ConSurf快速分析程序

来自Proteopedia

蛋白质组链接蛋白质组链接

下面是一个快速的蛋白质分子染色程序进化守恒。此程序不一定能提供最高质量的结果，但会为您提供通常足够的初步结果。（本页是对如何查看保守区域.)

1. 转到ConSurf服务器.
2. 检查氨基酸.
3. 检查是的有一个已知的蛋白质结构。
4. 输入您的PDB代码（或上传您的pdb文件)然后单击下一步按钮。
5. 从下拉列表中选择一条链条链标识符菜单。（ConSurf只能分析一次一条链。通过检查中的模型来获取链IDJmol简介.
   
   
6. 检查不您没有要上传的多序列比对（MSA）。
7. 不用担心，您可以将现在显示的所有设置保留为默认值。
8. 检查自动地用于“选择同系物”。
9. 将所有其他内容保留为默认值，输入职务（可选）。
10. 输入您的电子邮件地址在底部插槽中！这样可以避免丢失结果并重新进行。
11. 单击提交按钮。
12. 处理可能需要几分钟或几个小时。之后已完成出现在作业状态页面，向下滚动至最终结果然后单击使用Jmol中的第一眼查看ConSurf结果.

为什么？Jmol简介? 因为它有快捷的工具，很容易看到盐桥、阳离子-π相互作用、残基结合配体/底物/抑制剂、参与蛋白质交联或您指定的任何残留物。有关这些工具的介绍，请参见第一眼/可视化保护.

想要确保您的ConSurf结果是最佳的，以回答您的问题吗？请参见解释ConSurf结果.

有时ConSurf服务器上的FirstGlance版本不是最新的。最新版本号显示在第一眼。J摩尔。组织。要在最新版本中显示ConSurf结果：

• 在ConSurf结果页面上，单击带有ConSurf的PDB文件在其标题中显示结果，以Jmol为单位进行第一次浏览以下载PDB文件。然后在第一眼。J摩尔。组织，上传下载的文件。

• 赖特单击链接带有ConSurf的PDB文件在其标题中显示结果，以Jmol为单位进行第一次浏览，然后选择“复制链接”。然后在第一眼。J摩尔。组织，单击输入分子的URL并通过链接进入插槽。这要求ConSurf作业是最新的，因为结果将在服务器上保留有限的时间。