蛋白质体:策略

来自Proteopedia

跳转到:航行,搜索

目录

账户

帐户名称

在Proteopedia中,每个登录帐户名都应是帐户持有人的真实全名,因为他们的名字会显示为科学出版物的作者。中间名可以省略或缩写。与科学出版物中的标题一样,省略了标题(如教授或博士)。

账户名称应具有鉴于名字在前姓氏最后,这是英语科学出版物中的习惯。(文章可以使用其他语言;参见蛋白质体:语言.)

用户页面

创建帐户时,还将创建用户页面,例如用户:Jaime Prilusky用户:Joel L.Sussman。你的用户页面是一个很好的地方,可以保存你正在撰写的文章、你经常引用的文章、你的贡献列表等的链接。

责任和信用

账户持有人的每一笔供款都将在下页底部标记其真实全名(账户)Proteopedia页面贡献者和编辑,更具体地说,是针对历史因此,会员对其贡献的准确性负责,并因此获得积分。将分配开发良好的文章DOI程序.

地理位置、机构隶属关系和位置

为了获得账户,会员需要确定他们的城市、州或省、国家及其机构隶属关系,就像给科学出版物的作者一样。还有他们的职位,例如学生、研究生、博士后、教职员工、研究员、教授。此信息显示在每个成员的用户页面上,以帮助识别他们。提及机构附属关系纯粹是为了确定身份,并不意味着其机构批准其贡献。

没有共享帐户

每个供款人必须拥有自己的个人账户。多人共享一个账户将导致账户终止并禁止Proteopedia访问。

无重复帐户

每个成员只能有一个帐户。试图创建多个帐户将导致终止这些帐户并禁止Proteopedia访问。

维基百科链接

  1. 任何与结构生物学相关的主题都应该在Proteopedia中有自己的页面,即使最初该页面只包含维基百科中该主题对应页面的链接
  2. 如果该页面存在于Proteopedia中,则应链接到该页面,而不是维基百科。
  3. 如果页面主题是一种蛋白质或分子,特别是可以从Jmol小程序和场景中受益的蛋白质或分子来描述其结构,那么在Proteopedia中指向空页面的“红色”链接可能会鼓励用户在Proteopdia中创建页面,并且应该创建该页面。
  4. 晶体学家的姓名应链接到Proteopedia中,如果该页面存在,则该页面可能包含指向她/他的维基百科条目的链接。
  5. 当维基百科有一篇与Proteopedia相关的文章时,人们应该毫不犹豫地链接到维基百科。然而,这种到维基百科的链接几乎总是应该在Proteopedia中具有相同主题的页面上创建。没有理由在Proteopedia中复制维基百科中的内容。然而,Proteopedia通常希望强调或总结某个主题的特定方面,而维基百科则试图做到广泛和全面。这就是以下规则的原因。
  6. 对于大多数主题,当然当有疑问时,最好在Proteopedia中创建一个新页面,然后在该Proteopediapage上为同一主题添加一个到维基百科的链接。这为强调对Proteopedia重要的主题方面提供了一个位置,尽管这些方面可能在维基百科的文章中有所提及。例如,蛋白质数据库上的Proteopedia页面可以强调每周发布新条目,并且在每周发布后,会自动为每个新条目创建新的Proteopedia页面,这一过程称为“播种”。然而,蛋白质数据库上的Proteopedia页面不需要重复维基百科所说的每一句话,当然应该链接到维基文章以获取更多信息。此外,我们不想在Proteopedia文章中分散到维基百科文章的链接,然后才意识到,最好让所有这些链接都指向Proteopediaarticle(反过来链接到Wikipedia)。这可能会产生维护问题,尝试查找和更新所有这些链接。
  7. 如果该页面与蛋白质或分子无关(如生物体的页面),并且该页面在维基百科中存在并且很有用,则可以直接链接到维基,但最好不要链接到Proteopedia页面的主体中(请参阅外部链接本页的第节)
  8. 维基百科链接应插入为{{Wikipedia|PAGE NAME}}}

外部链接

避免在Proteopedia文章的正文中放置外部链接,因为Proteopedia页面旨在关注Proteopeedia中的专门内容。将外部链接放在文章末尾附近的一个部分,最好将此部分称为“外部资源”因为它更好地描述了Proteopedia的页面应该链接到的外部站点的类型,并且清楚地表明,本节旨在支持用户查找具有重要价值的相关内容,而不是包罗万象的内容。这个维基百科的外部链接部分阐述了外部链接的概念,可以作为Proteopedia用户的路线图。

创建新主题页面,避免编辑带有PDB代码标题的页面

请制作主题页面如果你感兴趣的话题还没有。标题为的页面PDB识别码最初自动创建(“种子”),并包括PubMed出版物摘要从报告PDB公司条目。这些种子页面有一个标准化的格式,我们希望它保持相对恒定,以便它们能够提供相关信息。然而,主题页面的约束较少。您可能希望从使用相关结构中的种子页面填充主题页面开始。主题页面可以是手动创建的内容。如果你确实写了一个更好的概述,请在主题页面上突出它,不要觉得必须保留相应的摘要。不过,摘要应该保留在种子页面上。我们希望您在主题页面上进行编辑,并链接到相应的种子页面。此外,将带有相关PDB代码的种子页面链接到您的主题页面;这是一个例外,我们鼓励编辑种子页面。您的主题页面应该突出显示对非专业人士试图理解相关大分子的结构和功能非常重要的信息,并且应该用分子场景来说明这些信息,使Proteopedia与其他wiki不同。如果您有关于主题或结构的详细信息,请将其放在页面底部,或者制作一个与更一般主题相关的单独页面。

避免模糊页面标题

请避免使用新标题主题页面这对非专业人士来说没有意义。例如,专业缩写的标题,例如新加坡会计准则,Cyt2Ba细胞,编号1、和病毒E1/病毒E2对大多数Proteopedia用户来说没有意义。使用移动选项卡中,这些页面已重新命名。移动(重命名)页面时重定向页面是根据旧标题自动创建的,因此搜索旧标题仍会找到具有新标题的页面。这就是为什么单击以下链接新加坡会计准则转到更长、更具普遍意义的标题。您将看到标题下方有一条注释,表示您已被重定向。

请不要删除摘要或在PDB代码标题的页面上进行大量编辑

标题为的页面PDB识别码最初自动创建(“种子”),并包括PubMed出版物摘要从报告PDB公司条目。即使你对论文或结构写了更好的概述,请不要删除已发布的摘要。但是,无论如何,您都不应该编辑标题为PDB标识码的页面。我们希望您在主题页面上进行编辑,并链接到适当的种子页面。此外,将带有相关PDB代码的种子页面链接到您的主题页面;这是一个例外,我们鼓励编辑种子页面。如果你确实写了一个更好的概述,在主题页面上突出它,并且不需要相应的摘要。

受保护的页面

任何注册用户(登录后)都可以创建受保护的页面。怎么用?请参阅帮助:Protected_Pages. 保护页面意味着其作者不必担心其他人更改了内容。然而,Proteopedia中的所有内容都可以免费复制、编辑、使用和改编(单击页面左下方的GNU Free Document License图标了解详细信息)。因此,任何人都可以复制将受保护页面的内容转换为可公开编辑的页面,在那里可以以真正的wiki方式进行演变。同样,您可以将其复制到您自己的受保护页面中,在那里您可以根据需要对其进行编辑。示例:

  • 用户:Eric_Martz/核小体是受保护的页面。只有作者才能编辑它。
  • 核小体包含上述页面内容的副本以及其他材料。任何登录用户都可以编辑此页面。

清晰可见的PDB代码

请确保每页都清楚地显示PDB代码对于原子坐标用于该页上显示的分子场景。放置PDB代码的标准位置是Jmol标题中分子场景的下方。如果一个Jmol用于显示多个PDB条目,则只有这样,PDB代码才能移动到文本中(靠近显示它们的第一个绿色链接)。如果您修改pdb文件,说明代码仍然很重要,请参阅下一节。

更改的PDB文件

任何pdb文件必须注明已修改并上传至Proteopedia的内容,最好在上传文件时的摘要部分以及修改后的PDB文件出现的页面中解释修改内容。如果你想让解释修改的注释不那么突兀,可以在参考脚注.

理论模型

从广义上讲,理论模型指并非直接从经验原子分辨率数据(如晶体X射线衍射)或足够数量的核磁共振约束中导出的任何分子模型。因此,“理论模型”包括比较或同源模型,从头算/从头开始模型,或对经验模型的任何修改,包括小到单个氨基酸突变的变化。

侧链在理论模型中的位置,例如比较模型,或理论上具有附加突变或构象变化的模型,通常是不可靠的。主干构造或褶皱通常不可靠从头算/从头开始理论模型。

1390个理论模型历史上存放在蛋白质数据库但是2002年从主数据库中删除。在Proteopedia中为这些理论模型自动生成的页面由于其不可靠性而不显示这些结构(请参见类别:理论模型).

Proteopedia用户可以免费显示上传的理论模型,只要它被清楚地识别。建议用于此类识别的方法在蛋白质体:食谱#理论_模型.

示例

主页面

这个主页面蛋白质体的结构必须简明扼要。然而,用户应该能够通过从主页开始的不超过两个链接来回答他们的任何问题。用户应该清楚地知道要遵循哪些链接才能得到他或她的问题的答案。例如,如果用户想要了解如何使用场景创作工具的详细说明,可以首先单击主页上“想要贡献”部分的“编辑帮助页”链接,然后在“编辑帮助页面”上,通过目录快速找到指向场景创作工具帮助页的链接。

页面贡献者和编辑vs.内容贡献者

请参阅Proteopedia页面贡献者和编辑.

个人工具