用户:Eric Martz/Sandbox 3

来自Proteopedia

跳转到:航行,搜索

目录

关于微型和微型蛋白质的注释

微型的

  • 2018年:微蛋白“从蛋白质编码的小型开放阅读框(smORF,长度小于100–150个密码子)翻译而来。”“为了减少假阳性……大多数基因组注释管道要求ORF至少有300个核苷酸长(即100个氨基酸),导致大多数smORF被遗漏。”[1]
  • 2015年:“微蛋白(MicroProteins,miPs)是短的,通常是单域蛋白质,与miRNAs类似,其与靶分子异二聚并发挥显性负效应。”它们“破坏同二聚体、异二聚体或多聚体复合物的形成”。“‘微蛋白’这一术语是由于它们的小尺寸和与miRNAs的负调控相似性而产生的”[2]


  • 2011年回顾[3]

迷你

  • 2017年:小蛋白是“长度小于40个氨基酸的多肽链,采用明确且稳定的3D结构”。它们通常是设计的,或者是从设计的库中筛选出来的。[4]
  • 2017年:De novo设计:[5]
  • 2015年:病毒具有疏水性、跨膜小蛋白。[6] [7]
  • 2011年:半胱氨酸结微蛋白是天然或工程微蛋白的一个子集。[8]

蛋白质体


工具书类

  1. Rathore A、Martinez TF、Chu Q、Saghatelian A.小巧但强大?寻找人类微蛋白及其在理解健康和疾病方面的潜力。蛋白质组学专家评论。2018年12月;15(12):963-965. doi:,10.1080/14789450.2018.1547194。Epub 2018年11月15日。PMID:30415582数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1080/14789450.2018.1547194
  2. Eguen T、Straub D、Graeff M、Wenkel S.微蛋白质:小规模-大影响。植物科学趋势。2015年8月;20(8):477-82. doi:10.1016/j.tplants.2015.05.011。Epub,2015年6月23日。PMID:26115780数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1016/j.tplants.2015.05.011
  3. Staudt AC,Wenkel S.“微蛋白质”对蛋白质功能的调节。EMBO代表,2011年1月;12(1):35-42. doi:10.1038/embor.2010.196。Epub 2010年12月10日。PMID:21151039数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1038/embor.2010.196
  4. 贝克EG、Bartlett GJ、Porter Goff KL、Woolfson DN。微蛋白设计:过去、现在和展望。Acc Chem Res.2017年9月19日;50(9):2085-2092. doi:10.1021/acs.accounts.7b00186.,Epub 2017年8月23日。PMID:28832117数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1021/acs.accounts.7b00186
  5. Chevalier A、Silva DA、Rocklin GJ、Hicks DR、Vergara R、Murapa P、Bernard SM、Zhang L、Lam KH、Yao G、Bahl CD、Miyashita SI、Goreshnik I、Fuller JT、Koday MT、Jenkins CM、Colvin T、Carter L、Bohn A、Bryan CM、Fernandez-Velasco DA、Stewart L、Dong M、Huang X、Jin R、Wilson IA、Fuller-DH、Baker D。针对靶向治疗的大规模并行从头设计蛋白质。自然。2017年10月5日;550(7674):74-79. doi:10.1038/nature23912。Epub 2017年9月27日。PMID:28953867数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1038/nature23912
  6. 欧佩拉SJ。病毒跨膜小蛋白的相关结构和功能。当前操作病毒。2015年6月;12:121-5. doi:10.1016/j.coviro.2015.05.006。Epub 2015年6月6日。PMID:26057606数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1016/j.coviro.2015.05.006
  7. DiMaio D.病毒微蛋白。微生物年鉴。2014;68:21-43. doi:10.1146/annurev-micro-091313-103727。Epub,2014年4月10日。PMID:24742054数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1146/annrev-micro-091313-103727
  8. Kolmar H.用于诊断和治疗的天然和工程胱氨酸结微蛋白。当前药物设计。2011年12月;17(38):4329-36. PMID:22204431

Proteopedia页面贡献者和编辑(这是什么?)

埃里克·马茨,詹姆·普里卢斯基

个人工具