流感血凝素

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基于MSOE生物分子建模中心5hmg的物理模型
基于的物理模型5毫克来自MSOE生物分子建模中心

流感血凝素(PDB代码5 hmg)是流感病毒表面发现的两种蛋白质之一。血凝素在宿主细胞识别和膜融合中起着关键作用。

目录

结构

血凝素蛋白最初被组装成同源素。这三种完全相同的蛋白质都由549个氨基酸组成。在病毒成熟的后期,单体被蛋白酶裂解,生成两条链,称为HA1和HA2。

基于5 hmg

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HA1型

这个从结构底部开始,在结构顶部形成球状灯泡。这种球状结构含有唾液酸受体结合位点。受体结合囊中的氨基酸决定了病毒的特异性,也就是说,它是否能感染人类、鸟类或猪细胞。由于蛋白质的这一部分暴露最频繁,它也是免疫反应最为瞄准的部位,也是受突变影响最大的部位。

HA2型

这个主要负责促进膜融合。蛋白质的C末端嵌入病毒膜。N端,称为由10种疏水性氨基酸组成。当蛋白质经历pH诱导的构象变化时,该融合肽嵌入宿主细胞膜。此外,嵌入病毒膜的C末端重新排列,使两个膜更紧密地结合在一起,促进融合。

pH引起的构象变化

病毒与细胞膜结合后,细胞通过内吞作用吞噬病毒囊。内体衬里上包括离子泵,最初用于将离子泵出细胞并保持适当的pH水平。作为内胚体衬里的一部分,泵继续泵送离子,但现在泵送到末端体。这导致病毒包膜周围的pH值变酸。

当pH值达到5.5时,HA1蛋白改变其位置,重新排列以允许HA2蛋白进入内体膜。HA2链开始重新排列,蓝色的环在pH5处重新折叠成螺旋。这导致HA2链转化为自然界中已知最长的α螺旋。这使得融合肽嵌入到内胚层膜中。HA2的C末端也会重新排列,使病毒膜靠近内胚体膜,并允许膜融合发生。这使得病毒RNA从包膜释放到宿主细胞细胞质中。

用于解释原理图、分子动力学模拟和变形动画膜融合有关详细信息,请参见SARS-CoV-2穗蛋白融合转化.

视频

~我们希望很快能有一个简短的视频,展示这种蛋白质的物理模型和上面讨论的一些概念。

流感血凝素的三维结构

血凝素

外部链接

MSOE生物分子建模中心


本页显示的物理模型是由MSOE生物分子建模中心设计和建造的。有关物理蛋白质建模的更多信息,请访问缅甸中央银行网站http://cbm.msoe.edu/.

其他资源

有关更多信息,请参阅:流感

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