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蛋白质组链接蛋白质组链接单碳代谢指转移单个碳的生化途径。通常,这些反应由使用辅助因子或修复基团的酶催化,如S-腺苷蛋氨酸、四氢叶酸、黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)或钴胺素,其中许多是维生素衍生的[1][2]转移的碳可能具有不同的氧化状态,最终形成不同的官能团,如甲基、甲基、甲酰基或羧酸盐。单碳转移反应在氨基酸和核酸生物合成、表观遗传学和细胞氧化还原状态中发挥作用[3].
概述
下图显示了单碳代谢的代谢物(正方形)和酶(椭圆形)的概述。您可以将鼠标悬停在上面并单击选定的代谢物和酶,以了解有关该途径各个部分的更多信息。
叶酸循环
叶酸循环将代谢物二氢叶酸(DHF)和四氢叶酸(THF)与四种不同的甲基化形式的四氢叶酸酯连接起来。甲基化形式按单碳单元氧化状态的增加顺序依次为5-甲基四氢呋喃、5,10-亚甲基四氢氰酸、5,10-甲苯基四氢氰酸酯和甲酰基四氢氰酸甲酯。虽然该途径中的大多数转化都可能在任一方向进行,但从5,10-甲烯基THF到DHF(将甲基转移到dUMP)和从DHF到THF(NADPH还原)的反应只在一个方向进行。蛋氨酸合成酶通过将甲基从5-甲基四氢呋喃转移到同型半胱氨酸来连接叶酸和蛋氨酸循环。
蛋氨酸循环
作为的辅因子数百种酶S-腺苷蛋氨酸是最常见的甲基供体辅因子。捐献甲基后,剩余的S-腺苷同型半胱氨酸水解为腺苷和同型半月氨酸。同型半胱氨酸甲基化(主要通过连接叶酸循环和蛋氨酸循环的蛋氨酸合成酶)形成蛋氨酸,然后与ATP反应形成S-腺苷蛋氨酸(和三磷酸)。与叶酸循环不同,这些反应是单向的,每个循环的费用相当于三个ATP到ADP反应的费用。
碳的来源和目的地
碳的来源包括丝氨酸转化为甘氨酸(通过丝氨酸羟甲基转移酶)甲酸(HCOOH[4],甘氨酸分解(甘氨酸切割系统)和脱甲基反应得到的甲基。
单碳单位用于合成核酸、氨基酸、脂质和各种其他代谢物。叶酸循环直接为从dUMP合成dTMP、嘌呤合成和甲酰化蛋氨酸提供甲基。通过为蛋氨酸循环提供甲基,它间接地为DNA、神经递质、各种脂质和许多其他代谢物的甲基化提供甲基。
在下面的动画中,显示了两个场景。在这两种情况下,碳通过从丝氨酸中除去一个碳单元进入循环。在一种情况下,碳被用于甲基化dUMP以生成dTMP用于DNA合成,在另一种情况中,碳被用作甲基化DNA,作为表观遗传修饰的一部分。
路径中特定酶的页面链接
进一步阅读
工具书类
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