谈话:加曼实验室:溶酶体酶特异性的相互转化
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加载文件“=3HG5”“=3H54” restrict none#清除显示 #定义活动场地残留物和叠加结构 定义~actgal 1.1和(47,92,93134142168170172203206207227231)以及*:A 定义~actnagal 2.1和(33,78,79119127154156158188191192213217)以及*:A 比较{2.1}{1.1}子集{*.CA}原子{~actnagal和*.CA}{~actgal和x.CA}旋转平移 选择蛋白质和1.1; 卡通; 浅绿; 中心已选定 选择801-802; 线框100; 彩色cpk 选择蛋白质和2.1; 卡通; 彩色矢车菊蓝; 选择10002000; 线框100; 彩色cpk 在(3.0,(BMA,NAG,MAN)和(侧链或*.CA)中选择组 选择所选或(BMA、NAG、MAN); 线框50 型号1#或型号2
加载文件“=3HG5”“=3H54” restrict none#清除显示 #定义活动场地残留物和叠加结构 定义~actgal 1.1和(47,92,93134142168170172203206207227231)以及*:A 定义~actnagal 2.1和(33,78,79119127154156158191192213217)以及*:A 比较{2.1}{1.1}子集{*.CA}原子{~actnagal和*.CA}{~actgal和x.CA}旋转平移 #显示alpha-GAL的活动站点 选择~actgal和(侧链或*.CA); 线框60; 颜色键淡绿色 选择selected而不是_C; spacefill 80; 彩色cpk 选择1.1和(46-48、91-94、133-135、141-143、169-173、202-208、226-232)以及*:A.CA 痕迹10; 浅绿色 选择a2g:A; 线框60; 设置字体缩放开 选择1.1和(203206)以及*:A.CB; 标签%m%r; 彩色标签黑色; #显示alpha-NAGAL的活性位点 选择~actnagal和(sidechain或*.CA); 线框60; 彩色债券-矢车菊蓝 选择selected而不是_C; spacefill 80; 彩色cpk 选择2.1和(32-34、77-80、118-120、126-128、153-159、187-193、212-218)以及*:A.CA; 痕迹10; 彩色矢车菊蓝 选择801:A; 线框60; 中心已选定 选择2.1和(188191)以及*:A.CB; 标签%m%r; 彩色标签黑色; 字体标签14 型号1或型号2
加载文件“=3HG5”“=3H54” restrict none#清除显示 #定义活动场地残留物和叠加结构 定义~actgal 1.1和(47,92,93134142168170172203206207227231)以及*:A 定义~actnagal 2.1和(33,78,79119127154156158188191192213217)以及*:A 比较{2.1}{1.1}原子{1000:A和_C}{801:A和_C{旋转平移 #显示alpha-GAL的活动站点 选择~actgal和(侧链或*.CA); 线框60; 颜色键淡绿色 选择selected而不是_C; spacefill 80; 彩色cpk 选择1.1和(46-48、91-94、133-135、141-143、169-173、202-208、226-232)以及*:A.CA 痕迹10; 浅绿色 选择a2g:A; 线框60; 设置字体缩放开 #显示alpha-NAGAL的活性位点 选择~actnagal和(sidechain或*.CA); 线框60; 彩色债券-矢车菊蓝 选择selected而不是_C; spacefill 80; 彩色cpk 选择2.1和(32-34、77-80、118-120、126-128、153-159、187-193、212-218)以及*:A.CA; 痕迹10; 彩色矢车菊蓝 选择801:A; 线框60; 中心已选定 选择1.1和(203206)以及*:A.CB; 标签%m%r; 彩色标签黑色; 选择2.1和(188191)以及*:A.CB; 标签%m%r; 彩色标签黑色; 字体标签14 型号1#或型号2
加载文件“=3HG5”“=3H54” restrict none#清除显示 比较{2.1}{1.1}原子{1000:A和_C}{801:A和_C{旋转平移 选择蛋白质和1.1; 卡通; 浅绿; 中心已选定 选择801-802; 线框100; 彩色cpk 选择蛋白质和2.1; 卡通; 彩色矢车菊蓝; 选择10002000; 线框100; 彩色cpk 在(3.0,(BMA,NAG,MAN)和(侧链或*.CA)中选择组 选择所选或(BMA、NAG、MAN); 线框50 型号1#或型号2
加载图像:Interconversion_model.pdb#在场景创作工具中执行此操作 restrict none#清除显示 设置ssBondsBackbone FALSE #显示alpha-GAL的活动站点 定义~actgal(47,92,93134142168170172203206207227231)和*:A/1 选择~actgal和(侧链或*.CA); 线框60; 颜色键淡绿色 选择selected而不是_C; spacefill 80; 彩色cpk 选择(46-48、91-94、133-135、141-143、169-173、202-208、226-232)和*:A.CA/1 痕迹10; 浅绿色 选择a2g:A; 线框60; 选择gla:A; 线框60; 设置字体缩放开 选择(203206)和*:A.CB/1; 标签%m%r; 彩色标签黑色; #显示alpha-NAGAL的活性位点 定义~actnagal(33,78,79119127154156158188191192213217)和*:A/2 选择~actnagal和(sidechain或*.CA); 线框60; 彩色债券-矢车菊蓝 选择selected而不是_C; spacefill 80; 彩色cpk 选择(32-34、77-80、118-120、126-128、153-159、187-193、212-218)和*:A.CA/2; 痕迹10; 彩色矢车菊蓝 选择801:A; 线框60; 中心已选定 选择a2g:A; 线框60; 选择(188191)和*:A.CB/2; 标签%m%r; 彩色标签黑色; 字体标签14 #下面四个不同数字的其中一行 联系人{a2g:A/1}{~actgal}已满 联系人{gla:A/1}{~actgal}已满 联系人{gla:A/2{~actnagal}已满 联系人{a2g:A/2}{~actnagal}已满 #隐藏其中一种糖(取决于我们显示的联系人 隐藏a2g 皮玻璃
负载3lx9 restrict none#清除显示 设置ssbonds SIDECHAIN 选择(47,92,9313414216817017220320620727231)和(侧链或*.CA)以及*:A; 线框60; 颜色键黄色 选择selected而不是_C; spacefill 80; 彩色cpk 选择(47,92,93134142168170172203206207227231)和*:A.CB; 标签%m%r; 彩色标签黑色; 选择a2g:A; 线框60; 中心已选定 等值面s单色矢车菊蓝“ http://proteoppedia.org/wiki/images/8/84/3lx9.jvxl “网格
负载3lxa restrict none#清除显示 设置ssbonds SIDECHAIN 选择(47,92,93134142168170172203206207227231)和(侧链或*.CA)以及*:A; 线框60; 颜色键黄色 选择selected而不是_C; spacefill 80; 彩色cpk 选择(47,92,93134142168170172203206207227231)和*:A.CB; 标签%m%r; 黑色标签 选择801:A; 线框60; 中心已选定
加载文件“=3H54”“=3LX9” restrict none#清除显示 定义~ act2 2.1和(47,92,93134142168170172203206207227231)以及*:A 定义~ act1 1.1和(33,78,79119127154156158188191192213217)以及*:A 比较{2.1}{1.1}子集{*.CA}原子{~act2}{~act1}旋转平移 设置ssbonds SIDECHAIN 选择1.1和~act1和(侧链或*.CA); 线框60; 彩色债券-矢车菊蓝 选择selected而不是_C; spacefill 80; 彩色cpk 选择1.1和(32-34、77-80、118-120、126-128、153-159、187-193、212-218)以及*:A.CA; 痕迹10; 彩色矢车菊蓝 选择1.1和1000:A; 线框60; 选择selected和_C; 天蓝; 选择2.1、~act2和(侧链或*.CA); 线框60; 颜色键黄色 选择selected而不是_C; spacefill 80; 彩色cpk 选择2.1和(46-48、91-94、133-135、141-143、169-173、202-208、226-232)以及*:A.CA; 迹线10; 黄色 选择2.1和1000:A; 线框60; 选择selected和_C; 米色; 中心已选定