PDB文件的标题

来自Proteopedia

蛋白质组链接蛋白质组链接

PDB文件在中包含原子坐标和附加注释集管段。标题部分是以MODEL或ATOM开头的第一条记录（行）之前的所有内容。以下是标题的摘录1ijw公司:

头部DNA结合蛋白/DNA 2001年4月30日1IJW水介导HIN重组酶DNA识别的标题测试第2篇：系统突变。压缩机模具ID：1；压缩机2分子：5'-D（*TP*GP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*GP*AP*TP*AP*GP*A）-压缩机3 3'；压缩机4链条：A；压缩机5工程：是；...晶体1 85.749 81.136 44.596 90.00 90.00 90.00C 2 21 8原始X1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000ORIGX2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 0.00000ORIGX3 0.000000 0.000000 1.0000000.00000比例尺1 0.011662 0.000000 0.000000 0.00000比例尺2 0.000000 0.012325 0.000000 0.00000比例尺3 0.000000 0.000000 0.022424 0.00000

标题部分不要与HEADER记录混淆，它是PDB文件中的第一行，并且总是一行。这是的标题记录1个ijw:

头部DNA结合蛋白/DNA 30-APR-01 1IJW

X射线晶体模型的标题部分规定了重要信息，包括标题、分子类型和来源（COMPND、source）、结构测定方法（EXPDTA）、出版物（AUTHOR、JRNL、REMARK 1）、一系列REMARK记录中的实验细节、生物组装（REMARK350）、，缺失残基（REMARK 465）、几何和立体化学异常（REMARK 500）、数据库链接，如UniProt标识符（DBREF）、序列差异（SEQADV）、建模聚合物序列（SEQRES）、杂合物名称（HETNAM、HETSYN）、二级结构（HELIX、SHEET）、，以及晶体单元的描述（CRYST、ORIGX、SCALE）等。

例子

右键单击这些链接以在新的浏览器选项卡中打开：

• PDB文件的标题部分1hxw.
• 整个PDB文件1hxw标题部分之后是ATOM和HETATM记录。

查看标题部分的方法

在Proteopedia中，在标题为PDB代码（例如1小时x周):

• 点击第一眼。在第一眼中，向下滚动并单击显示更多详细信息，然后单击查看PDB文件.
• 单击OCA。在“数据检索”的“非对称单位”下，单击[仅标题]。
• 单击PDBe。在那里，单击查看（页面右侧），然后单击PDB标题。
• 单击RCSB。在那里，单击显示文件、PDB格式（标题）。