用户：Fadel A.Samatey/FlhBc I

沙门氏菌

FlhB来自鼠伤寒沙门菌由383个氨基酸组成。细胞质结构域219-383（长度165，全长的43%）结晶。结果模型30赫兹包括残留物229-353的坐标（长度125，结晶长度的76%）。这个非对称单元包含单个分子().

正如出版物中所解释的，长α螺旋的位置似乎通过晶体触点（未显示）。

链条是这被认为是出口装置从钩状模式向长丝模式转变过程中涉及的自催化裂解。阻止这种分裂的突变使细菌无法运动。

产液菌属

来自嗜热菌的FlhB^[1] 超嗜热菌较短，350个残基（相比之下，383个残基鼠伤寒沙门氏菌)，具有32%的序列同一性。残留物213-350（长度138）结晶，得到模型3b1型有在中非对称单元。在下一节的比较中显示的分子，其链命名为C和D，之所以被选择，是因为其平均值最低温度系数（A、B和E、F分别为66.2、84.7和72.6）。其坐标为232-337（长度106，结晶段的77%），在Asn263和Pro264之间的NPTH处裂解。

比较

FlhBc沙门氏菌3D结构与产液菌属.102α碳与1.0º的RMSD对齐。它们的FlhB具有32%的序列一致性。，然后单击下面的按钮进行结构对齐。

收费

这个(鼠伤寒沙门氏菌)在一侧显示一组正电荷，在出版物中称为“正电荷裂缝”。

然而，这个分裂区域中只有两个带正电的残基是保守的：Arg320（ConSurf水平9，最大值）和Arg245（ConSurf水平8）。这在下面的另一个场景中显示进化保护.

回路281-285

两个FlhBc结构都有一个。尽管这个循环是不保守的（见下文），它的删除消除了运动性。环突变为PPPPP会降低运动能力，而突变为AAAAA则没有影响。运动性降低与钩蛋白FlgE和丝蛋白FliC分泌减少相关。

N端子的灵活性

分子动力学模拟表明，281-285的突变降低了N-末端α螺旋的灵活性，因此这种灵活性可能对功能很重要。事实上，226-267（N端螺旋为229-262）被预测为本质无序^[2]观察到的螺旋的形成似乎取决于上述晶体接触的稳定性。

进化保护

由计算得出ConSurf服务器.

在长的N-末端α螺旋的一侧有一条明显的保守残基带。如上所述，包括269和270在内的自催化裂解片段高度保守。相比之下（如上所述），突出的环281-285（这是功能所必需的，并建议对N端的灵活性很重要）并不保守。

保护超嗜热菌FlhBc（未显示）类似，尤其是在上述地区。

谈到上面讨论的正电荷，所有原子都因守恒而着色。旋转结束后，触摸任何侧链以报告其身份。