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关于微型和微型蛋白质的注释
微型的
2018年:微蛋白“从蛋白质编码的小型开放阅读框(smORF,长度小于100–150个密码子)翻译而来。”“为了减少假阳性……大多数基因组注释管道要求ORF至少有300个核苷酸长(即100个氨基酸),导致大多数smORF被遗漏。” [1]
2015年:“微蛋白(MicroProteins,miPs)是短的,通常是单域蛋白质,与miRNAs类似,其与靶分子异二聚并发挥显性负效应。”它们“破坏同二聚体、异二聚体或多聚体复合物的形成”。 “‘微蛋白’这一术语是由于它们的小尺寸和与miRNAs的负调控相似性而产生的” [2]
2011年回顾 [3]
迷你
2017年:小蛋白是“长度小于40个氨基酸的多肽链,采用明确且稳定的3D结构”。 它们通常是设计的,或者是从设计的库中筛选出来的。 [4]
2017年:De novo设计: [5]
2011年:半胱氨酸结微蛋白是天然或工程微蛋白的一个子集。 [8]
蛋白质体
工具书类
↑ Rathore A、Martinez TF、Chu Q、Saghatelian A.小巧但强大? 寻找人类微蛋白及其在理解健康和疾病方面的潜力。 蛋白质组学专家评论。 2018年12月; 15(12):963-965. doi:,10.1080/14789450.2018.1547194。 Epub 2018年11月15日。 PMID: 30415582 数字对象标识: http://dx.doi.org/10.1080/14789450.2018.1547194 ↑ Eguen T、Straub D、Graeff M、Wenkel S.微蛋白质:小规模-大影响。 植物科学趋势。 2015年8月; 20(8):477-82. doi:10.1016/j.tplants.2015.05.011。 Epub,2015年6月23日。 PMID: 26115780 数字对象标识: http://dx.doi.org/10.1016/j.tplants.2015.05.011 ↑ Staudt AC,Wenkel S.“微蛋白质”对蛋白质功能的调节。 EMBO代表,2011年1月; 12(1):35-42. doi:10.1038/embor.2010.196。 Epub 2010年12月10日。 PMID: 21151039 数字对象标识: http://dx.doi.org/10.1038/embor.2010.196 ↑ 贝克EG、Bartlett GJ、Porter Goff KL、Woolfson DN。 微蛋白设计:过去、现在和展望。 Acc Chem Res.2017年9月19日; 50(9):2085-2092. doi:10.1021/acs.accounts.7b00186.,Epub 2017年8月23日。 PMID: 28832117 数字对象标识: http://dx.doi.org/10.1021/acs.accounts.7b00186 ↑ Chevalier A、Silva DA、Rocklin GJ、Hicks DR、Vergara R、Murapa P、Bernard SM、Zhang L、Lam KH、Yao G、Bahl CD、Miyashita SI、Goreshnik I、Fuller JT、Koday MT、Jenkins CM、Colvin T、Carter L、Bohn A、Bryan CM、Fernandez-Velasco DA、Stewart L、Dong M、Huang X、Jin R、Wilson IA、Fuller-DH、Baker D。 针对靶向治疗的大规模并行从头设计蛋白质。 自然。 2017年10月5日; 550(7674):74-79. doi:10.1038/nature23912。 Epub 2017年9月27日。 PMID: 28953867 数字对象标识: http://dx.doi.org/10.1038/nature23912 ↑ 欧佩拉SJ。病毒跨膜小蛋白的相关结构和功能。 当前操作病毒。 2015年6月; 12:121-5. doi:10.1016/j.coviro.2015.05.006。 Epub 2015年6月6日。 PMID: 26057606 数字对象标识: http://dx.doi.org/10.1016/j.coviro.2015.05.006 ↑ DiMaio D.病毒微蛋白。 微生物年鉴。 2014; 68:21-43. doi:10.1146/annurev-micro-091313-103727。 Epub,2014年4月10日。 PMID: 24742054 数字对象标识: http://dx.doi.org/10.1146/annrev-micro-091313-103727 ↑ Kolmar H.用于诊断和治疗的天然和工程胱氨酸结微蛋白。 当前药物设计。 2011年12月; 17(38):4329-36. PMID: 22204431