酯类蛋白质交联

来自Proteopedia

蛋白质组链接蛋白质组链接

埃斯特之间的交联丝氨酸和羧基末端从2001年开始，已观察到蛋白酶的数量（见下面的示例）。这些是自动催化形成的。类似的酯交联存在于蛋白酶中，其中捕获了催化过程中的酯中间体（参见下面的示例）。

之间的酯键苏氨酸和谷氨酰胺侧链也可以在多肽链之间形成共价交联^[1]2013年首次在假定的表面锚定粘连蛋白的重复域中观察到产气荚膜梭菌（革兰氏阳性）^[1][2]，序列分析表明“这些分子内酯键是革兰氏阳性细菌细胞表面粘附蛋白的一个普遍而常见的特征”^[1]在所研究的实施例中，Thr-Gln酯键发生在免疫球蛋白样结构域的第一条和最后一条β链之间，增加了热稳定性和对蛋白酶的抗性^[1]。含有这种酯交联的结构“共同点是它们很长很薄，但也会受到较大的机械剪切应力和富含蛋白酶的环境的影响”^[1].

目录 1 示例 2 检测和可视化 三 其他蛋白质交联 4 另请参阅 5 工具书类

示例

Ser-C-终端：

• 1个季度（2001）：胰蛋白酶中捕获的酯类催化中间体。
• 2010年1月（2001）：酯类催化中间体被捕获在突变脱羧酶中。
• 2个pnl（2007）：感染性胰腺坏死病毒的蛋白酶VP4。
• 第3页06（2011）：Telina病毒1的蛋白酶VP4。
• 4izk公司,4izj公司（2013）：黄尾腹水病毒蛋白酶VP4。

Thr-Gln公司：

• 4镍6（2013）：重复域1产气荚膜梭菌CPE0147表面锚固粘合剂。
• 400万（2013）：重复域1和域2产气荚膜梭菌CPE0147表面锚固粘合剂。

检测和可视化

Jmol简介当出现蛋白质交联时会提醒您，并提供方便的链接，可以放大并详细显示每个交联。查看电子密度图只需再点击一次。使用上面的链接到4个字符PDB代码转到名为4个字符的Proteopedia页面PDB代码。在那里，单击“第一眼”。在FirstGlance中，单击“工具”选项卡，然后单击“蛋白质交联”。请参阅实用指南蛋白质交联的初步评估.

其他蛋白质交联

除上述酯键外，其他多肽链间共价交联包括：

• 二硫键
• 异肽键
• 硫酯蛋白交联
• 硫醚蛋白质交联
• 组氨酸-酪氨酸蛋白质交联
• 赖氨酸-半胱氨酸NOS键

另请参阅

• 酯化作用

工具书类

1. ↑^{1 1.1 1.2 1.3 1.4}Kwon H、Squire CJ、Young PG、Baker EN。自催化生成的Thr-Gln酯键交联稳定细菌细胞表面黏附素的重复性Ig-结构域轴。美国国家科学院院刊2013年12月16日。PMID：24344302数字对象标识：http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1316855111
2. ↑Baker EN，Squire CJ，Young PG.革兰氏阳性菌细胞表面粘附素中的自生共价交联.生物化学-社会化学反式。2015年10月；43(5):787-94. doi:10.1042/BST20150066。PMID：26517883数字对象标识：http://dx.doi.org/10.1042/BST20150066