甲戊酸二磷酸脱羧酶（MDD）（EC 4.1.1.33）通过水解三磷酸腺苷（ATP）和在甲戊酸途径的最后一步生成异戊烯基二磷酸（IPP），催化甲戊酸5-二磷酸（MVAPP）的Mg2+依赖性脱羧反应。这种酶在粪肠球菌和其他革兰氏（+）细菌中是必需的；因此，MDD蛋白是治疗细菌感染的理想药物靶点。我们研究了引起临床肠球菌感染的粪肠球菌（MDDEF）MDD的酶动力学和结构。在与ATP结合的MDDEF的晶体结构中，ATPγ-磷酸的催化不利取向意味着当MVAPP提前与活性位点结合时，MDDEF可能发生构象变化以适应ATP的结合。当MDDEF与MVAPP预结合时，使用等温滴定量热法（ITC）观察到ATPγS的解离收缩值（Kd）降低了10倍。ATPγS结合亲和力的增加表明，通过MVAPP的先决条件结合可以实现ATP与MDDEF的协同结合。事实上，用MVAPP浸泡过的MDDEF的晶体结构表明，最终应结合ATP的一个柔性环变得不灵活，并向MDDEF活性部位弯曲。因此，我们假设MVAPP与活性位点的结合会触发MDDEF的构象变化，从而导致其他底物ATP在其催化有利位置的结合。将进行进一步的实验，以研究MDDEF的底物结合机制，这些实验将在不久的将来成为特定药物开发的平台。
