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HGNC批准的基因符号:TPRN(TPRN)
细胞遗传学位置:9季度34.3 基因组坐标(GRCh38):9:137,191,619-137,200,741 (来自NCBI)
使用靶向基因组捕获和序列分析,Rehman等人(2010年)确定TPRN是DFNB79中突变的基因(613307)是一种与染色体9q34.3相关的常染色体隐性遗传非综合征性耳聋。全长TPRN编码一个推导出的711氨基酸蛋白质。RT-PCR检测到所有受检小鼠组织中的Tprn表达。免疫组织化学分析在小鼠Corti器官和前庭末端器官的感觉上皮中检测到Tprn,在较小程度上在Reisner膜和螺旋韧带中检测到。在Corti器官中,Tprn定位于支持细胞和内耳毛细胞静纤毛内,并定位于每个静纤毛的锥形区域。
独立地,Li等人(2010)确定TPRN是DFNB79中突变的基因。RT-PCR检测了TPRN在人胎儿耳蜗和所有检测的小鼠组织中的表达。Li等人(2010)确定了一个TPRN 3素材拼接变体。
Rehman等人(2010年)和Li等人(2010)确定TPRN基因包含4个编码外显子。
通过基因组序列分析,Rehman等人(2010年)和Li等人(2010)将TPRN基因定位到染色体9q34.3。Rehman等人(2010年)将小鼠Tprn基因映射到染色体2A3的一个区域,该区域与人类染色体9q34.3具有同源性。
在4个患有DFNB79的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员中,包括之前报告的3个家庭Khan等人(2010年),Rehman等人(2010年)在TPRN基因中鉴定出4种不同的纯合截短突变(613354.0001-613354.0004).
Li等人(2010)还确定了TPRN基因中的纯合功能缺失突变(613354.0004和613354.0005)在一个摩洛哥血缘大家庭和一个患有DFNB79的荷兰家庭的受影响成员中。
在一个患有常染色体隐性遗传非综合征性耳聋79(DFNB79;613307),Rehman等人(2010年)在TPRN基因的外显子1中发现了纯合1056G-a转换,导致trp352-ter(W352X)替换。据预测,突变会导致截短的蛋白质,并使转录物易受非传感介导的mRNA衰变的影响。在500条巴基斯坦控制染色体中未发现突变。
在患有DFNB79的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员中(613307),Rehman等人(2010年)在TPRN基因第1外显子中发现一个纯合1-bp缺失(1244delC),导致移码和提前终止。在500条巴基斯坦控制染色体中未发现突变。
在患有DFNB79的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员中(613307),Rehman等人(2010年)在TPRN基因的外显子1中发现了一个纯合的11 bp重复,导致了移码和提前终止。该缺失发生在重复的GC丰富区域,已知该区域在交叉形成期间容易发生结构畸变,可能与开放染色质结构有关(Li等人,2010年). 488条巴基斯坦控制染色体中未发现突变。
在患有DFNB79的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员中(613307),Rehman等人(2010年)在TPRN基因的外显子1中发现了一个纯合的11 bp缺失,导致了移码和提前终止。488条巴基斯坦控制染色体中未发现突变。
Li等人(2010)在一个与DFNB79无关的摩洛哥近亲家庭的受影响成员中发现了相同的纯合11-bp缺失。该缺失发生在重复的GC丰富区域,已知该区域在交叉形成期间容易发生结构畸变,可能与开放染色质结构有关。在140名摩洛哥对照个体中未发现突变。
2名患有非综合征DFNB79的荷兰同胞(613307),Li等人(2010)在TPRN基因第1外显子中发现一个纯合1-bp缺失(1347delG),预计会导致移码和提前终止。在160名荷兰对照中未发现突变。听力损失是渐进性的,到了年轻的成年期变得更加严重。
Khan,S.Y.、Riazuddin,S.、Shahzad,M.、Ahmed,N.、Zafar,A.U.、Rehman,A.U、Morell,R.J.、Griffith,A.J.、Ahamed,Z.M.、Riazuddin,S、Friedman,T.B。DFNB79:染色体9q34.3上一个非综合征性耳聋基因座的转世。欧洲。J.Hum.遗传学。18: 125-129, 2010.[公共医学:19603065,图像,相关引文][全文]
Li,Y.、Pohl,E.、Bouluiz,R.、Schraders,M.、Nurnberg,G.、Charif,M.,Admiraal,R.J.C.、von Ameln,S.、Baessmann,I.、Kandil,M.和Veltman,J.A.、Nurn贝格,P.、Kubisch,C.、Barakat,A.、Kremer,H.、Wollnik,B。TPRN突变导致进行性常染色体隐性遗传非综合征性听力损失。Am.J.Hum.遗传学。86: 479-484, 2010.[公共医学:20170898,图像,相关引文][全文]
Rehman,A.U.、Morell,R.J.、Belyantseva,I.A.、Khan,S.Y.、Boger,E.T.、Shahzad,M.、Ahmed,Z.M、Riazudin,S.、Khan,S.N.、Riazudin,S.、Friedman,T.B。靶向捕获和下一代测序确定编码taperin的C9orf75是非综合征性耳聋DFNB79的突变基因。Am.J.Hum.遗传学。86: 378-388, 2010.[公共医学:20170899,图像,相关引文][全文]
HGNC批准的基因符号:TPRN
细胞遗传学位置:9q34.3 基因组坐标(GRCh38): 9:137,191,619-137,200,741 (来自NCBI)
Rehman等人(2010年)利用靶向基因组捕获和序列分析确定TPRN是DFNB79(613307)中突变的基因,DFNB79是一种与染色体9q34.3相关的常染色体隐性遗传非综合征性耳聋。全长TPRN编码一个推导出的711氨基酸蛋白质。RT-PCR检测到所有受检小鼠组织中的Tprn表达。免疫组织化学分析在小鼠Corti器官和前庭末端器官的感觉上皮中检测到Tprn,在较小程度上在Reisner膜和螺旋韧带中检测到。在Corti器官中,Tprn定位于支持细胞和内耳毛细胞静纤毛内,并定位于每个静纤毛的锥形区域。
Li等人(2010年)独立地将TPRN确定为DFNB79中突变的基因。RT-PCR检测了TPRN在人胎儿耳蜗和所有检测的小鼠组织中的表达。Li等人(2010年)发现了一种TPRN 3素材拼接变体。
Rehman等人(2010)和Li等人(2010年)确定TPRN基因包含4个编码外显子。
通过基因组序列分析,Rehman等人(2010)和Li等人(2010年)将TPRN基因映射到染色体9q34.3。Rehman等人(2010)将小鼠Tprn基因定位到染色体2A3的一个区域,该区域与人类染色体9q34.3具有同源性。
在4个患有DFNB79的巴基斯坦近亲家庭的受影响成员中,包括Khan等人(2010年)之前报告的3个家庭,Rehman等人(2011年)在TPRN基因中鉴定了4个不同的纯合截断突变(613354.001-613354.0004)。
Li等人(2010年)还确定了一个摩洛哥血缘大家庭和一个患有DFNB79的荷兰家庭的受影响成员中TPRN基因(613354.004和613354.0005)的纯合子功能缺失突变。
在患有常染色体隐性遗传非综合征性耳聋-79(DFNB79;613307)的巴基斯坦近亲家族的受影响成员中,Rehman等人(2010年)在TPRN基因的外显子1中发现了纯合1056G-a过渡,导致trp352-ter(W352X)替代。据预测,突变会导致截短的蛋白质,并使转录物易受非传感介导的mRNA衰变的影响。在500条巴基斯坦控制染色体中未发现突变。
在患有DFNB79(613307)的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员中,Rehman等人(2010年)在TPRN基因的外显子1中发现了一个纯合1-bp缺失(1244delC),导致移码和过早终止。在500条巴基斯坦控制染色体中未发现突变。
在患有DFNB79(613307)的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员中,Rehman等人(2010年)在TPRN基因的外显子1中发现了纯合11 bp重复,导致了移码和提前终止。该缺失发生在重复的GC丰富区域,已知该区域在交叉形成期间容易发生结构畸变,可能与开放染色质结构有关(Li等人,2010年)。488条巴基斯坦控制染色体中未发现突变。
在患有DFNB79(613307)的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员中,Rehman等人(2010年)在TPRN基因的外显子1中发现了纯合11 bp缺失,导致了移码和提前终止。488条巴基斯坦控制染色体中未发现突变。
Li等人(2010年)在与DFNB79无血缘关系的摩洛哥家族的受影响成员中发现了相同的纯合11-bp缺失。该缺失发生在重复的GC丰富区域,已知该区域在交叉形成期间容易发生结构畸变,可能与开放染色质结构有关。在140名摩洛哥对照个体中未发现突变。
在2名患有非综合征DFNB79(613307)的荷兰同胞中,Li等人(2010年)在TPRN基因外显子1中发现了纯合1-bp缺失(1347delG),预计会导致移码和提前终止。在160名荷兰对照中未发现突变。听力损失是渐进性的,到了年轻的成年期变得更加严重。
Khan,S.Y.、Riazuddin,S.、Shahzad,M.、Ahmed,N.、Zafar,A.U.、Rehman,A.U、Morell,R.J.、Griffith,A.J.、Ahamed,Z.M.、Riazuddin,S、Friedman,T.B。DFNB79:染色体9q34.3上一个非综合征性耳聋基因座的转世。欧洲。J.Hum.遗传学。18: 125-129, 2010.[公共医学:19603065][全文:https://doi.org/10.1038/ejhg.2009.121]
Li,Y.、Pohl,E.、Bouluiz,R.、Schraders,M.、Nurnberg,G.、Charif,M.,Admiraal,R.J.C.、von Ameln,S.、Baessmann,I.、Kandil,M.和Veltman,J.A.、Nurn贝格,P.、Kubisch,C.、Barakat,A.、Kremer,H.、Wollnik,B。TPRN突变导致进行性常染色体隐性遗传非综合征性听力损失。Am.J.Hum.遗传学。86: 479-484, 2010.[公共医学:20170898][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2010.02.003]
Rehman,A.U.、Morell,R.J.、Belyantseva,I.A.、Khan,S.Y.、Boger,E.T.、Shahzad,M.、Ahmed,Z.M、Riazudin,S.、Khan,S.N.、Riazudin,S.、Friedman,T.B。靶向捕获和下一代测序确定编码taperin的C9orf75是非综合征性耳聋DFNB79的突变基因。Am.J.Hum.遗传学。86: 378-388, 2010.[公共医学:20170899][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2010.01.030]
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