参考:663610

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • T型=100 K
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.009º
  • 氢原子完整性99%
  • 溶剂或反离子紊乱
  • R(右)系数=0.062
  • 水风险系数=0.173
  • 数据与参数之比=30.3

检查CIF/PLATON结果

未发现语法错误
警报级别C 板041_警报_1_C计算和重复求和公式字符串不同?平台042_警报_1_C计算和代表MoietyFormula字符串不同?PLAT068_ALERT_1_C板报告的F000与计算值不同(或缺失)?PLAT077_警报_4_C单元包含非整数原子数?PLAT094_警报_2_C最大/最小残余密度比。。。。2.24平台220_警报2_C大型非溶剂C Ueq(最大)/Ueq。。。3.13比率平台222_警报3_C大非溶剂H Ueq(最大)/Ueq。。。3.11比率PLAT302_警报_4_C阴离子/溶剂紊乱。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。60.00百分比。平台342_警报_3_CC-C债券的低债券精度(x 1000)Ang。。。9
警报级别G 表格01_ LERT_2_GThere is a discrepancy between the atom counts in the_chemical_formula_sum和来自atom_site*数据的公式。来自化学公式的原子数:C27 H61.2 Cu1 I1 N6 O0.6 S3来自_Atom_site数据的原子数:C27 H60 Cu1 I1 N6 O0.6 S3牢房Z01_警报_1_G检测到公式和atom_site内容之间的差异。牢房Z01_警报_1_G警告:原子站点列表中缺少H原子。这是故意的吗?来自CIF:_cell_formula_units_Z 2来自CIF:_化学formula_sum C27 H61.20 Cu I N6 O0.60 S3测试:比较公式和atom_site数据的单元格内容原子Z*公式cif位置差异C 54.00 54.00 0.00元高122.40 120.00 2.40铜2.00 2.00 0.00I 2.00 2.00 0.00N 12.00 12.00 0.00号O 1.20 1.20 0.00S 6.00 6.00 0.00美元
0A级警报=一般情况:严重问题0B级警报=潜在的严重问题9C级警报=检查并解释G级警报=一般警报;检查5警报类型1 CIF结构/语法错误,数据不一致或缺失3警报类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器2警报类型3结构质量可能较低的指示器2警报类型4改进、方法、查询或建议0警报类型5信息性消息,检查

注释顶部

几种硫脲及其铜(I)配合物的晶体结构衍生品已被报道(埃勒等。, 1977; 斯托克et(等)阿尔。,1996年;Girling&Amma,1971年;阿特金森等。, 1985; 杜布勒&Bensch,1986)。它们表明,各种化学计量和结构这些络合物存在多样性,铜硫比在一定范围内从1:4起,如单体[Cu(tu)4(SiF6)0.5](狩猎等。, 1979)至1:1.5,四聚物[Cu4(tu)6(否)4].4小时2O(格里菲斯et(等)阿尔。, 1976). 我们有兴趣了解具有硫脲取代基性质的此类配合物的几何构型其他配位配体的强度和大小。以前,我们有报道了四合一的(N个-甲基硫脲-κS公司)碘化铜(I)(Mufakkaret(等)阿尔。, 2007). 现在我们报告标题复合物的晶体结构。

在标题络合物的分子中,原子Cu1和I1位于三重旋转轴和非对称单元因此包含三分之一的复合分子(图1)。非对称单元还包含部分被占据的水分子,在反转中心无序排列。这个Cu1的配位是一个扭曲的四面体,由S配位三个原子N个,N个带S-Cu-S的'-二丁基硫脲配体角度99.32(4)°(表1)。这些角度小于观察到的角度在相关结构中(Bombicz等。, 2004; 洛巴纳等。,2006; 穆法卡等。, 2007). 然而,Cu-S键距离[2.3543(12)Å]的标题复合物在四面体几何复合体(Bombicz等。, 2004;洛巴纳等。, 2006; 穆法卡等。, 2007). 第四个铜的配位被I1原子占据,Cu1-I1距离为2.6251(10)°和S-Cu-I角为118.34(3)°。之间的二面角S1/N1/N2/C1/C2/C6/C7和C2/C3/C4/C5的平均平面为80.2(6)°。全部其他键的长度和角度在正常范围内(艾伦等。,1987).

I原子参与分子内N-H··I氢键和S原子形成弱的C-H··S分子内相互作用(图1)。分子间的N-H··S氢键稳定晶体结构(表2)。晶体堆积(图2),分子排列成二维网络与ab公司飞机。

相关文献顶部

有关键长值的相关文献,请参见:Allen等。(1987). 有关相关结构,请参见:Bombicz等。(2004); 洛巴纳等。(2006); 穆法卡等。(2007). 有关的相关文献铜的配位化学,参见:阿特金森等。(1985);邦比茨等。(2004); Dubler&Bensch(1986);埃勒等。(1977); Girling&Amma(1971);格里菲斯等。(1976); 亨特et(等)阿尔。(1979); Kaim&Schwederski(1994);洛巴纳等。(2006);斯托克等。(1996).

实验顶部

在碘化铜(I)(0.19 g,1.0 mmol)与乙腈(15 ml)的溶液中加入2摩尔当量的N个,N个'-二丁基硫脲乙腈(10 ml)。将混合物搅拌半小时。A清除得到了溶液。通过缓慢蒸发浓缩溶液室温下制备标题化合物无色单晶适用于x个-几天后进行射线结构测定。

精炼顶部

所有氢原子都被几何定位并允许骑在它们的母原子上原子,N-H=0.86 Au,C-H=0.96或0.97 Au。这个U型国际标准化组织值被限制为1.5U型等式甲基H的载体原子原子和1.2U型等式对于剩余的H原子。旋转群模型用于甲基。部分占据的H原子无序水分子无法定位。最高残余峰为距离I1 1.03°,最深的孔距离I1 0.80°。

结构描述顶部

几种硫脲及其铜(I)配合物的晶体结构衍生产品已被报道(埃勒等。, 1977; 斯托克et(等)阿尔。, 1996; Girling&Amma,1971年;阿特金森等。, 1985; 杜布勒&Bensch,1986)。它们表明,各种化学计量和结构这些络合物存在多样性,铜硫比在一定范围内从1:4起,如单体[Cu(tu)4(SiF6)0.5](狩猎等。, 1979)至1:1.5,四聚物[Cu4(tu)6(否)4].4小时2O(格里菲斯et(等)阿尔。, 1976). 我们有兴趣了解具有硫脲取代基性质的此类配合物的几何构型其他配位配体的强度和大小。以前,我们有报道了四基色的(N个-甲基硫脲-κS公司)碘化铜(I)(Mufakkaret(等)阿尔。, 2007). 现在我们报告标题复合物的晶体结构。

在标题络合物的分子中,原子Cu1和I1位于三重旋转轴和非对称单元因此包含三分之一的复合分子(图1)。非对称单元还包含部分被占据的水分子,在反转中心无序排列。这个Cu1的配位是一个扭曲的四面体,由S配位三个原子N个,N个带S-Cu-S的'-二丁基硫脲配体角度99.32(4)°(表1)。这些角度小于观察到的角度在相关结构中(Bombicz等。, 2004; 洛巴纳等。,2006; 穆法卡尔等。, 2007). 然而,Cu-S键距离标题复合体的[2.3543(12)Au]位于四面体几何复合体(Bombicz等。, 2004;洛巴纳等。, 2006; 穆法卡等。, 2007). 第四个铜的配位被I1原子占据,Cu1-I1距离为2.6251(10)°和S-Cu-I角为118.34(3)°。之间的二面角S1/N1/N2/C1/C2/C6/C7和C2/C3/C4/C5的平均平面为80.2(6)°。全部其他键的长度和角度在正常范围内(艾伦等。,1987).

I原子参与分子内N-H··I氢键和S原子形成弱的C-H··S分子内相互作用(图1)。分子间的N-H··S氢键稳定晶体结构(表2)。晶体堆积(图2),分子排列成二维网络与ab公司平面。

有关键长值的相关文献,请参见:Allen等。(1987). 有关相关结构,请参见:Bombicz等。(2004); 洛巴纳等。(2006); 穆法卡等。(2007). 有关的相关文献铜的配位化学,参见:阿特金森等。(1985);邦比茨等。(2004); Dubler&Bensch(1986);埃勒等。(1977); Girling&Amma(1971);格里菲斯等。(1976); 亨特et(等)阿尔。(1979); Kaim&Schwederski(1994);洛巴纳等。(2006);股票持有人等。(1996).

计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2005);单元格细化:4月2日(布鲁克,2005);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2005);用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,1998年);用于优化结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,1998年);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,1998年);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(斯佩克,2003)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的结构,显示50%的概率位移椭球体和原子编号。为了清楚起见,只有N绑定的H原子和那些涉及弱C-H··S相互作用的原子(虚线)是展示。对称代码:(i)-x个++1, -x个+ 1,z(z)(ii)-+ 1,x个-,z(z)
[图2] 图2。标题化合物的晶体堆积,沿c(c)轴。氢键显示为虚线。
碘化钾(N个,N个’-二丁基硫脲-κS公司)铜(I)0.6-水合物顶部
水晶数据 顶部
[铜(C9H(H)20N个2S)一] ·0.6(高2O)D类x个=1.396毫克
M(M)第页= 766.24K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
三角,P(P)3632次反射的细胞参数
大厅符号:-P 3θ= 1.7–30.4°
= 13.5514 (3) ŵ=1.65毫米1
c(c)= 11.4588 (6) ÅT型=100 K
= 1822.38 (11) Å板,无色
Z轴= 20.48×0.27×0.10毫米
F类(000) = 800
数据收集 顶部
Bruker SMART APEXII CCD区域探测器
衍射仪
3632个独立反射
辐射源:精细聚焦密封管2454次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数=0.090
探测器分辨率:8.33像素mm-1θ最大值= 30.4°,θ最小值= 1.7°
ω扫描小时=1918
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2005年)
k个=1818
T型最小值= 0.508,T型最大值= 0.851=1515
21130次测量反射
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.062氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.173受约束的氢原子参数
S公司= 1.05 w个= 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.0894P(P))2+ 1.4942P(P)]
哪里P(P)= (F类o(o)2+ 2F类c(c)2)/3个
3632次反射(Δ/σ)最大值= 0.001
120个参数Δρ最大值=2.54埃
0个约束Δρ最小值=1.13埃
水晶数据 顶部
[铜(C9H(H)20N个2S)一] ·0.6(高2O)Z轴= 2
M(M)第页=766.24K(K)α辐射
三角,P(P)µ=1.65毫米1
= 13.5514 (3) ÅT型=100 K
c(c)= 11.4588 (6) Å0.48×0.27×0.10毫米
= 1822.38 (11) Å
数据收集 顶部
Bruker SMART APEXII CCD区域探测器
衍射仪
3632个独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2005年)
2454次反射> 2σ()
T型最小值= 0.508,T型最大值= 0.851R(右)整数= 0.090
21130次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0620个约束
水风险(F类2) = 0.173受约束的氢原子参数
S公司= 1.05Δρ最大值=2.54埃
3632次反射Δρ最小值=1.13埃
120个参数
特殊细节 顶部

实验.低温数据是用牛津Cyrosystem眼镜蛇收集的低温附着。

几何图形所有的e.s.d.(除了两个l.s.平面之间的二面角中的e.s.d.)使用全协方差矩阵进行估计在估计距离、角度的e.s.d.时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.完善F类2对抗所有反射。加权的R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,带有F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt)并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类、和R(右)-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式开路特性。(<1)
I1类0.66670.33330.71844 (4)0.02975 (18)
铜10.66670.33330.94753 (8)0.0274 (2)
S1(第一阶段)0.70138 (9)0.50061 (9)1.04506 (9)0.0267 (3)
N1型0.6251 (4)0.6474(3)1.0253 (3)0.0312 (9)
上半年0.60350.68510.98240.037*
氮气0.6362 (4)0.5666 (3)0.8559 (3)0.0317 (9)
氢气0.65470.52270.81970.038*
C1类0.6508 (4)0.5764 (4)0.9706 (4)0.0247 (9)
指挥与控制0.6302 (5)0.6675 (5)1.1508 (4)0.0433 (13)
过氧化氢0.63340.60611.19090.052*
过氧化氢0.56080.66591.17510.052*
C3类0.7295 (5)0.7776 (5)1.1870 (5)0.0484 (14)
H3A型0.73370.83831.13860.058*
H3B型0.79900.77481.17550.058*
补体第四成份0.7200 (6)0.8035 (6)1.3162 (5)0.0582 (17)
H4A型0.64770.80051.32860.070*
H4B型0.72110.74541.36470.070*
C5级0.8158 (7)0.9192 (7)1.3530 (6)0.077 (2)
H5A型0.80210.93561.43090.115*
H5B型0.81960.97631.30060.115*
H5C型0.88660.91921.35090.115*
C6级0.5907(5)0.6256(4)0.7868 (4)0.0337 (11)
H6A型0.64130.70720.79370.040*
H6B型0.51700.60780.81790.040*
抄送70.5777 (6)0.5925 (5)0.6594 (5)0.0478 (14)
H7A型0.53420.51010.65270.057*
H7B型0.65240.61820.62580.057*
抄送80.5178 (7)0.6442 (5)0.5911 (5)0.0553 (16)
H8A型0.51010.61960.51050.066*
H8B型0.44170.61480.62260.066*
C9级0.5787 (7)0.7727 (6)0.5941 (6)0.071 (2)
上午9点0.54320.79950.54010.106*
H9B型0.65710.80260.57280.106*
H9C型0.57460.79770.67140.106*
O1瓦000.042 (7)0.31 (4)0.60
原子位移参数(Å2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
I1类0.0312 (2)0.0312 (2)0.0267 (3)0.01562 (11)00
铜10.0270 (3)0.0270 (3)0.0283 (5)0.01350 (17)00
S1(第一阶段)0.0267 (6)0.0264(6)0.0275 (5)0.0137 (5)0.0003 (4)0.0003 (4)
N1型0.041 (2)0.033 (2)0.0266 (19)0.0237 (19)0.0042 (16)0.0031 (16)
氮气0.044 (2)0.034 (2)0.0259 (19)0.026 (2)0.0012 (17)0.0026 (16)
C1类0.020 (2)0.024 (2)0.028 (2)0.0097 (17)0.0004 (16)0.0002 (17)
指挥与控制0.060 (4)0.044 (3)0.035(3)0.032 (3)0.011 (2)0.010 (2)
C3类0.053 (4)0.043 (3)0.050 (3)0.025 (3)0.004 (3)0.003 (3)
补体第四成份0.066(4)0.057 (4)0.042 (3)0.024(3)0.006 (3)0.009(3)
C5级0.085 (6)0.075 (5)0.049 (4)0.024 (4)0.020 (4)0.022 (4)
C6级0.047(3)0.034 (3)0.027 (2)0.026 (2)0.001 (2)0.0024 (19)
抄送70.073 (4)0.051 (3)0.035(3)0.042 (3)0.004 (3)0.004 (2)
抄送80.084 (5)0.057 (4)0.034 (3)0.042 (4)0.016 (3)0.005 (3)
C9级0.095 (6)0.067(5)0.058 (4)0.047 (5)0.003 (4)0.006 (3)
O1瓦0.30 (3)0.30 (3)0.32 (13)0.149 (15)00
几何参数(λ,º) 顶部
I1-铜12.6251 (10)C4-H4A型0.97
Cu1-S1型2.3543 (12)C4-H4B型0.97
Cu1-S1型2.3543 (12)C5-H5A型0.96
Cu1-S1型ii(ii)2.3543 (12)C5-H5B型0.96
S1-C1号机组1.720 (4)C5-H5C型0.96
N1-C1型1.331(5)C6至C71.513 (7)
N1-C2型1.460(6)C6-H6A型0.97
N1-H1型0.86C6-H6B型0.97
N2-C1气体1.326 (6)C7-C81.527 (8)
N2-C6气体1.462 (6)C7-H7A型0.97
N2-H2气体0.86C7-H7B基因0.97
C2-C3型1.484 (8)C8-C9型1.509 (9)
C2-H2A型0.97C8-H8A型0.97
C2-H2B型0.97C8-H8B型0.97
C3-C4型1.543 (8)C9-H9A型0.96
C3-H3A型0.97C9-H9B型0.96
C3-H3B型0.97C9-H9C型0.96
C4-C5型1.512 (9)
S1-Cu1-S1型99.32 (4)C3-C4-H4B型109.2
S1-Cu1-S1型ii(ii)99.32 (4)H4A-C4-H4B型107.9
S1(第一阶段)-Cu1-S1型ii(ii)99.32 (4)C4-C5-H5A型109.5
S1-Cu1-I1型118.34 (3)C4-C5-H5B型109.5
S1(第一阶段)-Cu1-I1型118.34 (3)H5A-C5-H5B型109.5
S1(第一阶段)ii(ii)-Cu1-I1型118.34 (3)C4-C5-H5C型109.5
C1-S1-Cu1型113.09 (15)H5A-C5-H5C型109.5
C1-N1-C2126.5 (4)H5B-C5-H5C109.5
C1-N1-H1116.8N2-C6-C7型112.2 (4)
C2-N1-H1型116.8N2-C6-H6A型109.2
C1-N2-C6124.4 (4)C7-C6-H6A型109.2
C1-N2-小时117.8N2-C6-H6B型109.2
C6-N2-H2117.8C7-C6-H6B型109.2
N2-C1-N1型117.3 (4)H6A-C6-H6B型107.9
N2-C1-S1型121.1 (3)C6-C7-C8型111.6 (5)
N1-C1-S1型121.6 (3)C6-C7-H7A型109.3
N1-C2-C3型113.4 (5)C8-C7-H7A型109.3
N1-C2-H2A型108.9C6-C7-H7B型109.3
C3-C2-H2A108.9C8-C7-H7B型109.3
N1-C2-H2B型108.9H7A-C7-H7B型108
C3-C2-H2B108.9C9-C8-C7114.1 (6)
H2A-C2-H2B型107.7C9-C8-H8A108.7
C2-C3-C4型111.1 (5)C7-C8-H8A型108.7
C2-C3-H3A型109.4C9-C8-H8B108.7
C4-C3-H3A型109.4C7-C8-H8B型108.7
C2-C3-H3B型109.4H8A-C8-H8B107.6
C4-C3-H3B型109.4C8-C9-H9A型109.5
H3A-C3-H3B型108C8-C9-H9B型109.5
C5-C4-C3型112.2 (6)H9A-C9-H9B109.5
C5-C4-H4A109.2C8-C9-H9C型109.5
C3-C4-H4A型109.2H9A-C9-H9C109.5
C5-C4-H4B109.2H9B-C9-H9C型109.5
S1(第一阶段)-铜1-S1-C1162.01 (17)Cu1-S1-C1-N1155.8 (3)
S1(第一阶段)ii(ii)-铜1-S1-C196.85 (17)C1-N1-C2-C3型104.8 (6)
I1-Cu1-S1-C132.58 (17)N1-C2-C3-C4170.6(5)
C6-N2-C1-N1型2.0 (7)C2-C3-C4-C5型175.9 (6)
C6-N2-C1-S1178.3 (4)C1-N2-C6-C7型176.8 (5)
C2-N1-C1-N2177.3 (5)N2-C6-C7-C8型173.5 (5)
C2-N1-C1-S1型3.0 (7)C6-C7-C8-C959.6 (8)
Cu1-S1-C1-N224.4 (4)
对称代码:(i)x个++1,x个+1,z(z); (ii)+1,x个,z(z)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H1··S10.862.573.347 (5)151
N2-H2···I10.862.893.735 (4)167
C2-H2型A类···S1(第一阶段)0.972.653.114 (7)110
对称代码:(iii),x个++1,z(z)+2.

实验细节

水晶数据
化学配方[铜(C9H(H)20N个2S)一] ·0.6(高2O)
M(M)第页766.24
晶体系统,空间组三角,P(P)
温度(K)100
,c(c)(Å)13.5514 (3), 11.4588 (6)
)1822.38 (11)
Z轴2
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)1.65
晶体尺寸(mm)0.48 × 0.27 × 0.10
数据收集
衍射仪布吕克智能APEXII CCD区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2005年)
T型最小值,T型最大值0.508, 0.851
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
21130、3632、2454
R(右)整数0.090
(罪θ/λ)最大值1)0.712
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.062, 0.173, 1.05
反射次数3632
参数数量120
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eÅ))2.54,1.13

计算机程序:4月2日(布鲁克,2005),圣保罗(布鲁克,2005),SHELXTL公司(谢尔德里克,1998),SHELXTL公司(斯佩克,2003)。

选定的几何参数(λ,º) 顶部
I1-铜12.6251 (10)Cu1-S1型2.3543 (12)
S1-Cu1-S1型99.32 (4)S1-Cu1-I1型118.34 (3)
对称代码:(i)x个++1,x个+1,z(z)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H1··S1ii(ii)0.862.573.347(5)151
N2-H2···I10.862.893.735 (4)167
C2-H2A··S10.972.653.114 (7)110
对称代码:(ii),x个++1,z(z)+2.
 

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