主页 重新基础工具书类08/30/2024

关闭窗口后退 刷新
最新参考

REBASE参考号4548 进入1996年12月6日。。。2003年10月8日修订
卡内科,T、。,佐藤,S.中。,科塔尼,H、。,田中,答:。,阿萨咪祖,E.中。,中村,年。,宫岛,编号:。,广泽,M.、。,杉浦,M.、。,佐本,S.中。,木村,T、。,Hosouchi、,T、。,松野,答:。,穆拉基,答:。,中崎,编号:。,那罗,英国。,大村,S.中。,新波,S.中。,竹内,C.、。,瓦达,T、。,渡边,答:。,山田,M.、。,安田,M.、。,塔巴塔,美国。;
DNA研究。 3: 109-136 (1996).

单细胞蓝藻Synchocycis sp.菌株PCC6803基因组序列分析。二、。整个基因组的序列测定和潜在蛋白质编码区的分配。
相关酶。。。

摘要:
完成了集胞菌PCC6803菌株的全基因组序列测定。最终确认的基因组总长度为3573470 bp,包括之前报告的1003450 bp的序列,从基因组的64%到92%。整个序列由cosmid克隆、lambda克隆和用于填隙的长PCR产物的基于物理图的连接序列组装而成。通过对整个基因组的两条DNA链进行分析,确保了序列的准确性。通过使用组装序列数据从基因组DNA直接扩增的长PCR产物的限制性分析支持组装序列wqs的真实性。为了预测潜在的蛋白质编码区,进行了开放阅读框(ORF)分析、GeneMark程序分析和数据库相似性搜索。结果,基因组上共分配了3168个潜在蛋白基因,其中145个(4.6%)与报告基因相同,1257个(39.6%)和340个(10.8%)分别与报告基因和假设基因相似。其余1426个(45.0%)与数据库中的任何基因都没有明显的相似性。在指定的潜在蛋白质基因中,128个与参与光合反应的基因相关。潜在蛋白质基因编码序列的总和占基因组长度的87%。因此,通过添加rRNA和tRNA基因,基因组的蛋白质和RNA编码区域排列得非常紧凑。基因组基因组织的一个显著特征是,在基因组中发现了99个ORF,这些ORF与转座酶基因相似,可分为6组,其中至少26个ORF看起来完好无损。这一结果表明,在该物种建立期间和之后,基因组的重排频繁发生。


  • 搜索PubMed Central
  • 公共医学8905231