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蛋白质组链接蛋白质组链接RasMol公司[1]是一个非常受欢迎的开源软件大分子可视化独立程序，首次发布于1993年。从它的发行到1999年，几乎所有的《RasMol》都是罗杰·赛义尔（Roger A.Sayle）写的，最初他还是一名学生。从2000年开始，志愿者在开源许可证下继续开发。
公共领域RasMol（1993-2000）
Sayle将RasMol及其C源代码发布到公共领域。从1995年至2000年RasMol经典网站,拉斯莫尔。莫尔维兹。组织（称为RasMol主页当时），提供了下载、大量文档、教程和RasMol电影脚本。此网站通过其上一版本2.6-beta-2a支持公共域RasMol。
MDL信息系统对RasMol的约16000行公共域源代码进行了改编，以构建网络浏览器插件编钟.
Sayle还创建了一个专有版本的RasMol，能够输出立体成像数据，使3D打印机能够创建固体物理分子模型（参见3D分子设计。通用域名格式).
Sayle为RasMol开发的分子可视化命令脚本语言在编钟和焦耳（Jmol）.
开源RasMol（2000年至今）
1999年，赛义尔基本上停止了RasMol的开发，在赛义尔的支持下，赫伯特·J·伯恩斯坦（Herbert J.Bernstein）[2][3]假设开发和支持RasMol，但在严格的GNU通用公共许可证（或类似）许可证。RasMol的后续版本（2.7.x版）包含了许多程序员提供的大量增强功能。
下载
开源RasMol的下载和文档可从以下网址获得：拉斯莫尔。组织.
RasMol的局限性
有效使用RasMol需要从RasMol's广泛的命令语言键入命令。很少使用RasMol的人通常记不住命令，这严重限制了他们的视野。即使您很熟悉命令语言，某些复杂的可视化任务也需要如此多的命令，以至于很少有用户能够完成它们。这种任务的一个例子是可视化与指定部分的所有非共价相互作用。不需要学习复杂命令语言的分子可视化软件已经开发出来，可以让更广泛的用户访问强大的可视化功能。示例包括Jmol简介和蛋白质探索者它具有广泛的自动显示上下文相关帮助、内置颜色键，还包括完成复杂可视化任务的例程（例如可视化到指定部分的非共价键，包括蛋白质阳离子π轨道交互）只需点击几下鼠标。
其他软件包提供RasMol中没有的可视化功能。焦耳（Jmol）例如，具有更高质量的渲染模式、半透明渲染、多个模型的自动动画、表面、分子轨道和腔可视化、生物单位、晶体对称操作（包括晶体接触和单位细胞的可视化）、任意对象，如箭头和平面，和真正的板坯旋转脱模。
另请参见
工具书类
- ↑《RasMol:面向所有人的生物分子图形》，罗杰·塞耶和E.詹姆斯·米尔内·怀特著，生物化学科学趋势 20（9月）：374-3761995年。这是对公共领域RasMol的主要引用。前几年和随后几年关于RasMol的出版物列在拉斯莫尔。莫尔维兹。组织.
- ↑ 伯恩斯坦父子公司.
- ↑ Herbert J.Bernstein，纽约奥克代尔道林学院计算机科学教授.
