编钟

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编钟是一个免费的web浏览器插件,可以显示3D化学或高分子结构的交互式旋转/缩放渲染。也称为MDL蜂鸣器,Chime是由MDL信息系统1996年,仅适用于Microsoft Windows。

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编钟的起源

Chime的渲染和分子可视化命令脚本语言改编自早期程序的C源代码,RasMol公司由Roger A.Sayle开发,并慷慨地置于公共领域。蒂姆·马菲特他是MDL当时雇用的计算化学家,是Chime的主要架构师和程序员。虽然MDL的主要兴趣是小型有机化合物的可视化,但Maffett有远见,保留了RasMol对大分子的支持,并将其扩展。结果是,该项目从20世纪90年代末到2000年代初是同类项目中最好的,这在生物化学家、制药公司以及化学家中广受欢迎。

编钟的流行与衰落

Chime在生物化学家、生物化学教育工作者、制药公司以及化学家和化学教育工作者中非常受欢迎。2008年,超过1000个公开可用的网站和教程使用了Chime(如现已失效的文档所示世界生物分子可视化资源索引十年来,Chime一直是同类产品中的佼佼者,但由于MDL缺乏持续开发,苹果Mac OS X缺少一个版本,以及MDL拒绝向Chime用户社区开放其源代码,Chime's的受欢迎程度有所下降。到2005年左右,焦摩尔已经成为一个优越、自由、开放源代码更换。

编钟动作屏幕截图

血红蛋白教程拉斯莫尔随后于1996年被转运至Chime,当时未签字焦摩尔Java小程序,然后到JSmol公司早期版本的屏幕捕获视频于2018年在Windows 98虚拟机上制作:

还有一个血红蛋白教程的详细历史.

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