条目-*614988-EPS8样蛋白2;EPS8L2型-OMIM公司
 
*614988

EPS8样蛋白2;EPS8L2型


备选标题;符号

EPS8-相关蛋白2;EPS8R2系统


HGNC批准的基因符号:EPS8L2型

细胞遗传学位置:11页15.5 基因组坐标(GRCh38):11:706,231-727,727 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
11页15.5 耳聋常染色体隐性遗传106 617637 应收账

文本

描述

基于其与EPS8的相似性(600206),预计EPS8L2在应对EGF的肌动蛋白重塑中起作用(131530)刺激(Tocchetti等人,2003年).


克隆和表达

通过搜索EST数据库中与EPS8相似的序列,Tocchetti等人(2003年)鉴定了小鼠和人类EPS8L2,他们将其命名为EPS8R2。他们还鉴定了小鼠和人类EPS8R1(EPS8L1;614987)和EPS8R3(EPS8L3;614989). 推导出的EPS8R2蛋白含有715个氨基酸。所有EPS8相关蛋白都有相似的结构,包括一个N-末端磷酸酪氨酸结合结构域,然后是SRC(190090)同源3(SH3)结构域和C末端区域与EPS8的C末端效应器结构域有显著相似性。电子分析表明EPS8R2在正常人体组织和细胞以及肿瘤中广泛表达。

通过筛选人成纤维细胞cDNA文库,奥芬豪泽等人(2004)获得一个全长EPS8L2克隆,编码一个推断的715氨基酸蛋白。成年小鼠组织的Northern blot和PCR分析检测到广泛但可变的Eps8l2表达。在胎盘、皮肤、肾脏、肠和胃中表达最高,但在大脑、骨髓和心脏中未检测到。对16.5天小鼠胚胎进行原位杂交,检测除大脑、背根神经节、心脏和肌肉外的所有器官中Eps8l2的表达。

Furness等人(2013)结果表明,小鼠Eps8l2在耳蜗毛细胞中短行和中间行静纤毛的尖端表达最显著,而Esp8在最长行中表达最显著。Eps8l2的位置独立于Eps8和Myo15a(602666),是Eps8尖端定位所需的蛋白质。


基因功能

由EPS8、API1(BIRC2;601712)、SOS1(182530)和PI3激酶的p85亚单位(参见171833)形成显示RAC的调节亚单位(602048)-肌动蛋白重塑和膜褶皱形成所需的鸟嘌呤交换因子(GEF)活性。奥芬豪泽等人(2004)发现EPS8L1、EPS8L2和EPS8L3与来自人类293T细胞的内源性API1共同免疫沉淀。所有EPS8样蛋白在过度表达后也与SOS1和ABI1相互作用。EPS8L1和EPS8L2(而非EPS8L3)显示RAC-GEF活性,并与聚合肌动蛋白共沉积。同样,EPS8L1和EPS8L2(而非EPS8L3)恢复了Eps8-/-小鼠胚胎成纤维细胞中EGF-依赖性膜的皱褶。


映射

通过基因组序列分析,Tocchetti等人(2003年)将人类EPS8L2基因定位到染色体11p15。他们将小鼠Eps8l2基因定位到染色体7F4。


分子遗传学

通过外显子组测序对2名非综合征性听力损失阿尔及利亚同胞(DFNB106;617637),Dahmani等人(2015)已鉴定的1-bp缺失的纯合性(c.1014delC;614988.0001)在EPS8L2基因中。该突变与该家族的听力损失分离,在Exome Variant Server数据库或150名阿尔及利亚对照中均未发现。

在分离非综合征性听力障碍的巴基斯坦血亲家庭(F11)的受累同胞中,Wang等人(2017)1 bp缺失的鉴定纯合子(c.737delC;614988.0002)在EPS8L2基因中(614988.0002). 该突变是通过外显子组测序发现的,与家族中的疾病分离,在dbSNP(构建142)或ExAC数据库或200名对照个体中均未发现。


动物模型

Furness等人(2013)产生了Eps8l2基因敲除小鼠,发现其有迟发性、进行性、严重的听力损失,尤其是在较高频率下,与耳蜗毛束的逐渐紊乱和静纤毛长度和宽度的异常变化有关。


ALLELIC变体( 2精选示例):

.0001耳聋,自动口腔接收器106

EPS8L2,1-BP DEL,1014C
   RCV000499522号机组

通过外显子组测序对2名非综合征性听力损失阿尔及利亚同胞(DFNB106;617637),Dahmani等人(2015)在EPS8L2基因的外显子12中鉴定出1-bp缺失的纯合性(c.1014delC,NM_022772.3),导致移码和过早终止(Ser339AlafsTer15)。该突变与该家族的听力损失分离,在Exome Variant Server数据库或150名阿尔及利亚对照中均未发现。虽然没有进行功能研究,但由于非传感介导的mRNA衰变,预计突变会导致截短的非活性蛋白质或根本没有蛋白质。


.0002耳聋,自动耳塞106

EPS8L2,1-BP DEL,737C
   RCV000501995型

在一个巴基斯坦血亲家庭(F11)分离出非综合征性听力障碍的受累同胞中(DFNB106;617637),Wang等人(2017)确定EPS8L2基因中1 bp缺失(c.737delC,NM_022772)的纯合子(614988.0002),导致移帧和提前终止(Ala246AlafsTer6)。该突变是通过外显子组测序发现的,与家族中的疾病分离,在dbSNP(构建142)或ExAC数据库或200名对照个体中均未发现。未进行任何功能研究。


参考文献

  1. Dahmani,M.,Ammar-Khodja,F.,Bonnet,C.,Lefevre,G.M.,Hardelin,J.-P.,Ibrahim,H.,Mallek,Z.,Petit,C。EPS8L2是儿童期常染色体隐性遗传进行性聋的一个新的致病基因。Orphanet J.罕见疾病。10: 96, 2015. 注:电子文章。[公共医学:26282398,相关引文][全文]

  2. Furness,D.N.,Johnson,S.L.,Manor,U.,Ruttiger,L.,Tocchetti,A.,Offenhauser,N.,Olt,J.,Goodyear,R.J.,Vijayakumar,S.,Dai,Y.,Hackney,C.,Franz,C.,Di Fiore,P.P.,Masetto,S。缺乏肌动蛋白结合蛋白Eps8L2的小鼠耳朵中的听力逐渐丧失和感觉毛束逐渐退化。程序。美国国家科学院。科学。110: 13898-13903, 2013.[公共医学:23918390,相关引文][全文]

  3. 奥芬豪泽,N.,博尔戈诺沃,A.,迪桑扎,A.,罗曼诺,P.,庞扎内利,I.,伊安诺洛,G.,迪菲奥雷,P.P.,西塔,G。eps8蛋白家族将生长因子刺激与肌动蛋白重组联系起来,在Ras/Rac途径中产生功能冗余。摩尔。《生物细胞》15:91-982004。注:勘误表:分子。生物细胞30:2535,仅2019年。[公共医学:14565974,相关引文][全文]

  4. Tocchetti,A.,Confalonieri,S.,Scita,G.,Di Fiore,P.P.,Betsholtz,C。EPS8基因家族的电子分析:基因组组织、表达谱和蛋白质结构。基因组学81:234-2442003。[公共医学:12620401,相关引文][全文]

  5. Wang,R.、Han,S.、Khan,A.、Zhang,X。对12个非综合征或综合征性耳聋巴基斯坦家庭的分子分析。遗传学。测试。摩尔。生物标记21:316-3212017年。[公共医学:28281779,相关引文][全文]


创建日期:
Patricia A.Hartz:2012年12月17日
卡罗尔:2019年1月10日
乔安娜:2017年8月23日
卡罗尔:2017年8月22日
卡罗尔:2017年8月21日
2012年12月18日

*614988

EPS8样蛋白2;EPS8L2型


备选标题;符号

EPS8-相关蛋白2;EPS8R2系统


HGNC批准的基因符号:EPS8L2

细胞遗传学位置:11p15.5 基因组坐标(GRCh38): 11:706,231-727,727 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
11页15.5 耳聋常染色体隐性遗传106 617637 常染色体隐性

文本

描述

基于其与EPS8(600206)的相似性,EPS8L2预计在响应EGF(131530)刺激的肌动蛋白重塑中发挥作用(Tocchetti等人,2003)。


克隆和表达

通过搜索EST数据库中与EPS8相似的序列,Tocchetti等人(2003年)确定了小鼠和人类EPS8L2,他们将其命名为EPS8R2。他们还鉴定了小鼠和人类EPS8R1(EPS8L1;614987)和EPS8R3(EPS8 L3;614989)。推导出的EPS8R2蛋白含有715个氨基酸。所有与EPS8相关的蛋白质都具有类似的结构,包括一个N末端磷酸酪氨酸结合域,接着是一个SRC(190090)同源3(SH3)域和一个与EPS8C末端效应器域非常相似的C末端区域。电子分析表明EPS8R2在正常人体组织和细胞以及肿瘤中广泛表达。

通过筛选人类成纤维细胞cDNA文库,Offenhauser等人(2004年)获得了全长EPS8L2克隆,该克隆编码一个推断的715氨基酸蛋白。成年小鼠组织的Northern blot和PCR分析检测到广泛但可变的Eps8l2表达。在胎盘、皮肤、肾脏、肠和胃中表达最高,但在大脑、骨髓和心脏中未检测到。对16.5天小鼠胚胎进行原位杂交,检测除大脑、背根神经节、心脏和肌肉外的所有器官中Eps8l2的表达。

Furness等人(2013)表明,小鼠Eps8l2在耳蜗毛细胞中短排和中间排的立纤毛顶端表达最显著,而Esp8在最长排中表达最显著。Eps8l2的位置独立于Eps8和Myo15a(602666),后者是Eps8尖端定位所需的蛋白质。


基因功能

由EPS8、API1(BIRC2;601712)、SOS1(182530)和PI3激酶p85亚单位(参见171833)组成的蛋白质复合物形成一个调节亚单位,显示肌动蛋白重塑和膜皱褶形成所需的RAC(602048)-鸟嘌呤交换因子(GEF)活性。Offenhauser等人(2004年)发现EPS8L1、EPS8L2和EPS8L3与来自人类293T细胞的内源性API1共同免疫沉淀。所有EPS8样蛋白在过度表达后也与SOS1和ABI1相互作用。EPS8L1和EPS8L2,而不是EPS8L3,显示RAC-GEF活性并与聚合肌动蛋白共沉淀。同样,EPS8L1和EPS8L2(而非EPS8L3)恢复了Eps8-/-小鼠胚胎成纤维细胞中EGF-依赖性膜的皱褶。


映射

通过基因组序列分析,Tocchetti等人(2003年)将人类EPS8L2基因映射到染色体11p15。他们将小鼠Eps8l2基因定位到染色体7F4。


分子遗传学

Dahmani等人(2015)通过对2名非综合征性听力损失的阿尔及利亚同胞(出生于近亲父母)的外显子组测序,确定了EPS8L2基因中1 bp缺失的纯合子(c.1014delC;614988.0001)。该突变与该家族的听力损失分离,在Exome Variant Server数据库或150名阿尔及利亚对照中均未发现。

Wang等人(2017)在分离非综合征性听力障碍的巴基斯坦血亲家族(F11)的受累同胞中,确定了EPS8L2基因(614988.0002)中1-bp缺失的纯合子(c.737delC;6149880002)。该突变是通过外显子组测序发现的,与家族中的疾病分离,在dbSNP(构建142)或ExAC数据库或200名对照个体中均未发现。


动物模型

Furness等人(2013年)产生了Eps8l2基因敲除小鼠,发现其具有迟发性、进行性、严重的听力损失,尤其是在较高频率下,与耳蜗毛束的逐渐紊乱和静纤毛长度和宽度的异常变化有关。


ALLELIC变体 2个选定示例):

.0001耳聋,自动口腔接收器106

EPS8L2,1-BP DEL,1014C
SNP:rs1554952443,临床变量:RCV000499522

Dahmani等人(2015)通过对2名非综合征性听力损失的阿尔及利亚同胞(出生于近亲父母)的外显子序列测定,确定了EPS8L2基因外显子12中1 bp缺失的纯合子(c.1014delC,NM_022772.3),导致移码和过早终止(Ser339AlafsTer15)。该突变与该家族的听力损失分离,在Exome Variant Server数据库或150名阿尔及利亚对照中均未发现。虽然没有进行功能研究,但由于非传感介导的mRNA衰变,预计突变会导致截短的非活性蛋白质或根本没有蛋白质。


0.0002耳聋,常染色体隐性遗传106

EPS8L2,1-BP DEL,737C
SNP:rs1554952193,临床变量:RCV000501995

在分离非综合征性听力障碍的巴基斯坦血亲家族(F11)的受累同胞中(DFNB106;617637),Wang等人(2017)确定了EPS8L2基因(614988.0002)中1-bp缺失(c.737delC,NM_022772)的纯合子,导致移码和提前终止(Ala246AlafsTer6)。该突变是通过外显子组测序发现的,与家族中的疾病分离,在dbSNP(构建142)或ExAC数据库或200名对照个体中均未发现。未进行任何功能研究。


参考文献

  1. Dahmani,M.,Ammar-Khodja,F.,Bonnet,C.,Lefevre,G.M.,Hardelin,J.-P.,Ibrahim,H.,Mallek,Z.,Petit,C。EPS8L2是儿童期常染色体隐性遗传进行性聋的一个新的致病基因。孤儿J.罕见疾病。10: 96, 2015. 注:电子文章。[公共医学:26282398][全文:https://doi.org/10.1186/s13023-015-0316-8]

  2. Furness,D.N.,Johnson,S.L.,Manor,U.,Ruttiger,L.,Tocchetti,A.,Offenhauser,N.,Olt,J.,Goodyear,R.J.,Vijayakumar,S.,Dai,Y.,Hackney,C.,Franz,C.,Di Fiore,P.P.,Masetto,S。缺乏肌动蛋白结合蛋白Eps8L2的小鼠耳朵中的听力逐渐丧失和感觉毛束逐渐退化。程序。美国国家科学院。科学。110: 13898-13903, 2013.[公共医学:23918390][全文:https://doi.org/10.1073/pnas.1304644110]

  3. 奥芬豪泽,N.,博尔戈诺沃,A.,迪桑扎,A.,罗曼诺,P.,庞扎内利,I.,伊安诺洛,G.,迪菲奥雷,P.P.,西塔,G。eps8蛋白家族将生长因子刺激与肌动蛋白重组联系起来,在Ras/Rac途径中产生功能冗余。摩尔。《生物细胞》15:91-982004。注:勘误表:分子。生物细胞30:2535,仅2019年。[公共医学:14565974][全文:https://doi.org/10.1091/mbc.e03-06-0427]

  4. Tocchetti,A.,Confalonieri,S.,Scita,G.,Di Fiore,P.P.,Betsholtz,C。EPS8基因家族的电子分析:基因组组织、表达谱和蛋白质结构。基因组学81:234-2442003。[公共医学:12620401][全文:https://doi.org/10.1016/s0888-7543(03)00002-8]

  5. Wang,R.、Han,S.、Khan,A.、Zhang,X。对12个非综合征或综合征性耳聋巴基斯坦家庭的分子分析。遗传学。测试。摩尔。生物标记21:316-3212017年。[PubMed:28281779][全文:https://doi.org/10.1089/gtmb2016.0328]


创建日期:
Patricia A.Hartz:2012年12月17日

编辑历史记录:
卡罗尔:2019年1月10日
乔安娜:2017年8月23日
卡罗尔:2017年8月22日
卡罗尔:2017年8月21日
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