条目-*615799-克劳丁9;CLDN9公司-OMIM公司

 
*615799

克劳丁9;CLDN9公司


HGNC批准的基因符号:CLDN9公司

细胞遗传学位置:16页13.3 基因组坐标(GRCh38):16:3,012,923-3,014,505 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
16页13.3 耳聋,常染色体隐性遗传116 619093 应收账

文本

描述

克劳丁家族成员,如CLDN9,形成紧密连接并调节表皮片的渗透性。Claudins有2个细胞外环,负责通透性屏障的形成和离子选择性,4个跨膜区域,以及一个将claudin锚定在细胞骨架上的细胞质C末端尾部(由Zheng等人,2007年).


克隆和表达

使用实时PCR,Zheng等人(2007)发现CLDN9在人外周血单个核细胞中高表达,而在肝脏和肝癌细胞系中低表达。

通过免疫组织化学在小鼠Corti器官中的表达,Nakano等人(2009)显示Cldn9在毛细胞及其支持细胞的结合复合体中表达。Claudin-9也在内沟、外沟、血管纹和Reissner膜的细胞-细胞边界检测到。


映射

Hartz(2014)根据CLDN9序列的比对,将CLDN9基因定位到染色体16p13.3(GenBankA1791760号)带有基因组序列(GRCh37)。


基因功能

Zheng等人(2007)发现CLDN6(615798)和CLDN9作为丙型肝炎病毒(HCV;参见609532)在HCV许可的人肝细胞癌细胞中。实时PCR显示,在非许可的293T细胞中克劳丁的过度表达导致了HCV进入的敏感性。突变分析表明,CLDN9细胞外环-1中的val32、asn38、val45和glu48是HCV感染所必需的。

在转染的Tet-off MDCK细胞中,Nakano等人(2009)观察到野生型CLDN9的表达使MDCK单层电紧密,而突变型CLDN8的表达使上皮更容易渗漏。稀释电位分析表明,claudin-9起到阳离子屏障的作用,对Na+和K+形成细胞旁离子渗透屏障。注意到他们在nmf329小鼠(Cldn9突变纯合子)中的研究表明,通过降低K+浓度可以挽救耳蜗毛细胞的丢失,作者得出结论,claudin-9是保护听觉器官中感觉细胞所必需的,因为claudin9缺乏的紧密连接不能保护毛细胞基底外侧免受富含K(+)的内淋巴的侵袭。


分子遗传学

土耳其一名母亲和两名女儿患有渐进性感音神经性聋(DFNB116;619093),Sineni等人(2019年)确定CLDN9基因中1 bp缺失的纯合子(615799.0001)该基因与疾病分离,在公共变异数据库中未发现。

在来自2个近亲家庭的DFNB116先证者中,Ramzan等人(2021年)确定了CLDN9基因中的不同纯合子突变,一个错义(E149K;615799.0002)和移码(c.370_372dupATC;615799.0003)突变。通过外显子组测序鉴定突变。


动物模型

Nakano等人(2009年)研究了ENU诱导的小鼠突变体nmf329,该突变体表现为隐性遗传性耳聋。定位克隆显示,nmf329菌株在claudin-9基因中携带错义突变(F35L)。纯合子突变小鼠对响亮(约90 dB)的声音没有反应,野生型小鼠对这种声音表现出典型的惊吓反应。对纯合nmf329突变体横切耳蜗的组织学分析显示,Corti器官在基底弯处发生变形,塌陷成缺乏细胞旁间隙的致密细胞层,仅有2行外毛细胞。突变小鼠在出生后第8天(P8)表现出听力器官中的外毛细胞广泛缺失。nmf329突变体的外淋巴K+浓度升高,表明耳蜗紧密连接功能异常。当移植的听力器官在低K+环境中培养时,在体外挽救了突变耳蜗中的毛细胞损失;在体内,当Pou3f4基因的缺失降低了耳蜗内K(+)驱动力时,也得到了类似的结果(300039).


ALLELIC变体( 3精选示例):

.0001耳聋,自动耳塞116

CLDN9,1-BP DEL,86T
   RCV001265114型

土耳其一名母亲和两名女儿患有渐进性感音神经性聋(DFNB116;619093),Sineni等人(2019年)确定CLDN9基因中1 bp缺失的纯合子(c.86delT,NM_020982.3),导致移码,导致第一个细胞外环中的过早终止密码子(Leu29ArgfsTer4)。该突变与家族疾病分离,在dbSNP或gnomAD数据库中未发现。转染HEK293细胞的免疫荧光分析表明,野生型CLDN9主要定位于质膜,而突变型主要发现于胞浆中,这表明该变体破坏了CLDN9向质膜的迁移。


.0002耳聋,自动耳塞116

在2名巴基斯坦儿童中,其父母为第一堂兄(HLRBS10家族),患有非对称性听力损失(一名中度至重度,另一名中度到重度)的语前发作(DFNB116;619093),Ramzan等人(2021年)确定CLDN9基因中c.475G-a转换的纯合子(c.475G-a,NM_020982.4),导致蛋白质c末端附近高度保守的细胞外环(EL2)中的glu159-to-lys(E159K)替换。未受影响的父母和同胞是突变的杂合子。该变异并不存在于所有公共数据库中,包括gnomAD和GME变异体,也没有在173名巴基斯坦对照个体中检测到。E59K蛋白预计会导致CLDN9的错误折叠。


0.0003耳聋,常染色体隐性遗传116

CLDN9,3-BP DUP,370ATC({dbSNP SUB7928387})
   RCV001255162。。。

一名35岁的摩洛哥女性,出生于近亲父母(F7285家族),17岁时首次发现轻度听力损失,进展为中度听力损失(DFNB116;619093),Ramzan等人(2021年)确定CLDN9基因中3 bp重复的纯合子(c.370_372dupATC,NM_020982.4),导致124位异亮氨酸重复(ILE124DUP)。患者40岁的姐姐患有轻度至重度听力损失,发病于儿童早期,但她没有接受突变测试。该变异体在gnomAD和ExAC数据库中的频率较低(0.00002),没有观察到纯合子。在103名种族匹配的摩洛哥受试者中也未检测到该变异。


参考文献

  1. P.A.哈特兹。个人沟通。马里兰州巴尔的摩,2014年5月15日。

  2. Nakano,Y.、Kim,S.H.、Kim、H.-M.、Sanneman,J.D.、Zhang,Y.,Smith,R.J.、Marcus,D.C.、Wangemann,P、Nessler,R.A.、Banfi,B。基于claudin-9的离子渗透屏障对听力至关重要。公共科学图书馆-遗传学。5:e1000610,2009年。注:电子文章。[公共医学:19696885,图像,相关引文][全文]

  3. Ramzan,M.、Philippe,C.、Belyantseva,I.A.、Nakano,Y.、Fenollar-Ferrer,C.、Tona,R.、Yousaf,R.,Basheer,R.和Imtiaz,A.、Faridi,R.以及Munir,Z.、Idrees,H.和其他12人。人类CLDN9的变体可导致轻度至重度听力损失。嗯,变种人。42: 1321-1335, 2021.[公共医学:34265170,图像,相关引文][全文]

  4. Sineni,C.J.、Yildirim-Baylan,M.、Guo,S.、Camarena,V.、Wang,G.、Tokgoz-Yilmaz,S.和Duman,D.、Bademci,G.和Tekin,M。截断CLDN9变异与常染色体隐性遗传非综合征性听力损失相关。嗯,遗传学。138: 1071-1075, 2019.[公共医学:31175426,图像,相关引文][全文]

  5. 郑,A,袁,F,李,Y,朱,F,侯,P,李,J,宋,X,丁,M,邓,H。Claudin-6和Claudin-9作为丙型肝炎病毒的额外共受体发挥作用。J.维罗尔。81: 12465-12471, 2007.[公共医学:17804490,图像,相关引文][全文]


Sonja A.Rasmussen-更新时间:2024年7月22日
Marla J.F.O'Neill-更新日期:2020年12月11日
创建日期:
Patricia A.Hartz:2014年5月15日
颂歌:2024年7月22日
阿洛佩兹:2020年12月11日
阿洛佩兹:2020年12月11日
卡罗尔:2020年10月28日
mgross:2014年5月16日
迈克尔顿:2014年5月15日

*615799

克劳丁9;CLDN9公司


HGNC批准的基因符号:CLDN9

细胞遗传学位置:16p13.3 基因组坐标(GRCh38): 16:3,012,923-3,014,505 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
16页13.3 耳聋,常染色体隐性遗传116 619093 常染色体隐性

文本

描述

克劳丁家族成员,如CLDN9,形成紧密连接并调节表皮片的渗透性。claudin有2个负责渗透屏障形成和离子选择性的细胞外环,4个跨膜区,和一个将claudin锚定在细胞骨架上的细胞质C末端尾部(Zheng等人总结,2007)。


克隆和表达

Zheng等人(2007)使用实时PCR发现,CLDN9在人类外周血单个核细胞中高表达,而在肝脏和肝癌细胞系中低表达。

通过在Corti的小鼠器官中进行免疫组织化学,Nakano等人(2009年)证明了Cldn9在毛细胞及其支持细胞的结合复合体中的表达。Claudin-9也在内沟、外沟、血管纹和Reissner膜的细胞-细胞边界检测到。


映射

Hartz(2014)根据CLDN9序列(GenBank A1791760)与基因组序列(GRCh37)的比对,将CLDN9基因映射到染色体16p13.3。


基因功能

Zheng等人(2007年)发现,CLDN6(615798)和CLDN9是丙型肝炎病毒(HCV;见609532)进入HCV许可的人肝细胞癌细胞的受体。实时PCR显示,在非许可的293T细胞中克劳丁的过度表达导致了HCV进入的敏感性。突变分析表明,CLDN9细胞外环-1中的val32、asn38、val45和glu48是HCV感染所必需的。

在转染的Tet-off MDCK细胞中,Nakano等人(2009年)观察到野生型CLDN9的表达使MDCK单层电性更紧密,而突变型CLDN8的表达使上皮更容易渗漏。稀释电位分析表明,claudin-9起到阳离子屏障的作用,对Na+和K+形成细胞旁离子渗透屏障。注意到他们在nmf329小鼠(Cldn9突变纯合子)中的研究表明,通过降低K+浓度可以挽救耳蜗毛细胞的丢失,作者得出结论,claudin-9是保护听觉器官中感觉细胞所必需的,因为claudin9缺乏的紧密连接不能保护毛细胞基底外侧免受富含K(+)的内淋巴的侵袭。


分子遗传学

Sineni等人(2019年)在一名患有进行性感音神经性聋的土耳其母亲和两名女儿(DFNB116;619093)中,确定了CLDN9基因(615799.0001)中1 bp缺失的纯合子,该基因与疾病分离,在公共变异数据库中未发现。

在来自2个近亲家族的DFNB116先证者中,Ramzan等人(2021年)在CLDN9基因中确定了不同的纯合子突变、错义(E149K;615799.0002)突变和移码(c.370_372dupATC;6157990003)突变。通过外显子组测序鉴定突变。


动物模型

Nakano等人(2009年)研究了ENU诱导的小鼠突变体nmf329,该突变体表现为隐性遗传性耳聋。定位克隆显示,nmf329菌株在claudin-9基因中携带错义突变(F35L)。纯合子突变小鼠对响亮(约90 dB)的声音没有反应,野生型小鼠对这种声音表现出典型的惊吓反应。对纯合nmf329突变体横切耳蜗的组织学分析显示,Corti器官在基底弯处发生变形,塌陷成缺乏细胞旁间隙的致密细胞层,仅有2行外毛细胞。突变小鼠在出生后第8天(P8)表现出听力器官中的外毛细胞广泛缺失。nmf329突变体的外淋巴K+浓度升高,表明耳蜗紧密连接功能失调。在低钾环境中培养移植的听力器官,可以在体外挽救突变耳蜗毛细胞的丢失;当Pou3f4基因(300039)的缺失降低了耳蜗内K(+)驱动力时,体内也获得了类似的结果。


ALLELIC变体 3个选定示例):

.0001耳聋,自动耳塞116

CLDN9,1-BP DEL,86T
SNP:rs2072541692,临床变量:RCV001265114

在一位患有进行性感音神经性听力损失的土耳其母亲和两个女儿(DFNB116;619093)中,Sineni等人(2019)确定了CLDN9基因中1-bp缺失(c.86delT,NM_020982.3)的纯合性,导致移码,导致第一个细胞外环中的过早终止密码子(Leu29ArgfsTer4)。该突变与家族疾病分离,在dbSNP或gnomAD数据库中未发现。转染HEK293细胞的免疫荧光分析表明,野生型CLDN9主要定位于质膜,而突变型主要发现于胞浆中,这表明该变体破坏了CLDN9向质膜的迁移。


.0002耳聋,自动耳塞116

CLDN9,GLU159LYS({dbSNP SCV000998966.1})
SNP:rs1388025205,临床变量:RCV001093595、RCV004595570

Ramzan等人(2021年)在2名巴基斯坦儿童中发现CLDN9基因中c.475G-a过渡的纯合子(c.475G-a,NM_020982.4),这些儿童出生于第一代表亲父母(HLRBS10家族),患有非对称性听力损失(一名中度至重度,另一名中度到重度)的语前发作(DFNB116;619093),导致glu159-to-lys(E159K)蛋白质C末端附近高度保守的细胞外环(EL2)中的替代。未受影响的父母和同胞是突变的杂合子。该变异并不存在于所有公共数据库中,包括gnomAD和GME变异体,也没有在173名巴基斯坦对照个体中检测到。E59K蛋白被预测会导致CLDN9的错误折叠。


.0003耳聋,自动耳塞116

CLDN9,3-BP DUP,370ATC({dbSNP SUB7928387})
单核苷酸多态性:rs773682747,gnomAD:rs773682747,临床变量:RCV001255162、RCV001751522

Ramzan等人(2021年)在一名35岁的摩洛哥女性中发现了CLDN9基因中3 bp重复的纯合子(c.370_372dupATC,NM_020982.4),该女性出生于近亲父母(F7285家族),17岁时首次发现轻度听力损失,并进展为中度听力损失(DFNB116;619093),导致异亮氨酸在124位重复(ILE124DUP)。患者40岁的姐姐患有轻度至重度听力损失,发病于儿童早期,但她没有接受突变测试。该变异体在gnomAD和ExAC数据库中的频率较低(0.00002),没有观察到纯合子。在103名种族匹配的摩洛哥受试者中也未检测到该变异。


参考文献

  1. P.A.哈特兹。个人沟通。马里兰州巴尔的摩,2014年5月15日。

  2. Nakano,Y.、Kim,S.H.、Kim、H.-M.、Sanneman,J.D.、Zhang,Y.,Smith,R.J.、Marcus,D.C.、Wangemann,P、Nessler,R.A.、Banfi,B。基于claudin-9的离子渗透屏障对听力至关重要。公共科学图书馆-遗传学。5:e1000610,2009年。注:电子文章。[公共医学:19696885][全文:https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000610]

  3. Ramzan,M.、Philippe,C.、Belyantseva,I.A.、Nakano,Y.、Fenollar-Ferrer,C.、Tona,R.、Yousaf,R.,Basheer,R.和Imtiaz,A.、Faridi,R.以及Munir,Z.、Idrees,H.和其他12人。人类CLDN9的变体可导致轻度至重度听力损失。嗯,变种人。42: 1321-1335, 2021.[PubMed:34265170][全文:https://doi.org/10.1002/humu.24260]

  4. Sineni,C.J.、Yildirim-Baylan,M.、Guo,S.、Camarena,V.、Wang,G.、Tokgoz-Yilmaz,S.和Duman,D.、Bademci,G.和Tekin,M。截断CLDN9变异与常染色体隐性遗传非综合征性听力损失相关。嗯,遗传学。138: 1071-1075, 2019.[公共医学:31175426][全文:https://doi.org/10.1007/s00439-019-02037-1]

  5. 郑,A,袁,F,李,Y,朱,F,侯,P,李,J,宋,X,丁,M,邓,H。Claudin-6和Claudin-9作为丙型肝炎病毒的额外共受体发挥作用。J.维罗尔。81: 12465-12471, 2007.[公共医学:17804490][全文:https://doi.org/10.1128/JVI.01457-07]


贡献者:
Sonja A.Rasmussen-更新时间:2024年7月22日
Marla J.F.O'Neill-更新日期:2020年12月11日

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阿洛佩兹:2020年12月11日
阿洛佩兹:2020年12月11日
颂歌:2020年10月28日
mgross:2014年5月16日
迈克尔顿:2014年5月15日