靛蓝和硫靛蓝颜料应用广泛。混合化合物一硫代靛蓝的晶体结构[系统名称:(E类)-2-(3-氧代-2,3-二氢-1-苯并噻吩-2-亚基)-2,3-双氢-1H(H)-吲哚-3-酮],C16H(H)9不2S、 通过对一个尺寸仅为1×2×10µm的晶体的微晶结构分析确定。单硫靛蓝的晶体结构与靛蓝和硫靛蓝相似。分子表现出取向紊乱,主要和次要紊乱成分的位点占据因子分别为0.962(2)和0.038(2)。靛蓝片段提供了分子间氢键,导致分子的交叉排列,类似于靛蓝中的分子排列,而硫靛蓝片段仅表现出范德瓦尔斯相互作用和分子堆积,类似于硫靛中的分子堆积。