这个生物单位属于5亿()是由6个α螺旋组成的晶体结构,组装成具有疏水核的纤维[1].单个肽是合成的和被设计成以这种方式组装,具有富含苯丙氨酸的疏水核。晶体结构具有分辨率1.7º(非常好),以及免费0.22,这是该分辨率的平均值,表明该模型是可靠的。
这个.苯丙氨酸环(深灰色)周围都是(浅灰色).
这个主要是收费赖氨酸+和谷氨酸-侧链,偶尔有Trp或Gln,点缀有Ala(球体)。
收费
这些肽被设计成在六聚体的链之间形成盐桥,假设这些肽平行于六聚体。令人惊讶的是,肽在形成的六聚体中是反平行的。这排除了六聚体中的盐桥。作者指出,这表明疏水核的能量学占主导地位,而盐桥是不必要的。
费用表表面上,让人想起肖的理论模型降硫地杆菌菌毛。链条上的终端电荷被阻塞(见下文)。与肖的模型不同,这些都没有形成盐桥(一些相反的电荷是水桥)。
阳离子-pi相互作用由于Phe被埋藏,Lys在地表,因此无法形成Phe。表面的Trp和Lys之间可能会形成一些阳离子-π相互作用。
六聚体之间的盐桥
六聚体表面上一排排交替的正负电荷表明,六聚体之间可能会形成盐桥,从而稳定蛋白质晶体。事实上,有
只有一座盐桥
在每对六聚体之间,如晶体单元所示。
序列和阻塞的Termini
肽序列由四个七肽拷贝构建而成
E L/F K A I A Q/K/W
氨基末端Glu被乙酰化,去除其正电荷。C末端Lys被酰胺化,去除负电荷。这是一个完整肽(29个氨基酸)的序列,显示七肽重复序列。
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