条目-*613283-富含半胱氨酸的谷氨酸多辛,1;GRXCR1型-OMIM公司
 
*613283

富含半胱氨酸的谷胱甘肽,1;GRXCR1型


HGNC批准的基因符号:GRXCR1型

细胞遗传学位置:第4页,共13页   基因组坐标(GRCh38):4:42,892,713-43,030,658 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第4页,共13页 耳聋,常染色体隐性遗传25 613285 应收账

文本

克隆和表达

Schraders等人(2010年)克隆人GRXCR1,编码一个推导出的290-氨基酸蛋白,该蛋白含有一个推测的谷胱甘肽催化结构域和一个富含半胱氨酸的C末端区域。谷胱甘肽结构域预计在蛋白质的可逆S-谷氨酰化反应中起作用。定量PCR检测到GRXCR1在胎儿耳蜗中高表达,在成人睾丸中中等表达,在胎儿心脏、成人十二指肠和大脑中低表达,在其他检查的成人和胎儿组织中几乎没有表达。

Hunker等人(2005)说明小鼠Grxcr1基因含有290个氨基酸。他们发现转染的Grxcr1与培养细胞背/顶表面的肌动蛋白丝状结构密切相关。

Odeh等人(2010年)发现小鼠Grxcr1的C末端富含半胱氨酸结构域中的2组4个半胱氨酸被预测折叠成锌指构型。他们发现GRXCR1的中央谷胱甘肽样结构域和富含半胱氨酸的C末端在脊椎动物之间高度保守。Grxcr1在小鼠内耳感觉上皮中表达,并在小鼠耳蜗外植体中沿听觉和前庭毛细胞的静纤毛长度定位。它还定位于猴成纤维细胞丝状体和猪肾上皮细胞顶面微绒毛中富含肌动蛋白的丝状结构长度。


基因结构

Schraders等人(2010年)确定GRXCR1基因包含4个外显子。


映射

Schraders等人(2010年)将GRXCR1基因定位到染色体4p13。Odeh等人(2004)将含有Grxcr1基因的小鼠旋转(pi)基因座映射到小鼠5号染色体的一个区域,该区域与人类4号染色体具有同源性。


分子遗传学

来自一个非血统荷兰家庭的3名同胞、1名散发荷兰患者和2个巴基斯坦近亲常染色体隐性遗传非综合征性听力损失家庭的受累成员(DFNB25;613285)映射到4p13,Schraders等人(2010年)确定GRXCR1基因中1个错义、1个无义和2个剪接位点突变的纯合子(613283.0001-613283.0004与疾病共分离,在180名荷兰或240名巴基斯坦对照组中未发现。


动物模型

Pirouette(pi)是一种在C3H近交系小鼠中自发产生的常染色体隐性突变。Pi/Pi小鼠有生育能力,寿命正常。他们表现出盘旋、头晕目眩和多动症,并在出生后早期出现严重的听力损失。pi/pi小鼠Corti器官中的感觉毛细胞出现早期退化,1个月后,pi/pi鼠出现其他细胞类型的退化,包括脊神经节和血管纹中的细胞。Odeh等人(2004)发现pi和另外两个内耳功能障碍小鼠菌株,即转基因系370(pi-tg370)和塔斯马尼亚魔鬼(pi-tde),代表了pi位点的3个独立等位基因突变。Hunker等人(2005年)据报道,pi是小鼠Grxcr1基因的突变。

Odeh等人(2010年)鉴定出另外两种小鼠菌株,nm2766(pi-2j)和nm3325(pi-3j),由于Grxcr1基因的自发隐性突变,它们表现出类似的前庭和听觉缺陷。Odeh等人(2010年)结果表明,旋转小鼠Grxcr1功能的丧失导致静纤毛异常纤细和轻微缩短。


ALLELIC变体( 4精选示例):

.0001耳聋,自动口腔接收器25

荷兰一个常染色体隐性遗传性耳聋非血统家庭的3名受累同胞25例(613285),Schraders等人(2010年)鉴定GRXCR1基因内含子2中剪接位点突变(628-9C-a)的纯合子,预测会产生不同的剪接受体位点。在未受影响的家庭成员或180名荷兰对照中未发现突变。对2名受累同胞的GRXCR1 cDNA进行的分析表明,在外显子2和3之间存在7个额外的碱基对,导致移码和提前终止密码子。


.0002耳聋,自动耳塞25

常染色体隐性遗传性耳聋散发病例25例(613285)在一个荷兰病人身上,Schraders等人(2010年)鉴定了GRXCR1基因内含子2中剪接位点突变(627+19A-T)的纯合子,预测会产生额外的供体剪接位点。在未受影响的家庭成员或180名荷兰对照中未发现突变。


.0003耳聋,自动耳塞25

巴基斯坦一个常染色体隐性遗传性耳聋近亲家庭的受累成员-25(613285),Schraders等人(2010年)确定GRXCR1基因中229C-T转换的纯合子,导致gln77-ter(Q77X)替代。在未受影响的家庭成员或240名巴基斯坦对照者中未发现突变。


.0004耳聋,自动耳塞25

巴基斯坦一个常染色体隐性遗传性耳聋近亲家庭的受累成员-25(613285),Schraders等人(2010年)GRXCR1基因外显子2中412C-T转变的纯合性,导致高度保守残基处的arg138到cys(R138C)取代。在未受影响的家庭成员或240名巴基斯坦对照者中未发现突变。


参考文献

  1. Hunker,K.、Odeh,H.、Zheng,L.、Barald,K.,Raphael,Y.、Bartles,J.、Kohrman,D。小鼠耳聋突变体旋转体受影响基因Grxcr1的表达和突变分析。(摘要)仅ARO摘要28:279,2005年。

  2. Odeh,H.,Hagiwara,N.,Skynner,M.,Mitchem,K.L.,Beyer,L.A.,Allen,N.D.,Brilliant,M.H.,Lebart,M.C.,Dolan,D.F.,Raphael,Y.,Kohrman,D.C。小鼠耳聋基因座pirouette的两个转基因插入突变的特征。音频。神经醇。9: 303-314, 2004.[公共医学:15347914,相关引文][全文]

  3. Odeh,H.、Hunker,K.L.、Belyantseva,I.A.、Azaiez,H.,Avenarius,M.R.、Zheng,L.、Peters,L.M.、Gagnon,L.H.、Hagiwara,N.、Skynner,M.J.、Brilliant,M.H.、Allen,N.D.、Riazuddin,S.、Johnson,K.R.、Raphael,Y.、Najmabadi,H.和Friedman,T.B.、Bartles,J.R.、Smith,R.H.、Kohrman,D.C。Grxcr1的突变是导致小鼠旋转时内耳功能障碍的基础。Am.J.Hum.遗传学。86: 148-160, 2010.[公共医学:20137774,图像,相关引文][全文]

  4. Schraders,M.、Lee,K.、Oostrick,J.、Huygen,P.L.M.、Ali,G.、Hoefsloot,L.H.、Veltman,J.A.、Cremers,F.P.M.、Basit,S.、Ansar,M.,Cremers、C.W.R.J.、Kunst,H.P.M.,Ahmad,W.、Admiraal,R.J.C.、Leal,S.M.、Kremer,H。纯合子图谱显示GRXCR1突变是常染色体隐性遗传非综合征性听力损伤的一个原因。Am.J.Hum.遗传学。86: 138-147, 2010.[公共医学:20137778,图像,相关引文][全文]


贡献者:
Marla J.F.O'Neill-更新时间:2010年3月3日
创建日期:
Patricia A.Hartz:2010年2月25日
特里:2010年9月8日
卡罗尔:2010年3月3日
卡罗尔:2010年2月25日
乔安娜:2010年2月25日
卡罗尔:2010年2月25日
卡罗尔:2010年2月25日

*613283

富含半胱氨酸的谷胱甘肽,1;GRXCR1型


HGNC批准的基因符号:GRXCR1

细胞遗传学位置:4p13   基因组坐标(GRCh38):4:42892713-43030658 (来自NCBI)


基因表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第4页,共13页 耳聋,常染色体隐性遗传25 613285 常染色体隐性遗传

文本

克隆和表达

Schraders等人(2010年)克隆了人类GRXCR1,该基因编码一个推导出的290-氨基酸蛋白质,该蛋白质包含一个假定的谷胱甘肽催化域和一个富含半胱氨酸的C末端区域。谷胱甘肽结构域预计在蛋白质的可逆S-谷氨酰化反应中起作用。定量PCR检测到GRXCR1在胎儿耳蜗中高表达,在成人睾丸中中等表达,在胎儿心脏、成人十二指肠和大脑中低表达,在其他检查的成人和胎儿组织中几乎没有表达。

Hunker等人(2005年)指出,小鼠Grxcr1基因包含290个氨基酸。他们发现转染的Grxcr1与培养细胞背/顶表面的肌动蛋白丝状结构密切相关。

Odeh等人(2010)发现,小鼠Grxcr1的C末端富含半胱氨酸结构域中的2组4个半胱氨酸被预测折叠成锌指构型。他们发现GRXCR1的中央谷胱甘肽样结构域和富含半胱氨酸的C末端在脊椎动物之间高度保守。Grxcr1在小鼠内耳感觉上皮中表达,并在小鼠耳蜗外植体中沿听觉和前庭毛细胞的静纤毛长度定位。它还定位于猴成纤维细胞丝状体和猪肾上皮细胞顶面微绒毛中富含肌动蛋白的丝状结构长度。


基因结构

Schraders等人(2010年)确定GRXCR1基因包含4个外显子。


映射

Schraders等人(2010年)将GRXCR1基因映射到染色体4p13。Odeh等人(2004年)将含有Grxcr1基因的小鼠自旋(pi)基因座映射到小鼠第5染色体的一个区域,该区域与人类第4染色体具有同步同源性。


分子遗传学

Schraders等人(2010年)在一个非血统荷兰家系的3个同胞、1名散发荷兰患者和2个巴基斯坦近亲家系的受累成员中,发现常染色体隐性遗传非综合征性听力损失(DFNB25;613285)映射到4p13,并鉴定出1个错义、1个无义、,GRXCR1基因中的2个剪接位点突变(分别为613283.0001-613283.00 04)与疾病共分离,在180名荷兰或240名巴基斯坦对照中未发现。


动物模型

Pirouette(pi)是一种在C3H近交系小鼠中自发产生的常染色体隐性突变。Pi/Pi小鼠具有生育能力,寿命正常。他们表现出盘旋、头晕目眩和多动症,并在出生后早期出现严重的听力损失。pi/pi小鼠Corti器官中的感觉毛细胞表现出早期退化,1个月后,pi/pi鼠表现出其他细胞类型的退化,包括脊神经节和血管纹中的细胞。Odeh等人(2004年)发现,pi和另外两种具有内耳功能障碍的鼠种,转基因系370(pi-tg370)和塔斯马尼亚魔鬼(pi-tde)代表pi位点的3个独立等位基因突变。Hunker等人(2005年)报告称,pi是小鼠Grxcr1基因的突变。

Odeh等人(2010年)发现了另外两种小鼠菌株,即nm2766(pi-2j)和nm3325(pi-3j),由于Grxcr1基因的自发隐性突变,它们表现出类似的前庭和听觉缺陷。Odeh等人(2010年)表明,旋转小鼠中Grxcr1功能的丧失导致静纤毛异常纤细和轻微缩短。


ALLELIC变体 4个选定示例):

.0001耳聋,自动口腔接收器25

GRXCR1、IVS2、C-A、-9
单号:rs606231120,gnomAD:rs606231120,临床变量:RCV00000216,RCV002512595

Schraders等人(2010年)在一个患有常染色体隐性聋25(613285)的非血源性荷兰家系的3名受累同胞中,确定了GRXCR1基因内含子2中剪接位点突变(628-9C-a)的纯合子,预测该突变会产生不同的剪接受体位点。在未受影响的家庭成员或180名荷兰对照中未发现突变。对2名受累同胞的GRXCR1 cDNA进行的分析表明,在外显子2和3之间存在7个额外的碱基对,导致移码和提前终止密码子。


.0002耳聋,自动耳塞25

GRXCR1、IVS2、A-T、+19
SNP:rs201824235,gnomAD:rs201824235,临床变量:RCV00000217,RCV001775538

Schraders等人(2010年)在一名荷兰患者的常染色体隐性聋-25(613285)散发病例中,确定了GRXCR1基因内含子2中剪接位点突变(627+19A-T)的纯合子,预计会产生额外的供体剪接位点。在未受影响的家庭成员或180名荷兰对照中未发现突变。


.0003耳聋,自动耳塞25

GRXCR1、GLN77TER
单号:rs267606855,临床变量:RCV000000218,RCV001291336

在患有常染色体隐性聋-25(613285)的巴基斯坦近亲家族的受影响成员中,Schraders等人(2010年)确定GRXCR1基因中229C-T转换的纯合子,导致gln77-ter(Q77X)替代。在未受影响的家庭成员或240名巴基斯坦对照者中未发现突变。


.0004耳聋,自动耳塞25

GRXCR1、ARG138CYS
单号:rs267606856,gnomAD:rs267606856,临床变量:RCV00000219、RCV002512596

在患有常染色体隐性聋-25(613285)的巴基斯坦近亲家族的受影响成员中,Schraders等人(2010年)确定了GRXCR1基因第2外显子412C-T转换的纯合子,导致在高度保守的残基处出现arg138-to-cys(R138C)替代。在未受影响的家庭成员或240名巴基斯坦对照者中未发现突变。


参考文献

  1. Hunker,K.、Odeh,H.、Zheng,L.、Barald,K.,Raphael,Y.、Bartles,J.、Kohrman,D。Grxcr1基因的表达和突变分析,Grxcr1基因在小鼠耳聋突变体pirouette中受影响。(摘要)仅ARO摘要28:279,2005年。

  2. Odeh,H.,Hagiwara,N.,Skynner,M.,Mitchem,K.L.,Beyer,L.A.,Allen,N.D.,Brilliant,M.H.,Lebart,M.C.,Dolan,D.F.,Raphael,Y.,Kohrman,D.C。小鼠耳聋基因座pirouette的两个转基因插入突变的特征。音频。神经醇。9: 303-314, 2004.[公共医学:15347914][全文:https://doi.org/10.1159/000080701]

  3. Odeh,H.、Hunker,K.L.、Belyantseva,I.A.、Azaiez,H.,Avenarius,M.R.、Zheng,L.、Peters,L.M.、Gagnon,L.H.、Hagiwara,N.、Skynner,M.J.、Brilliant,M.H.、Allen,N.D.、Riazuddin,S.、Johnson,K.R.、Raphael,Y.、Najmabadi,H.和Friedman,T.B.、Bartles,J.R.、Smith,R.H.、Kohrman,D.C。Grxcr1突变是旋转小鼠内耳功能障碍的基础。Am.J.Hum.遗传学。86: 148-160, 2010.[公共医学:20137774][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2010.016]

  4. Schraders,M.、Lee,K.、Oostrick,J.、Huygen,P.L.M.、Ali,G.、Hoefsloot,L.H.、Veltman,J.A.、Cremers,F.P.M.、Basit,S.、Ansar,M.,Cremers、C.W.R.J.、Kunst,H.P.M.,Ahmad,W.、Admiraal,R.J.C.、Leal,S.M.、Kremer,H。纯合子图谱显示GRXCR1突变是常染色体隐性遗传非综合征性听力损伤的一个原因。Am.J.Hum.遗传学。86: 138-147, 2010.[公共医学:20137778][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2009.12.017]


贡献者:
Marla J.F.O'Neill-更新时间:2010年3月3日

创建日期:
Patricia A.Hartz:2010年2月25日

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卡罗尔:2010年2月25日