域组织
蛋氨酸合成酶包含四个结构域,每个结构域都具有独特的功能,与作为甲基载体的Cob(I)alamin结合。在N末端,5-me-THF在催化循环中向Cob(I)alamin提供一个甲基,然后Cob(Ⅰ)alammin将其提供给同型半胱氨酸以形成蛋氨酸。然而,大约每隔2000个循环,钴(I)阿拉明就会被氧化(如下图中的深黄色所示),现在需要还原和再甲基化来触发再活化循环。在C末端,S-腺苷蛋氨酸或SAM以黄酮为电子供体供体供奉甲基[4].
MS的完整结构尚未确定。
这里显示的是结构的字母折叠算法中,N端2个域和C端2个domins的实验结构重叠。
如下图所示,预测对单个域的内部结构具有很高的置信度,但对相对方向没有信心。
在每个循环中,为了使甲基转移成功,域必须位于足够靠近钴胺的位置。MS的构象允许底物呈现给钴胺以发生反应。
钴胺结合
钴胺素结合结构域具有一个特殊的特征,即它最自然地以保护性构象存在,以防止不必要的化学反应发生(PDB:1BMT)。这被称为“封盖”机制。
DMB,在被组氨酸残基从钴中置换出来,形成Me-Cob(III)阿拉明[5].
Cap域
当B12不与其他三个底物结合域中的一个结合时,它受到.
在Cob(I)alamin结合域中作为第五配体进出B12结构域。他的759通过氢键与Asp 757和Ser 810结合,形成配体三联体,提高了催化循环期间甲基转移的效率(未显示)。戴上他的帽子,帽子戴在科巴拉明身上。当与激活域相互作用时,没有盖子的空间,钴胺有点移到组氨酸的范围之外(在晶体结构中,他们使用His759Gly突变来支持His-off构象)。[4].
钴胺活化
大约每2000个周期,钴胺素需要通过S-腺苷蛋氨酸(SAM)甲基化。为了确定活化构象的结构,使用了突变体H759G。这种突变使与激活结构域结合的帽合构象中具有B12结构域的酶的比例最大化。由于同型半胱氨酸与S-腺苷蛋氨酸的甲基化会导致无效循环,因此必须仔细调节B12结构域和激活结构域的途径。因此,应保留这一步骤,以将B12从+2钴氧化状态中解救出来,然后使用5-me THF中的甲基基团恢复同型半胱氨酸的甲基化。