组氨酸-酪氨酸蛋白质交联

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某些细胞色素C氧化酶中组氨酸和酪氨酸之间的共价键[1][2][3][4][5]和过氧化氢酶[6][7]在催化位点附近的多肽链之间进行交联。

目录

示例

  • 1块1999:大肠杆菌过氧化氢酶HPII。
  • 第1版542003年:牛心脏细胞色素c氧化酶。
  • 2年2012:嗜热菌细胞色素caa3氧化酶。
  • 第7组2021年:牛心脏细胞色素c氧化酶。

检测和可视化

Jmol简介自动检测并提醒您存在六种共价蛋白质交联中的任何一种(见下表)。它提供了“一键式”工具来放大和详细检查任何假定的交联,包括显示近端电子密度图参见实用指南蛋白质交联的初步评估FirstGlance还提供了一种工具,用于更常见的二硫键交联的清晰可视化。

其他蛋白质交联

除上述债券外,其他多肽链间共价交联包括:

致谢

感谢魏春高(德国弗赖堡大学)指出了必要的更正。

参考文献和注释

  1. Tsukihara T、Shimokata K、Katayama Y、Shimada H、Muramoto K、Aoyama H、Mochizuki M、Shinzawa-Itoh K、Yamashita E、Yao M、Ishimura Y、Yoshikawa S。细胞色素c氧化酶的低自旋血红素是质子泵送过程的驱动元素。美国国家科学院院刊2003年12月23日;100(26):15304-9. Epub 2003年12月12日。PMID:14673090数字对象标识:10.1073/pnas.2635097100
  2. 尽管年债券存在于第1版54第1版第55页由筑原出版等。,他们2003年的论文中没有提到这些问题。
  3. Buse G,Soulimane T,Dewor M,Meyer HE,Bluggel M。细胞色素氧化酶活性部位铜配位组氨酸-酪氨酸交联的证据。蛋白质科学。1999年5月;8(5):985-90. PMID:10338009数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1110/ps.8.5.985
  4. Kaila VR、Johansson MP、Sundholm D、Laakkonen L、Wistrom M。细胞色素c氧化酶中CuB位点的化学及其独特的His-Tyr键的重要性。Biochim生物物理学报。2009年4月;1787(4):221-33. doi:10.1016/j.bbabio.2009.01.002。PMID:19388139数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1016/j.bbabio.2009.01.002
  5. Ehudin MA、Senft L、Franke A、Ivanovic-Burmazovic I、Karlin KD。新的异卟啉的形成和反应性:对理解细胞色素c氧化酶中Tyr-His交联辅因子生物发生的意义。《美国化学学会杂志》2019年7月10日;141(27):10632-10643. doi:10.1021/jacs.9b01791。Epub,2019年6月26日。PMID:31150209数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1021/jacs.9b01791
  6. Bravo J,Fita I,Ferrer JC,Ens W,Hillar A,Switala J,Loewen PC。大肠杆菌过氧化氢酶HPII中组氨酸和必需酪氨酸之间新键的鉴定。蛋白质科学。1997年5月;6(5):1016-23. PMID:9144772数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1002/pro.5560060507
  7. Bravo J,Mate MJ,Schneider T,Switala J,Wilson K,Loewen PC,Fita I.大肠杆菌过氧化氢酶HPII在1.9 A分辨率下的结构。蛋白质。1999年2月1日;34(2):155-66. 数字对象标识:10.1002/(sici)1097-0134(19990201)34:2<155::aid-prot1>3.0.co;第2页。PMID:10022351

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