撤销和欺诈

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欺诈或错误的结构通常需要很多年才能从PDB公司，还有一些尚未纠正[1] [2] [3].

需要在下面文章的未来版本中解决的有问题的PDB条目记录在[1] [2] [3] [4] [5].

许多PDB公司条目已收回[6]由于欺诈或诚实的错误。可以在收回数据库属于RetractionWatch.com网站，其中还包含更正和关注的表达。出版后同行评审网站也可能表达对已出版结构的担忧PubPeer.com网站.

Wlodawer描述了一些历史错误和明显错误的PDB沉积等。, 2008[7].

  • 2019年2月：欺诈调查结果的历史和结果H.克里希纳·穆尔蒂（见下文2009）总结如下ORI不当行为审查结论导致PDB结构过时，纸张收回[8].
  • 2016年4月：自然正式撤回2小时0[9]见下文2009。
  • 2012年2月：3千78已从中删除PDB公司因为它看起来很欺诈[11][12]随后，罗伯特·施瓦岑巴赫承认数据伪造，并被奥地利萨尔茨堡大学解雇[13]2013年4月免疫学杂志撤回了2010年原始文章中的晶体学结果[14].
  • 2007:杰弗里·张[19]和同事收回了五份PDB条目[20][21]结构中存在主要错误，部分原因是所用软件程序中的错误[22]当错误被曝光后，作者立即承认了问题并收回了受影响的出版物。缩回结构为1个jsq,第1页,1年2月,1s7b级，以及200万平方米布莱恩·马修斯[23]解释说，应该立即清楚电子密度图是不正确的：
“如果F+和F−互换，可能会产生反向电子密度图，但获得这样的图应立即表明发生了错误。”“对于MsbA结构测定，如果包含异常散射数据，则不应出现需要在正确地图和其反转图像之间进行选择的情况。”“R（右）和免费[由Chang和Roth于2001年获得[24]]MsbA的单一模型改进，但被打折。。。。“（引用自Matthews，2007年[23])


另请参见

工具书类

  1. ↑1 1.1Rupp B、Wlodawer A、Minor W、Helliwell JR、Jaskolski M。纠正结构性出版物的记录需要社区和期刊编辑的共同努力。FEBS J.2016年12月；283(24):4452-4457. doi:10.1111/febs.13765。Epub 2016年6月10日。PMID：27229767数字对象标识：http://dx.doi.org/10.1111/febs.13765
  2. ↑2 2.1Wlodawer A、Dauter Z、Porebski PJ、Minor W、Stanfield R、Jaskolski M、Pozharski E、Weichenberger CX、Rupp B.检测、纠正、收缩：如何管理不正确的结构模型。2017年11月7日FEBS J。doi:10.1111/febs.14320。PMID：29113027数字对象标识：网址：http://dx.doi.org/10.1111/febs.14320
  3. ↑3 3.1Dauter Z、Wlodawer A、Minor W、Jaskolski M、Rupp B。沉积大分子结构中可避免的错误：高效数据挖掘的障碍。IUCrJ.2014年4月14日；1（第3部分）：179-93。doi:10.1107/S2052252514005442。eCollection，2014年5月1日。PMID：25075337数字对象标识：http://dx.doi.org/10.107/S2052252514005442
  4. ↑Stanfield R，Pozharski E，Rupp B.对三篇X射线晶体结构论文的评论。免疫学杂志。2016年1月15日；196(2):521-4. doi:10.40409/jimmunol.1501343。PMID：26747564数字对象标识：网址：http://dx.doi.org/10.4049/jimmunol.1501343
  5. ↑Stanfield R，Pozharski E，Rupp B.三篇X射线晶体结构论文的补充评论。免疫学杂志。2016年1月15日；196(2):528-30. doi:10.4049/jimmunol.1502281。PMID：26747567数字对象标识：http://dx.doi.org/10.4049/jimmunol.1502281
  6. ↑6 6.1 wwPDB关于收回PDB条目的声明.
  7. ↑Wlodawer A、Minor W、Dauter Z、Jaskolski M.非晶体学家的蛋白质晶体学，或如何从已发表的大分子结构中获得最佳（但不是更多）。FEBS J.2008年1月；275(1):1-21. doi:10.1111/j.1742-4658.2007.06178.x.电子版2007年11月23日。PMID：18034855数字对象标识：http://dx.doi.org/10.1111/j.1742-4658.2007.06178.x
  8. ↑8 8.1 ORI不当行为审查结论导致PDB结构过时，纸张收回.
  9. ↑Abdul Ajees A，Volanakis JE，Narayana SV.收缩：补体C3b的结构为补体激活和调节提供了见解。自然。2016年4月14日；532(7598):268. doi:10.1038/nature16523。Epub 2016年1月4日。PMID：26727161数字对象标识：http://dx.doi.org/10.1038/nature16523
  10. ↑ 病例总结：比扬·阿瓦齐。研究诚信办公室，2014年10月。
  11. ↑Abbott A.试验测试奥地利诚信机构。自然。2012年5月1日；485(7396):15. doi:10.1038/485015a。PMID：22552066数字对象标识：10.1038/485015a
  12. ↑ 在对“极不可能的特征”进行调查后，蛋白质结构被收回，该杂志称其为欺诈2012年4月
  13. ↑ 撤退观察：罗伯特·施瓦岑巴赫档案.
  14. ↑ 更正：抗原聚集决定过敏性免疫反应的命运.
  15. ↑ PNAS缩回2hlb.
  16. ↑ 讨论PDB电子邮件列表中的欺诈行为.
  17. ↑博雷尔·B·欺诈动摇了蛋白质社区。自然。2009年12月24日；462(7276):970. doi:10.1038/462970a。PMID：20033014数字对象标识：http://dx.doi.org/10.1038/462970a
  18. ↑ 阿拉巴马大学关于H.M.Krishna Murthy伪造PDB条目的官方声明。多亏了用户：Peter A.Keller于2014年5月16日提供此更新链接。
  19. ↑请参见维基百科的Geoffrey Chang.
  20. ↑Miller G.科学出版。科学家的噩梦：软件问题导致五次撤回。科学。2006年12月22日；314(5807):1856-7. PMID：17185570数字对象标识：10.1126/科学.314.5807.1856
  21. ↑ 《科学》（Science）上Miller文章摘要（先前引文）
  22. ↑菲利普·杰弗里。，MsbA结构测定中的误差分析（开放访问）。晶体学报D生物晶体。2009年2月1日；65（第2部分）：193–199。doi:10.1107/S0907444909001292.
  23. ↑23 23.1Matthews BW。五份收回的结构报告：倒置还是不正确？蛋白质科学。2007年6月；16(6):1013-6. Epub 2007年5月1日。PMID：17473006数字对象标识：10.1110/ps.072888607
  24. ↑Chang G，Roth CB。大肠杆菌MsbA的结构：多药耐药ATP结合盒（ABC）转运体的同源物。科学。2001年9月7日；293(5536):1793-800. PMID：11546864数字对象标识：10.1126/科学293.5536.1793

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埃里克·马茨,詹姆·普里卢斯基

内政部：https://dx.doi.org/10.14576/493680.2833686(?)
引用：Martz E，Prilusky J，2017年，“撤销和欺诈”，蛋白质体，内政部：https://dx.doi.org/10.14576/493680.2833686
检索自“http://proteoppedia.org/wiki/index.php/Retractions_and_Fraud网站"
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