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蛋白质组链接蛋白质组链接关于氨基酸，请看维基百科中的氨基酸.
22标准氨基酸和助记符
以下是二十二种标准氨基酸的名称，包括三个和一个字母[1]缩写。记忆名字是为了帮助你记住单字母代码，但不是正确的名字。
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丙氨酸A类羊毛
氩R A第页吉宁
Asn N Asparagi公司n个e（电子）
天冬氨酸D
（助记符：天冬氨酸D类集成电路）
胱抑素C类半胱氨酸
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Lys K赖氨酸
（助记符：liK（K）锡）
遇见MM（M）乙硫氨酸
苯丙氨酸
（助记符：F类苯丙氨酸）
专业PP（P）罗琳
Pyl O Pyrr公司哦赖氨酸*
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助记符：
阿拉
B阿斯克†
C循环
D天门冬氨酸D类集成电路
E-谷氨酸-谷氨酸E类丙胺
F苯丙氨酸F类苯丙氨酸
G Gly公司
H他的
伊利
J型
K Lys li公司K（K）乙烯
L亮氨酸
M已见面
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助记符：
N-天门冬氨酸N个e（电子）
O阀*
P专业
Q-Gln公司问埃他明
R参数aR（右）吉宁
S系列
T Thr公司
U秒*
V值
W Trp t公司W公司托芬
X Unk†公司
Y轮胎tY（Y）松香
Z Glx†公司
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谷氨酰胺
（助记符：问乌他明）
Glu E谷氨酸
（助记符：gluE类塔米克语）
甘氨酸克甘氨酸
他的HH（H）伊司替丁
异亮氨酸我苏氨酸
亮氨酸L（左）亮氨酸
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Sec U硒代半胱氨酸*
（助记符：seleniU型米）
丝氨酸S公司爱丽丝
苏氨酸T型苏氨酸
色氨酸W色氨酸
（助记符：tW公司色氨酸）
Tyr Y T公司年松香
缬氨酸V（V）阿林
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*自20世纪中期以来，共有20种标准氨基酸。21世纪初，遗传编码的硒代半胱氨酸和吡咯烷已被世界蛋白质数据库列为标准[2].
†Asx:Asn或Asp；Glx：Gln或Glu；Unk：未知。
IUPAC/IUB 1971年出版物定义单字母代码。
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点击下面的图片，查看完整尺寸的21种氨基酸的详细信息。
还有一个标准氨基酸清单蛋白质数据库。
L-和D-氨基酸
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PDB术语
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L型
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D型
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ALA公司
ARG公司
ASN公司
ASP公司
CYS公司
GLN公司
GLU公司
高速钢
国际照明局
低浓缩铀
LYS公司
遇见
PHE公司
赞成的意见
PYL公司
秒
SER公司
推力
TRP公司
暴君
瓦尔
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DAL公司
DAR公司
DSG公司
DAS系统
DCY公司
DGN公司
DGL公司
DHI公司
DIL公司
DLE公司
DLY公司
基础教学法硕士
数据处理网络
DPR（DPR）
?[3]
?[3]
DSN（DSN）
DTH公司
DTR公司
DTY公司
数字视频助理
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21种标准氨基酸（除甘氨酸外）中的不对称α-碳是手性（立体）中心[4]因此，每种氨基酸都可以存在于两种光学异构体或对映体（镜像）中，分别命名为L型和D型。几乎所有天然存在的氨基酸都是L-氨基酸，之所以这样命名是因为它们类似于甘油醛的L型[4]（并非所有的L-氨基酸都是左旋氨基酸；一些氨基酸顺时针旋转偏振光[4]).
中的700多个条目PDB公司含有一个或多个D氨基酸。虽然D-氨基酸在自然界中很少见，但它们确实存在（参见维基百科中的自然丰度). D-丙氨酸（DAL）出现在PDB公司D亮氨酸（DLE）、D苯丙氨酸（DPN）、D丝氨酸（DSN）和D缬氨酸（DVA）各出现在50岁以上。其中一些条目是化学合成的，不是天然存在的。革兰氏菌素是一种天然存在的抗生素，含有多种D-氨基酸，例如。1个.4格鲁是完全由D-氨基酸合成的VEGF-A的102个氨基酸链。
异常氨基酸
至少有两种历史上“非标准”氨基酸现在被公认为遗传编码的，如下所述。2014年PDB公司开始将这两种氨基酸合成为22种标准氨基酸[2].
硒代半胱氨酸：第21种氨基酸
生命各个领域中的罕见蛋白质包括硒代半胱氨酸（Sec，U），指定为第21个氨基酸[5]2024年，超过90项PDB公司包括硒代半胱氨酸，称为SEC。
吡咯烷：第22个氨基酸
吡咯烷（Pyl，O）[6]是一种基因编码的氨基酸，天然存在于产甲烷古菌中，现在被命名为第22个氨基酸[7]。发生于几个条目在PDB中。请参见更多详细信息.
没有第23个氨基酸？
第21和22个氨基酸由终止密码子UGA和UAG分别用mRNA下游干环结构修饰。洛巴诺夫等。[8]搜索“16个古细菌基因组和130个细菌基因组中含有与三个停止信号对应的反密码子的tRNAs”。他们的数据表明，“不太可能出现其他广泛分布和遗传编码的氨基酸。”
硒代蛋氨酸
请参阅硒代蛋氨酸.
翻译后修改
许多不寻常的氨基酸是由酶催化反应形成的，酶催化反应在多肽中包含一种基因编码的标准氨基酸后对其进行修饰；这些被称为翻译后修饰。其中：
- 丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸的磷酸化
- 脯氨酸的羟基化（以产生羟脯氨酸，例如胶原蛋白)
- 赖氨酸或N末端的乙酰化
- 赖氨酸甲基化
- 天冬氨酸或谷氨酸的羧基化
- 亚硝化，例如生产硝基酪氨酸
- 用脂肪酸酰化（参见N-末端肉豆蔻酰化恢复素)
- 丙烯基化
- 丝氨酸、苏氨酸或天冬酰胺的糖基化（产生糖蛋白）
蛋白质的结构、性质和行为
Angel Herráez提供了氨基酸结构教程介绍其中20个氨基酸可以使用JSmol在3D中可视化。
请帮助扩展以下列表，包括所有22种氨基酸。
甘氨酸
Gly G：小。
另请参见蛋白质体中的甘氨酸和甘氨酸在维基百科中显示结构。甘氨酸是最小的氨基酸，因为它的副链只不过是一个氢。甘氨酸常见于转动，因为较大氨基酸的空间位阻会产生问题。转折通常发生在蛋白质表面，介于β链或α链。很常见高度保守的蛋白质表面上的甘氨酸，因为突变到更大的残基会干扰折叠。甘氨酸也存在于β链和α链尽管其在α螺旋中的频率较低（第二低，仅次于脯氨酸，p.125[9]). 甘氨酸通常存在于α螺旋的C末端，被认为是一种肽链螺旋终止物（p.125英寸[9]).
组氨酸
他的H：收费：基本、芳香、笨重
请参见组氨酸在维基百科中显示结构。His的侧链可以带正电荷（质子化），在这种情况下，侧链咪唑环中的两个氮都含有氢，并且电荷在它们之间脱域。质子化的pKa为6.1。这意味着，平均在任何时候，当pH值为6.1时，His侧链的一半被质子化。在血液pH值为7.4±0.05时，His侧链的正电荷少于10%。因此，His不在通常的带正电荷氨基酸列表中(赖氨酸和精氨酸).
苯丙氨酸
邻苯二甲酸酯：中性、芳香、笨重
请参见苯丙氨酸在维基百科中显示结构。Phe参与阳离子-pi相互作用.苯丙酮尿症是一种将苯丙氨酸转化为酪氨酸无功能，导致过量苯丙氨酸中毒和酪氨酸缺乏。
色氨酸
Trp W：中性、极性、芳香、笨重
请参见色氨酸在维基百科中显示结构。在跨膜蛋白中，色氨酸通常位于水和脂质的界面。钾通道就是一个例子，例如。1bl8公司。要查看其位置，请使用查找Jmol中的FirstGlance对话框。Trp参与阳离子-pi相互作用.
酪氨酸
泰尔Y：中性、极性、芳香、体积大
请参见酪氨酸在维基百科中显示结构，以及硝基酪氨酸.Tyr参与阳离子-pi相互作用.
另请参见
工具书类
- ↑氨基酸序列的一个字母表示法（确定性规则）。IUPAC-IUB生物化学命名委员会，第639-645页，国际纯化学与应用化学联合会和国际生物化学联合会，巴特沃斯，伦敦，1971年。全文.
- ↑2 2.1 公告：氨基酸命名标准化《全球蛋白质数据库新闻》，2014年1月8日。
- ↑3 3.12022年1月，未发现D-硒代半胱氨酸或D-吡咯烷wwPDB网站PDBe的David Armstrong表示。
- ↑4 4.1 4.2请参见维基百科中的手性].
- ↑Atkins JF，Gesteland RF。第二十一种氨基酸。自然。2000年9月28日；407(6803):463, 465. PMID：11028985数字对象标识：10.1038/35035189
- ↑请参见维基百科中的吡咯烷.
- ↑Hao B，Zhao G，Kang PT，Soares JA，Ferguson TK，Gallucci J，Krzycki JA，Chan MK.L-吡咯烷-第22（nd）种基因编码氨基酸的反应性和化学合成。化学生物。2004年9月；11(9):1317-24. PMID：15380192数字对象标识：10.1016/j.化学生物学.2004.07.011
- ↑Lobanov AV、Kryukov GV、Hatfield DL、Gladyshev VN。遗传密码中有第二十三个氨基酸吗？趋势Genet。2006年7月；22(7):357-60. Epub 2006年5月19日。PMID：16713651数字对象标识：2016年10月10日/j.tig.2006.05.002
- ↑9 9.1Kessel、Amit和Nir Ben-Tal。蛋白质简介：结构、功能和运动CRC出版社，2011年。653页。
