用户：Fadel A.Samatey/FlgE II/完成鞭毛钩结构

鞭毛钩FlgE的结构空肠弯曲菌菌株81116（FlgE-Cj；NCBI WP_012006803)通过冷冻电子显微镜测定，分辨率为3.5Å。最初我们展示了一个包含55个FlgE单体的模型(). 该模型包含349965个非氢原子。为了使这个模型易于管理，我们只显示了48805个α碳原子^[2]55条链条中的每一条都有不同的颜色。

域

FlgE-Cj有5个域，从D0到D4。D0由两个螺旋和一个“L型螺旋”组成。在这里如图2b-f所示，但L拉伸为黄色：

• 域4：

• 域3：

• 域2:

• 域1：

• 域0 L-拉伸： 

• 域0螺旋：

上述开关也适用于.

L-伸展“手指”

使用上述关闭/打开开关隐藏除D0以外的所有内容。您将看到“手指”从挂钩的D0核心伸出。每个“手指”都是D0域的L拉伸部分。现在显示D1和D0（将D2-D4隐藏）。您可以看到L形伸缩指是如何插入D1副本之间的，从而将D0与D1链接起来。

这里是（参见上面的颜色键）。L拉伸位于D0域中，并指向“外侧”。请注意它是如何在D1域之间锚定自身的钩子中结束的。

核心和渠道

本小节中的所有场景仅显示D0螺旋，D0 L延伸和D1-D4隐藏。

这个由N-末端α-螺旋（残基1-31）^[3]和C-末端α-螺旋（残基812-851）^[3]通道的内表面由C端螺旋线排列，而N端螺旋线形成核心的外层。通过以下方式可以更清楚地了解这一点。要查看频道内部：

这个^[4].

虽然通道的内表面是亲水的（极性的），但它包含.

通道中有一个可见的盐桥（Arg827:Asp840）。盐桥不仅中和了电荷，而且仔细检查表明，通道的内表面上没有电荷。

单体之间的接触

这个，对比一下这个场景：这里，单体是来自挂钩组件中的相邻单体^[5]接触原子^[6]被放大了^[7]，并按域着色。我们现在可以看到以下内容：

• 域0螺旋：大多数相邻触点来自D0螺旋。一些来自邻近的D0 L延伸段。
• 域0 L-拉伸：几乎所有的邻居联系人都来自D1。
• 域1：大多数相邻触点来自D0 L延伸，少数也来自D0螺旋、D1和D2。
• D0和D1与邻居的联系最多。D2、D3和D4较少。
• 域2：大多数联系人来自双方的D2邻居。还有一些来自D3的触点，还有一些来自D1和D4的触点。
• 域3：大多数邻居触点来自D2和D4。似乎没有D3至D3触点。
• 域4：大多数相邻触点来自D3，一个碳原子与D2接触。

这里是^[5].

83个接触原子^[6]（38%）为极性（氧、氮），而133（62%）为非极性（132碳、1硫）。极性相互作用包括20个相邻原子盐桥（D0螺旋：4，D0 L拉伸：3，D1:8，D2:2，D3:0，D4:3）和两个阳离子-π相互作用（58兰特^[3]在L拉伸的尖端：D1中的F133）。因此，75%的盐桥和两种阳离子-π相互作用接触D0或D1，而只有25%的盐桥接触D2、D3或D4。109（82%）的非极性接触原子与D0或D1接触，而只有24（11%）的原子与D2、D3或D4接触。