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一种蛋白质领域通常是指一个氨基酸序列,它独立于全长序列的其余部分折叠成一个紧凑稳定的结构。水溶性域通常具有疏水核。一些小的全长蛋白质由单个结构域组成,但许多蛋白质有两个或多个结构域。一个结构域的长度通常为100-250个氨基酸[1],但有时可以更短或更长。

2006年,CATH数据库中只有一个域的链的平均长度为159[2]2006年,CATH中64%的蛋白质结构是单结构域链。27%为双域链[2].

示例:

  • 9英寸(猪):胰岛素含有51个氨基酸,是最小的稳定折叠蛋白质结构域之一,位于蛋白质和。它有一个疏水的核心。人前胰岛素由110个氨基酸合成。去除24个氨基酸的信号序列后,剩下的86个氨基酸的胰岛素原在两个地方被裂解,形成两条蛋白质链的成熟二硫键二聚体。链B是残基1-30。链A是残基66-86(长度21)。“C肽”,残基33-63(长度31),作为单独的生物活性肽释放。成熟的人胰岛素与猪在单个氨基酸上不同:B链的末端残基分别是Thr和Ala。维基百科有关于胰岛素合成C肽。另请参阅胰岛素结构与功能.
  • 1盎司:溶菌酶是由130个氨基酸组成的单链。它折叠成具有疏水核的单结构域。
  • 2小时:形成血红蛋白(四聚体)的四条链中的每一条都折叠成由α-血红素组成的单一结构域。人类血红蛋白的每个结构域(链)长度为141-146个氨基酸。
  • 1个igy:免疫球蛋白G(抗体)由4条链中的12个结构域组成。这些免疫球蛋白超家族域由β-表组成。这两条重链中的每一条都有4个结构域,而这两条轻链中的每一条都有2个结构域。这些结构域的长度约为110个氨基酸。每条重链有两对由约20个氨基酸长的柔性连接体连接的结构域。

有关更多信息,请参阅维基百科中的蛋白质域.

另请参见[1]还有这个它的摘要.

工具书类

  1. 1 1.1蛋白质储备的演变。Cyrus Chothia、Julian Gough、Christine Vogel和Sarah A.Teichmann(2003年)。科学300:1701-3。PMID:12805536
  2. 2 2.1Greene LH、Lewis TE、Addou S、Cuff A、Dallman T、Dibley M、Redfern O、Pearl F、Nambudiry R、Reid A、Sillitoe I、Yeats C、Thornton JM、Orengo CA。CATH域结构数据库:新协议和分类级别为探索进化提供了更全面的资源。核酸研究,2007年1月;35(数据库问题):D291-7。doi:10.1093/nar/gkl959.,Epub 2006年11月29日。PMID:17135200数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkl959

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