结构抗体数据库

欢迎来到SAbDab

SAbDab是一个数据库,包含PDB公司以一致的方式进行注释和呈现。

每个结构都有一些属性注释,包括实验细节、抗体命名法(例如重-轻配对)、精选亲和力数据和序列注释。您可以使用数据库检查单个结构,创建和下载数据集进行分析,在数据库中搜索与查询序列相似的结构,监视抗体的已知结构重复序列,等等。

SAbDab-nno公司是SAbDab的子数据库,包含PDB中可用的所有纳米体结构,以与SAbDab中沉积的结构相同的方式进行处理和注释。

SAbDab由牛津蛋白质信息集团(OPIG)在开放式创新协议.

我们的抗体预测工具(如建模软件、可开发性预测软件等)可以在我们的SAbPred公司现场。

请注意,SAbDab中包含的数据在CC-BY 4.0许可证.

数据库统计信息

查看SAbDab中包含的数据摘要

搜索结构

搜索并查看数据库中包含的抗体结构。

搜索CDR

探索SAbDab抗体的互补决定区(CDR)。

按顺序搜索

基于序列标识搜索结构。

按方向搜索

使用ABangle根据VH和VL的相对方向选择抗体。

纳米体

在数据库中专门搜索纳米体结构。

Thera-SAbDab公司

我们的抗体和纳米体衍生免疫治疗结构数据库:按INN、元数据或序列搜索。

Schneider,C.、Raybould,M.I.J.、Deane,C.M.(2022)《生物治疗学时代的SAbDab:更新,包括SAbDab-Nano,纳米结构跟踪器》。核酸研究.50(D1):D1368-D1372[链接]

SAbDab论文:Dunbar,J.、Krawczyk,K.等人(2014)。核酸研究42。D1140-D1146[链接]

Thera-SAbDab论文:Raybould,M.I.J.,Marks,C.等人(2019年)。核酸研究gkz827[链接]

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