ConSurf快速分析程序

来自Proteopedia

蛋白质组链接蛋白质组链接

已更新2024年7月.

这里有一个快速程序通过以下方法给蛋白质分子着色进化守恒（本页是对如何查看保守区域.)

1. 转到ConSurf服务器.
2. 输入您的PDB代码（或上传您的pdb文件).
3. 从下拉列表中选择一条链选择链标识符菜单。（ConSurf只能分析一次一条链条。通过检查中的模型来获取链IDJmol简介.)
   您可能会在ConSurf数据库中获得预先计算的结果ConSurf公司数据库，但不能用于Jmol简介，它有许多强大的便利可视化保护模式。继续执行以下步骤以获得FirstGlance兼容的结果。
4. 输入职务，其中应包括PDB代码或蛋白质名称。
5. 输入您的电子邮件地址。
6. 如果这是你第一次尝试这种蛋白质，请点击使用默认参数提交。如果默认结果需要改进（请参阅解释ConSurf结果和限制ConSurf分析单一功能蛋白质)，您可以单击手动选择运行参数尝试改善结果。
7. 处理可能需要几分钟或几个小时。之后已完成出现在ConSurf作业状态页面，单击转到结果.

为什么？Jmol简介?因为它已经许多优点它有快捷的工具，可以很容易地看到盐桥、阳离子-π相互作用、残基结合配体/底物/抑制剂、参与蛋白质交联或您指定的任何残留物。有关这些工具的介绍，请参见第一眼/可视化保护.

想要确保您的ConSurf结果是最佳的，以回答您的问题吗？请参见解释ConSurf结果.

在第一眼中查看结果的两种方法：

• 在ConSurf结果页面上，打开高分辨率图形和PDB文件，然后单击下载ConSurf PDB文件以在Jmol中进行首次浏览。然后在第一眼。Jmol（焦耳）。组织，继续上传下载的文件。

• 赖特单击链接下载ConSurf PDB文件以在Jmol中进行首次浏览，然后选择“复制链接”。然后在第一眼。Jmol（焦耳）。组织，单击输入分子的URL并将链接粘贴到插槽中。这要求ConSurf作业是最新的，因为结果将在服务器上保留有限的时间。