用户:Eric Martz
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分子:主题页
我为创建了一个存根 抗体 。文章后来由撰写 用户:David Canner 和其他。 禽流感神经氨酸酶、达菲和瑞沙 鞭毛,细菌 <- 弗拉盖勒姆 , 鞭毛结构 细菌鞭毛丝 细菌鞭毛钩 HIV蛋白酶的皮瓣形态 脂双层中的革兰菌素通道 流感血凝素 :我启动了一个存根; 文章稍后作者 用户:Savannah Anderson 和其他。 乳酸阻遏物 脂肪酶盖变形 主要组织相容性复合体I类 机械敏感通道:打开和关闭 包括MORPHS 膜蛋白类 金属配体多面体 硝基酪氨酸 核小体: 用户:Eric Martz/核小体 (讲座的保护页),复制到 核小体 这样其他人可以改进它。 质子通道 ,其中包括动画变形。 钙激活肉豆蔻酰开关 核糖体A位点结合帕罗霉素:一种形态 呋喃引发SARS-CoV-2蛋白S -- 蛋白质体:Featured_SEL/5 SARS-CoV-2穗蛋白融合转化 -- 蛋白质体:Featured_SEL/6 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型刺突蛋白突变 -- 蛋白质体:Featured_SEL/7 大肠杆菌DnaC解旋酶装载器的结构 (关于同源模型) SV40 Capsid简体 肽的热运动
分子:PDB代码标题页
1小时 流感血凝素 国际商会 (概述中的绿色链接)2008年作者亚哈认为生物单元是一个单体,尽管在2006年的出版物中,他们推测它是三聚体。 PDB文件将其视为单体。 第二个0 磷脂酰肌醇激酶癌基因:我创作的场景与出版物中的许多人物相似。
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关于高分子结构 高中教师资源 <- K-12教师资源 , 中学教师资源 研究小组和研究所 结构生物信息学服务器 学生项目 教学场景、教程和教育者页面 <- 本月最佳分子 , MotM公司 , Motm公司 另请参见 主题页面 -> 蛋白质体:主题页
主题页-教育
大学课堂上的收养 高中教师资源 <- K-12教师资源 , 中学教师资源 分子工作台 2016年教育工作者蛋白质3D结构资源 测验 用户:Eric Martz/抗体测验 用户:Eric Martz/抗体答案 有关MolviZ抗体教程提供的开放式问题。 组织 用户:Eric Martz/血红蛋白测验 用户:Eric Martz/MHC测验 用户:Eric Martz/MHC Answers 有关MolviZ MHC教程中提供的开放式问题。 组织 用户:Eric Martz/Ramachandran原理测验
学生项目 教学场景、教程和教育者页面 <- 本月最佳分子 , MotM公司 , Motm公司 使用蛋白质组的教学策略 技术强化科学活动 STEMEd 2010年3月6日 用户:Eric Martz/结构生物信息学简介
主题页-分子游乐场
主题页-结构生物信息学
A-B公司
关于高分子结构 AlphaFold/索引 ,关于AlphaFold的Proteopedia页面列表。 AlphaFold公司 ,介绍和概述。 来自CASP 14的AlphaFold2示例 AlphaFold,如何从序列中预测结构 备用位置 (由Wayne Decatur发起) 氨基酸 氨基酸组成 非对称单元 原子坐标文件 <- pdb文件 , PDB文件格式 主干表示 生物单元 <- 第四纪构造 生物单元:展示 埋设电荷检测
C-E公司
CASP公司 阳离子-pi相互作用 (由韦恩·迪凯特开始)
链条 <- 链 冲突 奇梅拉 保护,进化 <- 进化保护 ConSurf/索引 ConSurfDB与ConSurf CPK公司 交叉链接: 冷冻-EM 水晶触点 胱氨酸 密度贴图 二硫键 域 鼓 Eric Martz的最爱 电子冷冻显微术 电子密度图 静电势图 经验模型 表位 酯类蛋白质交联 进化保护:参见保护 极端嗜热菌
F-H(飞行高度)
Fadel A.Samatey集团 也在 日本人 收藏夹 第一眼/索引 蛋白质结构的四个层次 -- 新洛杉矶大学 自由R GDT_TS,计算 PDB文件的标题 异原子 最高冲击结构 一直以来。 组氨酸-酪氨酸蛋白质交联 高分子可视化历史 同源建模 同源建模实用指南 同源建模服务器 如何使用AlphaFold预测结构 氢键 大分子模型中的氢
I-M公司
改进发布的模型 索引页面 流感 接口分析服务器 解释ConSurf结果 内在紊乱蛋白质 主要作者 用户:Tzviya Zeev-Ben-Mordehai 介绍 异肽键 <- 异肽键 加入AlphaFold对分子一半的预测 蛋白质中的结 配体 赖氨酸-半胱氨酸NOS键 <-- 网络操作系统 消除歧义 膜蛋白类 分子建模和可视化软件 分子游乐场 分子雕塑 分子可视化,简介 莫尔菲斯 大分子构象变化<- 变形 利用MSAReveal实现多蛋白序列比对显示
北-右
硝基酪氨酸 核磁共振模型集成 <- 核磁共振 诺贝尔三维分子结构奖 非标准残留物 NOS债券 PDB识别码 <- PDB代码 , PDB代码 , pdb代码 , pdb代码 肽 (页面由Eran Hodis创建) 肽键 <- 肽键 个人收藏夹 Phi和psi角度 翻译后修改 <- 翻译后修改 , 翻译后修改 , 翻译后修改 蛋白质 <- 蛋白质 蛋白质交联 蛋白质数据库 <- PDB公司 蛋白质一级、二级、三级和四级结构 吡咯烷 重新编号PDB文件 核糖体_A_位点结合_巴龙霉素:_A_吗啡 分子模型的质量评估 R值 Ramachandran原理和φpsi角 (教程)和随附 测验 -
蛋白质体:特征EDU/1 另请参见 二面体/指数 (由Angel Herráez发起)
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引人注目的结构 重新编号PDB文件 分辨率 撤销和欺诈
S-Z型
盐桥 雕刻蛋白质构象 雕塑,分子 硒代半胱氨酸 硒代蛋氨酸 序列编号,不寻常 站点,功能 标准残留物 和 非标准残留物 结构生物信息学导论 阿卡 565.molviz.org网站 结构生物信息学服务器 结构基因组学 结构_库_生成器 结构叠加工具 对新文章的建议 叠加工具 使用蛋白质组的教学策略 温度值 <- B值 , 无序 , 温度系数 , 温度 温度值与分辨率 温度颜色方案 理论模型 <- 理论 , 理论模型 , 蛋白质体:Featured_SEL/8 硫酯蛋白交联 硫醚蛋白质交联 异常序列编号 范德华半径 可视化、分子、介绍 高分子模型中的水 世界生物分子可视化资源索引 X射线晶体学 <- X射线衍射
艺术,分子
类别:PDB_Art 艺术:细胞色素_壁纸 艺术:解构2GTL 艺术:十二足类 艺术:法贝奇鸡蛋 艺术:五个面包师跳舞 高分子可视化历史 艺术:分子插孔 艺术:分子雕塑 艺术:五角大楼花园 艺术:彩虹角 艺术:世界大战
交互式3D补充
蛋白质体中的交互式3D补体 (页面由詹姆·普里卢斯基和大卫·坎纳开始)<- I3DC公司
主题页:人物/传记
软件
焦摩尔
焦摩尔 Jmol/指数 <- 关于Jmol 关于JSmol 帮助:Jmol 帮助:JSmol Jmol/应用 Jmol/大分子可视化 Jmol/可视化膜位置 :脂质双层边界。 Jmol/空洞和隧道 Jmol/距表面深度 使用Jmol编辑Jmol/PDB文件 Jmol简介
JSmol公司
JSmol的工作原理 和 用户:Eric Martz/JSmol如何工作 . 用户:Eric Martz/JSmol Notes <----示例尺寸表 JSmol/转速 使用pspeed保持半透明,请参见 用户:Jaime_Prilusky/platformSpeed
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第一眼/索引 列出了Proteopedia和其他地方的相关资源。 第一眼进入页面 带有指向的链接 目的、利弊 和 YouTube:设计目标和简介 . 关于 Jmol简介 蛋白质交联的初步评估
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马克杯和T恤:我创造了这些产品,并在 cafepress.com/molviz4 . 新闻 (消除歧义) 蛋白质体:关于 蛋白质体:伦理写作指南 由Jaime Prilusky发起。 我添加了关于 内容属性 和 图像 . 用户:Eric Martz/Proteopedia:简介 蛋白质体:语言 蛋白质体:名称空间 蛋白质体:新闻 蛋白质体:概述 <- 蛋白质体概论 蛋白质体:策略 蛋白质体:问题 蛋白质体:剪贴簿 Proteopedia:子目录 蛋白质体:辅助材料 蛋白质体:主题页 蛋白质体:最新进展 <- 有什么新功能? , 新增功能 , 有什么新功能 , Proteopedia有什么新功能? 蛋白质体:愿望
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臭氧分解 -
2英尺/周 有用户的评论(更正),说明横幅如何提醒用户有关 讨论 选项卡。 -
蛋白质体:对已发表结构的评论
研讨会
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一天课程 为研究人员和教育工作者提供分子可视化和结构生物信息学。
主要作者或建筑师(其他地方):
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Jmol简介 ,一种通用的分子可视化工具,已被 自然 (请参见 三维视图 链接), ConSurf服务器 、和 其他期刊和结构生物信息学服务器 2005年至今。 可视化 ConSurf服务器 由尼尔·本·塔尔(Nir Ben-Tal)、费比安·格拉泽(Fabian Glaser)、埃拉娜·埃雷斯(Elana Erez)和其他人开发的全自动氨基酸着色系统。 2002年至今。 -
面向我们其他人的五大3D分子可视化技术 页可用,2007年至今。 -
莫尔维兹。 组织 为教育工作者和学生提供Jmol教程和分子可视化资源。 包括一个 DNA结构教程 始于1996年,现在(与 安吉尔·埃尔雷斯(Angel Herráez) )有5种语言可供选择。 -
世界生物分子可视化资源索引 2000年至2012年提供。 -
大分子图谱 。2002年至今。 使用 詹姆·普里卢斯基 ,的 PDB精简版 为学生和初学者提供搜索界面,以查找已发布的大分子模型。 1998年-2010年上市(已退役)。 一个不完整的 高分子可视化历史 其中包括通过X射线晶体学解决的最早大分子的列表。 1997年至今推出。 -
摩尔主义者 成立于1995年 RasMol列表 .主要由 蒂姆·德里斯科尔/molvisions.com 自2004年以来。
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蛋白质探索者 1998年至今。 -
RasMol经典网站 (以前是 RasMol主页 )成立于1996年。 (当前RasMol主页位于 拉斯莫尔。 组织 Herbert Bernstein,自1999年起提供。)
个人快速链接
帮助
特殊:前缀索引 萨马提集团</span> {{清除}} <table align=“right”width=“”style=“margin:10px 10px;”><tr><td>[[图片:]]</table></table>标题 [[图片:wiki.png|frame|Wikipedia Encyclopedia]] 帮助:编辑 图像:基本标记 / 完整图像语法 桌子 Proteopedia:食谱 矩形Jmol 图像贴图 理论模型模板 浮动引号框 小程序标题中的链接 闪存.swf
PDB示例
现场(第二次修复后): 1个uu1 (AC1); 1英尺 (AC1-6); 1份 (AC1-9,BC1-9,所有“结合位点”); 1个pop (AC1-AC9、BC1-BC9、CC1-CC6均为“结合位点”+CAT“CAT”); 1zzz(1zzz) (CAT“活动站点”);
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为教学保留的沙盒
创建人:埃里克:1-161 模板:沙盒保留Eric Martz [1-40]2015年5月1日至7月10日大阪大学 前身为2014年5月1-40日大阪大学 原名2013年5月-7月大阪大学 原名2012年5月-7月大阪大学 原大阪大学2011年5月-7月 原名2010年4月至6月大阪大学
模板:沙盒保留Eric Martz 2 2011年1月4日至10日麻省大学 原名为2010年2月41日至100日以色列,另加151-161
模板:沙盒保留Eric Martz 3 [101-150]101-125 2015年5月-7月冲绳理工学院,沙马提 原名2013年10月至12月麻省大学化学-生物接口汤普森校区 原名2010年5月-7月麻省大学
模板:沙盒保留Eric Martz 4
协作沙盒
沙盒Eric Martz (不受保护)DeShais协作 沙盒2 Eric Martz (不受保护)ConSurfDB协作 沙盒3 Eric Martz (不受保护)(已删除;为Samatey) 沙盒4 Eric Martz (不受保护)(可用) 沙盒5 Eric Martz (未受保护)Heme Morph(Prilusky) 沙盒6 Eric Martz (不受保护)王鹏华第12页 沙盒7 Eric Martz (不受保护)(可用)
沙盒:受保护
用户:Eric Martz/Sandbox 电影测试 用户:Eric Martz/沙盒0 蛋白质中的结-见沙盒11中的方法 用户:Eric Martz/Sandbox 2 FGiJ状态脚本->Proteopedia 用户:Eric Martz/Sandbox 3 微蛋白和微蛋白注释 用户:Eric Martz/Sandbox 4 正在运行病毒外壳和大型程序集的状态脚本 用户:Eric Martz/Sandbox 5 字幕测试 用户:Eric Martz/Sandbox 6 N1中H274Y达菲耐药突变 用户:Eric Martz/Sandbox 7 PyMOL转换器注释 用户:Eric Martz/Sandbox 8 水 用户:Eric Martz/沙盒9 隧道 用户:Eric Martz/Sandbox 10 hbonds(hbonds) 用户:Eric Martz/Sandbox 11 打结方法 用户:Eric Martz/沙盒12 执行搜索的链接 用户:Eric Martz/Sandbox 13 序列对齐工具 用户:Eric Martz/Sandbox 14 Jmol 12.2试验 用户:Eric Martz/沙盒15 Ramachandran参考 用户:Eric Martz/Sandbox 16 PNGJ和标题SAT测试 用户:Eric Martz/Sandbox 17 更多PNGJ和字幕SAT测试 用户:Eric Martz/Sandbox 18 从SAT保存将删除FILTER命令 用户:Eric Martz/Sandbox 19 PACUPP孔蛋白分析 用户:Eric Martz/Sandbox 20 可用 用户:Eric Martz/Sandbox 21 可用 用户:Eric Martz/Sandbox 22 可用
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所有Eric Martz工作台 (使用前缀索引搜索) 用户:Eric Martz/工作台/账户管理 用户:Eric Martz/Worbench tests 用户:Eric Martz/工作台/工作台01 用户:Eric Martz/Worbench 02 用于测试给定权限的用户的读取权限。
合作
萨马蒂
萨马蒂 Fadel_A._Samatey_组 用户:Fadel A.Samatey 具有指向Samatey工作台的链接 用户:Fadel_A._Samatey/FlhBc_I <- 萨马蒂/1 Acta Cryst D论文中未使用。 用户:Fadel_A._Samatey/FlgA_I <- 萨马蒂/2 链接在SciRep的论文中。 用户:Fadel A.Samatey/FlgE I <- 萨马蒂/3 链接在SciRep的论文中。 用户:Fadel A.Samatey/FlgE II/完成鞭毛钩结构 <- 萨马蒂/4 链接在NatComm的纸上。 图片:3b0z-all-chain-a.pdb.gz
Malvankar合作
用户:Nikhil Malvankar 马尔万卡尔 用户:Nikhil Malvankar/Geobacter pilus <- 马尔万卡/1 用户:Nikhil Malvankar/细胞色素纳米线 <- 马尔万卡/2 用户:Nikhil_Malvankar/Geobacter_pilus_structure_and_function <- 马尔万卡/3
科肖合作
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