等电点

来自Proteopedia

蛋白质组链接蛋白质组链接

等电点（pI）是蛋白质为零的pH值净费用当pH值高于等电点时，蛋白质带负电荷，当pH值低于等电点则带正电荷。您可以使用在线资源轻松计算蛋白质的等电点：

目录 1 使用EMBL WWW网关计算等电点服务的等电点 2 或者，使用蛋白质计算器计算等电点 三 另请参见 4 内容属性

使用EMBL WWW网关计算等电点服务的等电点

2013年5月，欧洲工商管理局（EMBL）通往太平洋岛屿协会（pI）的门户似乎停止服务。使用以下替代方法。

• 首先，得到你感兴趣的蛋白质的一个字母的氨基酸序列。
  • 对于结构已解决的蛋白质来说，一种简单的方法是：访问PDB ID页面RCSB蛋白质数据库。在右上角的“Dsiplay文件”下，单击“FASTA序列”链接并下载FASTA格式的所有链。打开文本文件并阻止感兴趣链的序列（不包括注释行开头>），然后将其复制到剪贴板。
  • 或者，对于具有已解决结构的蛋白质，请转到OCA浏览器数据库并在搜索中输入您的PDB代码。或使用每个已解决结构的Proteopedia页面上的OCA链接。然后在OCA上向下滚动到Sequence-derived information（序列衍生信息）（靠近底部），单击一条链的单字母氨基酸序列的链接，并将该链的序列复制到剪贴板。
  • 对于从核苷酸序列开始，有许多工具可用于“虚拟”翻译：
    • 在ExPASy-翻译工具在序列中粘贴的框下面选择“压缩”作为输出格式。
    • 另一个在线站点根据可用核苷酸序列的状态，列出了一些可能有用的工具。

• 第二，转到EMBL WWW等电点服务网关，将序列粘贴到框中，然后按按钮。

• 警告：粘贴的序列必须是大写一个字母的代码。如果你粘贴一个小写序列，你会得到pI=6.014999，它只用于主干，因为它不识别小写氨基酸！

或者，使用蛋白质计算器计算等电点

1. 首先，得到你感兴趣的蛋白质的一个字母的氨基酸序列。
   1. 有关一些方法，请参见上文。
   2. 或者对于发表在PDB公司，在Proteopedia中找到标题为PDB代码的页面，然后单击亚欧理事会在结构下的参考资料部分。
      1. 在OCA中的PDB代码中，向下滚动到Sequence-derived信息（靠近底部）。
      2. 单击链接可查看单链的单字母氨基酸序列。
2. 复制序列并粘贴到Christopher Putnam的大框中蛋白质计算器.
3. 选中右侧Charge下的第一个框，然后单击Submit Query。

另请参见

• 净费用

内容属性

第一种计算方法改编自词汇表随之而来的Eric Martz的蛋白质探索者。第二部改编自埃里克·马茨教授的课程大纲.