是什么日期期限
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日期期限
是一个R包,它允许研究人员和普通观众通过从一个过时的系统发育树数据库中检索生物年龄,获得关于他们感兴趣的任何生物年龄的公开科学数据(阿卡年表),已被同行评审并作为科学研究文章的一部分发表在索引期刊上(打开生命之树商店). 因此,生物年龄由日期期限
构成最先进、经过同行评审的公共科学知识,可供该领域的专家和非专家访问和重用。
你如何使用日期期限
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您可以安装日期期限
在您自己的计算机上安装R包并在本地使用。您可以在下面找到本地安装的说明。
如果您不想/没有时间处理安装和R代码,可以使用DateLife的交互式网站应用程序请注意,该网站目前尚未上线,抱歉。
本地安装日期生活
R包
日期期限
的最新稳定版本可以与一起安装:
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的早期稳定版本可从CRAN存储库中安装。例如,要安装版本0.6.1
,您可以运行:
您可以安装日期期限
的开发版本,来自GitHub存储库,其中包含:
引用日期期限
如果您使用日期期限
对于出版物,请引用R包和随附的论文:
O'Meara B、Sanchez-Reyes L、Eastman J、Heath T、Wright A、Schliep K、Chamberlain S、Midford P、Harmon L、Brown J、Pennell M、Alfaro M、McTavish E(2024)。datelife:关于你的出租车世系分化时间的科学数据.R软件包版本0.6.9,https://doi.org/10.5281/zenodo.593938.
Sanchez-Reyes L、McTavish E、O’Meara B(2022年)。“datelife:利用数据库和分析工具揭示已过时的生命之树。”生物Rxiv,782094.https://doi.org/10.101/1782094.
您可以通过以下方式获得这些引文和bibtex条目:
许可证
这个软件包是免费的开源软件,根据GPL授权。
致谢
日期期限
已作为有门的(NSF资助)项目,目前仍在开发中。