来自Proteopedia
蛋白足连接蛋白足连接
硒代半胱氨酸(秒，U)，如右图所示()，被称为21氨基酸[1]它被纳入生命各个领域的罕见蛋白质中，对生命至关重要。当UGA终止密码子伴有合适的信号，它被转换为Sec，而不是停止转换。在PDB公司，的代码异性恋组Sec是秒[2]。有关以下内容以外的更多信息，请参阅维基百科中的硒代半胱氨酸.
重要性
tRNA敲除秒导致小鼠胚胎死亡[3]。这似乎与几种重要酶中Sec的出现.
事件
Sec存在于生命的所有领域，包括细菌、古生菌和真核生物[4][5]Sec发生在清除活性氧物种的酶的活性部位和甲状腺激素的激活中[3]。有关更多示例，请参见维基百科中的硒代半胱氨酸.
2022年1月，76个条目在中wwPDB网站包含Sec。天然Sec的一个例子是人体谷胱甘肽过氧化物酶4，其中Sec46出现在催化位点。6小时3是野生型，而6港元具有与Sec共价结合的抑制剂。
可视化
首次以Jmol查看6HKQ.
- 1.查找“Focus Box”（在左上方面板中，向下滚动到底部），然后单击“Find..”。
- 2.输入秒进入“查找”窗口。
要详细检查与Sec46联系的内容（从上面的步骤2继续）：
- 3.单击工具选项卡中的“联系人和非共通交互”。
- 4.选中“带光晕的原子”作为目标。
- 5.单击“显示与目标接触的原子”。
使用左下角“显示的联系人”面板中现有的工具进行探索。
来自UGA Stop Codon的翻译
在mRNA翻译过程中，UGA通常被解释为终止密码子。然而，当一种特殊的Sec插入序列（SECIS），一种茎环结构，存在于下游（哺乳动物的未翻译区）时，UGA被翻译为Sec[1][3]这涉及干环结构与特殊伸长因子的相互作用，称为选择B细菌和人体EFSec[3].
结构与合成
半胱氨酸（Cys）具有含硫侧链-中国2-上海在硒代半胱氨酸中，硫被硒取代，形成侧链-中国2-SeH公司然而，如下文所述，Sec不是从Cys合成的，而是从Ser（侧链-中国2-俄亥俄州)用硒代替氧气。
秒与20种标准氨基酸因为在生命的所有领域，它都缺乏自己的tRNA合成酶，是由与tRNA共价连接的Ser合成的秒.
这个晶体转化Ser-tRNA的复合物的结构秒至Sec-tRNA秒(三氯乙烷)2009年报道[3]。这包括O（运行）-磷脂酰-tRNA:selenocysteinyl-tRNA合酶（SepSecS）与tRNA复合秒、磷酸丝氨酸和硫代磷酸。作者得出结论，这种结构，加上酶学，支持磷酸吡哆醛依赖的机制。
另请参见
注释和参考
- ↑1 1.1Atkins JF，Gesteland RF。第二十一种氨基酸。自然。2000年9月28日；407(6803):463, 465. PMID：11028985数字对象标识：10.1038/35035189
- ↑补救之前wwPDB网站2010年之后，wwPDB中的某些Sec被编码为CSE。
- ↑3 3.1 3.2 3.3 3.4Palioura S、Sherrer RL、Steitz TA、Soll D、Simonovic M。人类SepSecS-tRNASec复合物揭示了硒代半胱氨酸的形成机制。科学。2009年7月17日；325(5938):321-5. PMID：19608919数字对象标识：325/5938/321
- ↑Lobanov AV，Hatfield DL，Gladyshev VN。真核硒蛋白和硒蛋白组。Biochim生物物理学报。2009年11月；1790(11):1424-8. Epub 2009年5月27日。PMID：19477234数字对象标识：10.1016/j.bbagen.2009年5月14日
- ↑ 维基百科中的硒代半胱氨酸
