第2轮-2020年（SARS-2-CoV目标）::积极的
新型冠状病毒疫情的爆发给生物医学科学界带来了新的挑战。为了帮助了解病毒的传播和功能，世界各地都在进行基因和结构研究。截至2020年1月底，该病毒的基因组已被解码。结构生物学家利用收集到的序列数据，开始研究组成病毒的蛋白质结构。 CASP现已启动SARS-2-CoV结构建模计划。CASP可以通过为病毒最具挑战性的蛋白质和结构域生成和评估模型做出最大贡献，这些蛋白质和结构区没有可用的实验结构，也无法使用比较建模技术。目标是获得尽可能最佳的共识结构，并且关键是使用模型系列来获得总体和残差水平的准确度估计。希望这些结构将有助于其他人进一步了解病毒的结构和功能，识别疫苗开发可能的表位，并评估可能的药物靶向策略。许多这些蛋白质构成复合物的一部分，我们预计第二阶段将生成这些组装物的模型。 使用CASP靶分析管道对SARS-2-CoV蛋白质序列进行初步分析，发现10个蛋白质和结构域符合无模板建模的标准。我们现在邀请CASP社区成员和其他人生成并提交这些目标的模型。 根据参与者的反馈，我们建议模型提交的初始时间为三周，截止日期为4月5日。随后，将与CASP社区的适当成员协商，进行模型比较和准确性分析。模型和分析将尽快公开发布。
2018年第1轮（NMR提名目标）::完整的
CASP与Gaetano Montelione博士（Rutgers）、John Tainer（MD Anderson）和Emily Tai（NIH）共同发起了一项倡议，为一些具有高度生物学意义的蛋白质提供结构信息。对于合适的蛋白质，Montelione博士和合作者将获得一些实验结构，通常是通过核磁共振。该计划有三个目标。首先，实验结构将有助于研究人员研究这些蛋白质。其次，它们将为CASP13靶点提供基础，既可用于无模板建模，也可在某些情况下为CASP实验提供靶点，以使用稀疏NMR和SAXS数据进行数据辅助建模。与CASP12一样，SAXS数据将由John Tainer博士的团队在LNBL高级光源SIBYLS光束线提供。第三，对于那些没有进行实验结构确定或实验结构确定不成功的蛋白质，CASP社区的成员将被邀请贡献结构模型（CASP_Commons）。将对模型进行整理，并提供给要求结构的研究人员，以及估计的准确性信息。 CASP_Commons是CASP社区成员的协作组织，旨在以尽可能有用和方便的方式向感兴趣的调查人员提供尽可能最佳的模型。请注意，这项工作不是常规CASP实验的一部分。建议的靶点是实验结构不会立即可用的蛋白质，因此不能用传统的CASP方法评估模型。相反，目标是这些模型将有助于研究这些蛋白质的生物学家，并且该过程将有助于在CASP社区和更广泛的研究人员社区之间建立新的桥梁。 为了及时向生物界提供反馈，我们将立即启动第二轮“CASP_Commons”。尽管通知很短，但我们希望CASP社区的大部分人都能参与。3月12日开始注册(http://predictioncenter.org/casp_commons/registration.cgi). 预测季从3月13日开始，到4月14日结束。预测者在建模这些靶点、检查信号肽序列、无序区域等时应保持通常的谨慎。目前，我们还不知道这些蛋白质的寡聚特性。CASP_Commons目标也将作为CASP14目标适时重新发布。到2020年10月1日，那些有结构的将作为常规CASP14目标进行评估。 CASP_Commons是一个原型实验；如果成功，我们将考虑进一步开发。我们还要求就管理流程的最佳方式进行反馈和讨论。为此，请使用FORCASP。我们希望CASP_Commons结果将包含在CASP蛋白质专刊中。 所有人都可以参与。如果您是CASP的新手，并且没有预测中心的帐户，您必须首先向预测中心注册然后才继续CASP_Commons注册. 如果您已经在预测中心拥有帐户，你可以直接去CASP_Commons注册页面.不过，请检查您的基本注册信息电流。如果更改了-请通过我的个人信息更新主菜单中的数据链接。 CASP_Commons建模目标可在目标列表第页。可以通过预测提交表单提交模型，可从此网站或上提供的电子邮件CASP_Commons格式页面。请遵守提交程序和格式。请不要这样第一轮实验我们只接受第三级结构预测（TS）和模型精度估计（QA，之后收集所有TS模型）。
所有CASP_Commons预测都将通过此网站提供。我们希望CASP_Commons结果将包含在CASP特别报告中蛋白质问题。
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