SPINE自动化X射线分析研讨会：进展报告

报道了由欧洲结构蛋白质组学协会（SPINE）组织的蛋白质晶体结构解决方案自动化研讨会的结果。

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使用最大似然残差进行大分子精制的程序描述，通过几个示例进行说明

E.J.多德森,G.N.穆尔舒多夫和A.瓦金

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自动生成用于晶体学精细化的小分子词典

R.B.润滑脂,A.瓦金和E.J.多德森

的描述微笑2DICT公司，一个用于生成小分子词典的程序微笑陈述。

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真菌水解酶的结晶和初步X射线衍射研究新乌尔米蛇造口

M.N.Isupov先生,A.A.布林德利,E.J.Hollingsworth公司,G.N.穆尔舒多夫,A.瓦金和J.A.小男孩

通过坐滴气相扩散技术，从表达于青霉素结合蛋白的重组蛋白中生长出与青霉素结合蛋白质同源的真菌水解酶晶体大肠杆菌两种晶体形式在不同的条件下生长。衍射数据已收集到2.6°和2.3°分辨率。

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评估解决方案BUMP先生和棒球

R.M.基根,F.长,V.J.法齐奥,M.D.Winn博士,G.N.穆尔舒多夫和A.瓦金

分子替换的自动化管道BUMP先生和棒球审查，重点是了解其输出。结论来自于它们在广泛试验中的表现。

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模型准备MOLREP公司以及使用X射线数据改进模型的示例

A.A.列别捷夫,A.瓦金和G.N.穆尔舒多夫

默认的模型准备方案MOLREP公司如所述。给出了利用X射线数据进行模型改进的两个示例。

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J伊甘：用于中央对手方清算所4模板约束库

A.A.列别捷夫,P.杨,M.N.Isupov先生,O.V.莫罗兹,A.瓦金和G.N.穆尔舒多夫

这个中央对手方清算所4模板-约束库定义了生物聚合物、其修饰和用于大分子结构精细化的配体的约束。J利甘德是一个图形编辑器，用于生成新配体和共价键的描述。

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孪晶中的强度统计数据（以PDB的例子为例）

A.A.列别捷夫,A.瓦金和G.N.穆尔舒多夫

使用以下简单统计数据分析2004年2月发布的蛋白质数据库R（右）潜在孪生相关反射之间的因素确定了孪生病例。仔细考虑这些因素后发现，非晶态对称性和孪晶经常同时发生，这给真晶体对称性的测定带来了严重的问题。

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棒球：分子置换管道

F.长,A.瓦金,P.杨和G.N.穆尔舒多夫

全自动管道，棒球，将重新设计的蛋白质结构层次数据库与其结构域和多聚体组织集成在一起，并仅使用输入的X射线和序列数据解决分子重定位问题。

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回收PDB：自动结构解决系统棒球

F.长,A.瓦金,P.杨和G.N.穆尔舒多夫

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REFMAC公司5用于细化大分子晶体结构

G.N.穆尔舒多夫,P.Skubaák先生,A.A.列别捷夫,N.S.潘努,R.A.斯坦纳,R.A.尼科尔斯,M.D.Winn博士,F.长和A.瓦金

高分子晶体结构精细化程序的一般原理REFMAC公司描述了5个。

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用最大似然法精化大分子结构

G.N.穆尔舒多夫,A.瓦金和E.J.多德森

对用于精细化大分子结构的似然函数进行了扩展，以包括前相信息、实验不确定性以及结构中定义明确和定义不明确部分的不同权重，从而减少精细化偏差。项目内实施的结果REFMAC公司给出了。

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利用FFT对大分子结构进行高效的各向异性细化

G.N.穆尔舒多夫,A.瓦金,A.列别捷夫,K·S·威尔逊和E.J.多德森

利用FFT对原子热参数进行各向异性细化，为大分子模型的重参数化开辟了新的前景。

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REFMAC公司5词典：先前化学知识的组织及其使用指南

A.瓦金,R.A.斯坦纳,A.A.列别捷夫,L.波特顿,S.麦克尼古拉斯,F.长和G.N.穆尔舒多夫

限制性大分子精制用单体和链节词典的组织和使用及其在程序中的应用REFMAC公司5进行了描述。

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分子替换的完全自动化

A.瓦金,F.长和G.N.穆尔舒多夫

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球平均相移函数及其在电子密度图分子和碎片搜索中的应用

A.瓦金和M.N.Isupov先生

将分子置换方法扩展到使用球平均相位平移和相位旋转函数在电子密度图中定位大分子片段。

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BLANC公司：蛋白质晶体学程序集

A.瓦金,G.N.穆尔舒多夫和B.V.斯特罗科皮托夫

BLANC公司是蛋白质晶体学软件，可用于使用各种方法（MIR、MIRAS、SIR、MR）的大分子结构溶液等。).

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真菌过氧化氢酶在2°分辨率下的结构

B.K.Vainshtein,W.R.梅利克·阿达米扬,V.V.巴雷宁,A.瓦金,A.I.格雷本科,V.V.鲍里索夫,K.S.Bartels公司,M.G.Rossmann先生和一、菲塔

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微生物鸟苷特异性核糖核酸酶的高分辨率三维结构

B.K.瓦因斯坦,A.G.帕洛夫斯基,K.M.波利亚科夫,S.N.鲍里斯诺娃,B.V.斯特罗科皮托夫和A.瓦金

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过氧化氢酶的结构活力青霉分辨率为3.0Å

B.K.Vainshtein,V.R.梅利克·阿达米扬,V.V.巴雷宁,A.瓦金和A.I.格雷本科

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