异原子

在PDB数据文件格式对于大分子模型，每个原子被指定为atom或HETATM（代表杂原子). 原子是为中的原子保留的标准残留物蛋白质、DNA或RNA。HETATM应用于非标准残留物蛋白质、DNA或RNA以及其他种类的原子，如碳水化合物、底物、，配体、溶剂和金属离子。

当标准氨基酸、核苷、核苷酸（或碱基）是“配体”时，也就是说，当它们被分离出来时，游离单体残基，而不是多肽/蛋白质或多核苷酸链的一部分，则被称为HETATM。例如甘氨酸第6轮第6轮，色氨酸6小时和胞苷-5’-单磷酸“C”1公里.

标准氨基酸二肽根据公约，配体也被指定为HETATMPDB公司例如，Ala-Pro2年二肽配体被赋予与其结合的链相同的链ID。相反，三肽和较长多肽被指定为ATOM并给定唯一的链ID。例如，Tyr-Pro-Tyr1小时.

在RCSB公司。组织，使用高级搜索和查询类型化学品ID，您可以在数据库中找到包含特定化学成分的所有条目。例如，在2019年12月，有五个条目包含PYL（在非标准残留物).

中所有化合物的完整列表PDB公司包括氢、3D结构和债券订单世界蛋白质数据库化学成分词典。这包括所有标准残留物以及非标准残留物，碳水化合物加合物，配体和异质群体每周更新一次新发布的条目。

另请参见