硫醚蛋白质交联

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侧链之间的其他键半胱氨酸和酪氨酸已对半胱氨酸加氧酶进行了深入研究[1]在过氧化氢酶中观察到[2]和半乳糖氧化酶(参见下面的示例)。

半胱氨酸和配体之间的硫醚键很常见,但通常不是多肽之间的交联。硫醚键半胱氨酸和血红素的乙烯基都很常见。多样化的其他配体通过半胱氨酸硫醚键与蛋白质结合。

请注意蛋氨酸侧链包含硫醚(不是蛋白质交联物)。

硫醚交联频率的准确估计PDB公司可能不可用。在Proteopedia中搜索“硫醚”,在标题为4个字符的页面摘要中点击率超过200次PDB代码.

目录

示例

半胱氨酸-Tyr

Cys-配体

  • 5nf0型(2017):肽通过2个硫醚与二甲苯环化。
  • 1983年6月(2019):泛素激活酶E1硫醚结合到修饰的脱氧腺苷。
  • 6伏直流电(2021):细菌过氧酶硫醚结合血红素。

检测和可视化

Jmol简介当出现蛋白质交联时会提醒您,并提供方便的链接,可以放大并详细显示每个交联。查看电子密度图只需再单击一次。使用上面的链接到4个字符PDB代码转到名为4个字符的Proteopedia页面PDB代码。在那里,单击“第一眼”。在FirstGlance中,单击Tools选项卡,然后在那里单击Protein Crosslinks。请参阅实用指南蛋白质交联的初步评估.

其他蛋白质交联

除上述债券外,其他多肽链间共价交联包括:

工具书类

  1. Davies CG、Fellner M、Tchesnokov EP、Wilbanks SM、Jameson GN。半胱氨酸双加氧酶的Cys-Tyr交联改变了反应的最佳pH值,而没有结构变化。生物化学。2014年11月12日。PMID:25390690数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1021/bi501277a
  2. Diaz A,Horjales E,Rudino Pinera E,Arreola R,Hansberg W.大型过氧化氢酶中不寻常的Cys-Tyr共价键。分子生物学杂志。2004年9月17日;342(3):971-85. PMID:15342250数字对象标识:2016年10月10日/j.jmb.2004.07.027

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埃里克·马茨

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