来自Proteopedia
蛋白质组链接蛋白质组链接重新混合是指从多个来源组合文档。例如，您可能想创建一个关于柠檬酸循环的页面，并希望将现有文章中关于单个酶的3D场景合并在一起。首先，搜索是否已经有这样的文章（有，柠檬酸循环). 如果没有，你可以开始一个新的页面，并按照下面的描述进行混音。
来源归属
Proteopedia上编写的内容可通过CC-BY-3.0许可证获得，因此欢迎您在此处或其他地方重用它，但必须注明其来源。在Proteopedia中，培养物包括一个名为内容捐助者，并在那里列出您以外的人的贡献。在Proteopedia上为新页面进行混音时，从该部分开始，并列出您将要进行混音的来源是有意义的。
重新混合文本
您可以复制和粘贴不带格式的文本，也可以进入编辑选项卡复制带格式的文字。使用哪种方法取决于原始格式对新文本有用的程度。如果您确实进入了编辑选项卡，请确保在完成复制后将其取消，这样您就不会无意中更改源文章。通常，您会修改文本，使其在细节量、目标受众以及前后部分的过渡方面适合新页面。
从外部源重新混合3D场景
首先，检查许可条款是什么，以及它们是否与用户创建的Proteopedia内容的许可CC-BY-3.0兼容。如果您有权限或从作者那里获得了权限，请获取状态脚本（进入Jmol控制台并按“状态”按钮），然后确定场景基于哪个坐标。在新页面的SAT中，通过将状态脚本粘贴到Jmol控制器中来运行状态脚本，然后保存场景。在“内容提供者”部分中，确认场景的来源和坐标。
当脚本从自己的站点加载坐标时，首先必须上传pdb文件（包括正确的属性）。然后，将坐标加载到新页面的SAT中，并在注释掉load语句后运行状态脚本。该过程用于重新混合贝塔发夹折叠变形（3D窗口旁边的第一个示例）。
从Proteopedia中重新混合3D场景
查找场景块
假设您想重用在现有Proteopedia页面上找到的3D场景。要重新混合3D场景，您需要场景的场景块，如下所示绿色链接文本。进入源页面的编辑选项卡，查找“场景”标记。复制信息后，取消对现有Proteopedia页面的编辑。
按原样使用场景
如果您根本不想修改场景（没有新标题，没有新方向，没有新过渡选项），请将场景块粘贴到页面中并保存。新场景应该可以工作了。可以修改绿色链接文本。请特别注意<和>标志。
在SAT上修改场景
要修改其他页面的场景并将其保存为新的本地场景：如上所述，首先将场景块添加到页面中，然后保存页面。再次打开您自己的页面进行编辑。SAT现在将在[load scene]选项卡中提供用于加载的所有场景，这些场景可以在您自己的页面上找到，也可以在您重用场景的所有页面上找到。您现在可以编辑任何可用的场景，更改标题、加载模式、表示等。SAT将在您自己的页面区域下将生成的场景保存为本地。现在可以删除从源页面复制的场景块，并插入指向刚刚保存的场景的绿色链接。
修改2013年之前创建的场景
2013年之前创建的场景使用了这样的场景块<scene name='Green_Flurescent_Protein/Chromephore/1'>.
要按原样使用场景，只需按照前面的描述进行操作：将场景块粘贴到页面上，如果需要，修改绿色链接并保存。
要修改其中一个场景，您需要在SAT上加载场景，如下所示：
- 编辑页面并展开SAT
- 使用小程序下的按钮打开JSmol控制台
- 按如下所示构建场景的路径，替换Green_Flu。。。根据从要使用的场景的场景块中检索到的场景信息：'/wiki/scripts/Green_Flurescent_Protein/Chromephore/1.spt'
- 在JSmol控制台的下部粘贴一行，如下所示脚本路径到TheScene；然后单击[运行]。例如，您可以使用命令“script/wiki/scripts/Green_Flurescent_Protein/Chromephore/1.spt”加载显示生色团的场景。
- 如果需要，在SAT上修改场景
- 将场景保存在[save scene]选项卡上，作为页面本地的新场景，并带有适用于页面的名称和标题。
修改通过Jmol链接调用的场景
本节是一个高级主题，仅适用于使用jmolLink块的页面。一些页面上的一些绿色链接没有场景块，而是有jmolLink块，例如。
<jmol><jmol链接><脚本>script/scripts/37/376372/Hbonds/2.spt；选择板材和主干；hbonds 0.2；延迟1.2；hbonds 0.04；</script>股之间<text></jmolLink></jmol>
此示例来自蛋清（HEW）溶菌酶.如果像本例中那样调用脚本，则可以复制整个块（从<jmol>复制到</jmol>>）并将其粘贴到新页面中。保存到新页面后，场景（“37/376372/Hbonds/2”）将可以在场景创作工具中访问。然而，它将缺少来自<script>块的任何其他命令（例如，示例中突出显示表中氢键的命令）。
将Proteopedia中的场景重新合成为图像
从3D场景中保存2D图像的最快方法是截屏，但这不是最好的方法。要对图像大小进行更多控制，并捕获返回3D场景所需的信息，请打开Jmol控制台以发出以下命令：
写入IMAGE宽度高度PNGJ n“fileName”
在该命令中，“宽度”和“高度”是以像素为单位的图像大小，“n”是介于0和10之间的可选整数，表示压缩程度以减小文件大小。文件名应具有.png扩展名，以指示图像格式。
如果你想要一个3D效果，保存为动画GIF适用于许多类型的媒体（幻灯片、网页）。在Proteopedia中，3D Jmol窗口的底部有一个动画链接。单击此按钮并按照说明从3D场景制作旋转或摇摆的动画GIF。下面的动画GIF是由如下所示的alpha螺旋场景制作的。要了解使用的参数，请单击图像。
混音的3D场景示例
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- 这里是。原件位于外部网页上的Jmol窗口中（ChemTube3D，请参阅文章末尾的属性）。坐标上传到Proteopedia(图片：发夹3anim.pdb)，原始中使用的状态文件在这些坐标上运行，以在Proteopedia的场景创作工具中创建场景。
- 这里是。它直接从α螺旋第页。
- 现在我们开始。另一个来自α螺旋第页。
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