条目-*612971-PDZ域-包含7;PDZD7型-OMIM公司
 
*612971

含有7个PDZ结构域;PDZD7型


HGNC批准的基因符号:PDZD7型

细胞遗传学位置:10季度24.31 基因组坐标(GRCh38):10:101,007,679-101,031,129 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
10季度24.31 {Usher综合征IIA型视网膜疾病,}修饰语 276901 应收账
耳聋,常染色体隐性遗传57 618003 应收账
Usher综合征,IIC型,GPR98/PDZD7双基因 605472 应收账,尽职调查

文本

克隆和表达

Schneider等人(2009年)使用位置克隆从t(10;11)易位的连接片段中鉴定PDZD7基因。他们鉴定了4种PDZD7亚型;亚型A和B包含2个PDZ结构域,较短的亚型C和D分别不包含PDZ结构区和1个PDZ域。RT-PCR分析检测到PDZD7在人类皮质中表达,而在人类内耳中表达较弱。


基因结构

Schneider等人(2009)据报道,PDZD7由16个外显子组成,跨越23.3kb,产生4种不同的转录物。A和B亚型分别由外显子2至8或9编码,C和D亚型分别通过外显子6至13和外显子13至16编码。


映射

通过位置克隆,Schneider等人(2009年)将PDZD7基因定位到染色体10q24.3。


基因功能

通过GST下拉分析和Western blot分析,Schneider等人(2009)表明PDZD7与SANS相互作用(USH1G;607696)在HEK293T细胞中。小鼠视网膜GST下拉实验表明PDZD7也与和谐蛋白(USH1C;605242).

Ebermann等人(2010年)对人胎脑进行酵母2杂交筛选,观察PDZD7的PDZ2结构域与GPR98的C末端胞内结构域的相互作用(602851),包括其PDZ绑定图案。免疫共沉淀研究证实了这种相互作用,并揭示其由PDZD7的PDZ2结构域和GPR98的PDZ结合基序介导。此外,共免疫沉淀研究表明PDZD7的第一和第二个PDZ结构域与USH2A相互作用(608400); 没有C末端PDZ结合基序的USH2A的截短版本显示交互作用减少。


细胞遗传学

在一名非综合征型先天性感音神经性听力障碍男孩中,Schneider等人(2009年)确定了一个纯合互惠46,XY t(10;11),t(10,11)易位。8岁时检查未显示任何视网膜色素变性或前庭功能障碍的迹象。父母和他们的另外4个孩子都是杂合子易位携带者。FISH分析将断点定位于PDZD7基因内含子10中的染色体10q24.3和与其他2个非综合征性耳聋基因RDX非常接近(小于5Mb)的染色体11q23.3(179410)和TECTA(602574). 10q24.3断点会破坏PDZD7的C和D亚型的开放阅读框架。Schneider等人(2009)提示PDZD7基因可引起非综合征常染色体隐性聋,也是Usher综合征的主要候选基因(参见276900).Vona等人(2016)对该患者进行随访,其15岁以下的听力测试显示稳定的倾斜感音神经性听力损失。在15.5岁时进行彻底的眼科检查,没有发现视网膜变性疾病的迹象。


分子遗传学

Usher综合征IIA型视网膜疾病的修饰

美国H2A的两个法裔加拿大姐妹(276901),Ebermann等人(2010年)分析PDZD7基因并确定一个新的移码突变的杂合性(612971.0001)在其中一个姐妹中,她们发病较早,视网膜疾病更严重。作者得出结论,PDZD7是USH2A患者的视网膜疾病调节剂。

Usher综合征IIC型,GPR98/PDZD7 Digenic

一名51岁的德国男子患有II型Usher综合征(见USH2C,605472)Usher综合征基因USH2A突变阴性(608400),WHRN(607928)和CLRN1(606397),Ebermann等人(2010年)在GPR98基因中发现了杂合移码突变(602851.0010)PDZD7基因的杂合移码突变(612971.0002). 在GPR98或PDZD7中未检测到第二个突变等位基因。

耳聋,常染色体隐性57

在4个不相关的伊朗家庭中,分离到10号染色体的常染色体隐性非综合征性听力损失(DFNB57;618003),Booth等人(2015)确定PDZD7基因突变的纯合子或复合杂合子(612971.0003-612971.0007)这与每个家庭的疾病完全隔离,在种族匹配的对照组中没有发现。眼科检查显示这些患者没有异常。

一名德国女孩患有非综合征性听力损失,Vona等人(2016)确定无义突变的复合杂合性(Q550X;612971.0008)和1个bp的缺失(612971.0009)在PDZD7基因中。12岁时的眼科评估,包括眼底镜、眼底自发荧光、视网膜电图和光学相干断层扫描,显示视网膜健康。

在分离出常染色体隐性遗传非综合征性听力损失的2个无关中国家庭的受累成员中,Guan等人(2018)确定PDZD7基因突变的纯合子或复合杂合子(612971.0001,612971.0010、和612971.0011). 这两个家族中的突变与疾病分离,在1751名中国对照组中未发现。作者注意到其中一个突变(c.166_167insC;612971.0001)曾被报道为Usher综合征的视网膜表型修饰物(Ebermann等人,2010年). 携带c.166_167insC的2个中国同胞的复合杂合性和另一个移码突变(612971.0011)其典型Usher综合征基因突变为阴性,分别在22岁和19岁时没有夜盲症或视野缺陷。


动物模型

Ebermann等人(2010年)对斑马鱼中的pdzd7进行了特征分析,并鉴定了2个同源基因pdzd7a和pdzd5b,它们在内耳的视网膜细胞和机械感觉毛细胞中表达。对高表达的直系同源物pdzd7a的功能研究表明,其定位于感光细胞的连接纤毛区域以及幼鱼内耳毛细胞和神经肥大的顶端区域。在睫状体基底部有较强的pdzd7a定位,并且成人视网膜中的感光细胞外段标记更为弥散,表明发育后功能。pdzd7a的吗啉基因敲除产生了以前在斑马鱼Usher基因突变中描述过的Usher-like症状,包括盘旋、惊吓反射减弱和静纤毛紊乱。单独使用时,半强度吗啉基因敲除不会损害平衡或视网膜细胞存活,而联合使用部分pdzd7a;gpr98基因敲除导致Usher-like环化和视网膜变性。此外,在联合部分pdzd7a中未观察到Usher-like表型;ush2a击倒。然而,单独敲除ush2a或pdzd7a都会产生类似的中等程度的光感受器细胞死亡,并且当胚胎接受全剂量ush2a吗啉结合半剂量pdzd7吗啉的治疗时,这种退化会显著增加。在这些视网膜中观察到的细胞死亡仅限于感光细胞,而视网膜在其他方面形态正常。

邹等人(2014)生成Pdzd7基因敲除小鼠,观察到这些小鼠患有先天性重度耳聋,通过听觉脑干反应、畸变产物耳声发射和耳蜗微音器测试进行评估,但通过其行为评估前庭功能正常。Pdzd7-null小鼠的静纤毛束紊乱,耳蜗外毛细胞的机械传导电流和敏感性降低。野生型和Pdzd7-null小鼠的免疫染色实验表明,Pdzd 7决定USH2的定位(参见276901)蛋白质复合物,由USH2A组成(608400)GPR98(ADGRV1;602851)、和WHRN(607928)耳蜗毛细胞发育过程中与踝关节的联系,可能是通过与3种蛋白质的直接相互作用。相反,在USH突变小鼠模型中的实验表明,Pdzd7定位到脚踝链接需要USH2蛋白。然而,在Pdzd7-/-光感受器中,3个USH2蛋白在睫状膜复合体处保持不变,在1个月大的基因敲除小鼠中,视杆和视锥细胞的视网膜电图反应正常。作者得出结论,尽管USH2复合体的组织在光感受器中似乎有所不同,但PDZD7在发育耳蜗毛细胞的踝关节USH2复合物的组织中显然起着重要作用。


ALLELIC变体( 11精选示例):

.0001ⅡA型USHER综合征视网膜疾病

耳聋,自动耳塞57,包括

Usher综合征IIA型视网膜疾病

Ebermann等人(2010年)分析了2名患有USH2A的法裔加拿大姐妹的PDZD7基因(276901)USH2A基因移码突变纯合子(608400.0003),并在其中一对姐妹中发现PDZD7基因中额外的从头开始1-bp插入(166insC)的杂合性,这对姐妹患有早期和更严重的视网膜疾病。PDZD7突变在受影响较小的姐妹或254名对照中不存在。

耳聋,常染色体隐性57

在一名患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003),Guan等人(2018)PDZD7基因第2外显子中先前报告的1-bp插入(c.166_167insC)和1-bp缺失(c.1207delC;612971.0011)在外显子8中,这两种引起移码的基因预计会导致提前终止密码子(分别为Arg56ProfsTer24和His403IlefsTer36)。未受影响的父母各为1个突变的杂合子,在1751名中国对照组中均未发现这两个突变。ExAC或gnomAD数据库中未发现1-bp缺失,而gnomAD数据中15/276238名个体的1-bp插入呈杂合状态(次要等位基因频率,0.0000543)。受影响的中国同胞在典型的Usher综合征基因突变为阴性,他们分别在22岁和19岁时没有夜盲症或视野缺陷。


.0002 USHER综合征,IIC型,GPR98/PDZD7 DIGENIC

PDZD7,9-BP INS,NT2194
   RCV000023975型

一名51岁的德国男性Usher综合征患者(见USH2C;605472),Ebermann等人(2010年)在PDZD7基因中发现了一个9 bp杂合缺失(2194_2203del)和GPR98基因中的一个杂合移码突变(602851.0010). 在GPR98或PDZD7中未检测到第二个突变等位基因。他的未受影响的妹妹是PDZD7突变的杂合子,但没有携带GPR98突变;在405名对照组中未发现PDZD7突变。


.0003耳聋,自动耳塞57

来自伊朗近亲家庭(L-445)的4名患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003),Booth等人(2015)确定PDZD7基因中c.307G-c颠倒(c.307G-c,NM_001195263.1)的纯合子,导致在PDZ1结构域内的保守残基处发生gly103-to-arg(G103R)替换。该突变与家族疾病完全分离,在300个种族匹配的对照组或1000个基因组项目数据库中未发现,但在Exome Variant Server和ExAC数据库中分别存在0.012%和0.008%的次要等位基因频率。


.0004耳聋,自动耳塞57

PDZD7,MET285ARG公司
   RCV000656350型

伊朗一家系(L-755)3名患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003),Booth等人(2015)确定PDZD7基因突变的复合杂合性:第一个是c.854T-G颠倒(c.854T-G,NM_001195263.1),导致PDZ2结构域内的met285-to-arg(M285R)替换,第二个是c.1500C-a颠倒,导致tyr500-ter(Y500X)替换。这些突变与家族中的疾病完全隔离,在300个种族匹配的对照组或ExAC数据库中未发现。


.0005耳聋,自动耳塞57

为了讨论PDZD7基因中的c.1500C-A颠倒(c.1500C-A,NM_001195263.1),导致tyr500-ter(Y500X)替代,在3名患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003)由Booth等人(2015),请参阅612971.0004.


.0006耳聋,自动耳塞57

来自伊朗血亲家庭(L-8900092)的2名患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003),Booth等人(2015)确定PDZD7基因中c.1576C-T转换的纯合子(c.1576C-T,NM_001195263.1),导致gln526-to-ter(Q526X)替换。在300个种族匹配的对照组或ExAC数据库中未发现突变;家人无法提供DNA。


.0007耳聋,自动耳塞57

来自伊朗血亲家庭(L-8600482)的3名患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003),Booth等人(2015)确定PDZD7基因中c.682G-a转换的纯合子(c.682G-a,NM_001195263.1),导致PDZ2域中的gly228-to-arg(G228R)替换。该突变与家族中的疾病完全隔离,在300个种族匹配的对照组或1000基因组项目、Exome Variant Server或ExAC数据库中均未发现该突变。


.0008耳聋,自动耳塞57

一名12岁非综合征性听力损失德国女孩(DFNB57;618003),Vona等人(2016)确定PDZD7基因第10外显子中c.1648C-T转换的复合杂合性(c.1648C-T,NM_001195263.1),导致gln550-to-ter(Q550X)替换和1-bp缺失(c.2107delA;612971.0009)在外显子14中,导致移码,预计会导致过早终止密码子(Ser703ValfsTer20)。她的未受影响的父母和兄弟都是其中一个突变的杂合子,但在耳聋变异、ExAC、Exome变异服务器或Leiden开放变异数据库中均未发现这两个突变。然而,此前曾报道过c.2107delA变异体(Ebermann等人,2010年)405名对照组中的3名相关个体;Vona等人(2016)计算出缺失的次要等位基因频率为0.000018。


.0009耳聋,自动耳塞57

为了讨论PDZD7基因第14外显子中的1-bp缺失(c.2107delA,NM_001195263.1),导致移码,预计会导致过早终止密码子(Ser703ValfsTer20),该密码子在一名德国非综合征性聋女孩(DFNB57;618003)由Vona等人(2016),请参阅612971.0008.


.0010耳聋,自动耳塞57

一名患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003),Guan等人(2018)确定PDZD7基因第2外显子中c.197G-T颠倒的纯合子,在高度保守的残基处导致arg66-to-leu(R66L)替换。他们未受影响的父母是该突变的杂合子,这在1751名中国对照组或ExAC或gnomAD数据库中均未发现。


.0011耳聋,自动耳塞57

PDZD7,1-BP DEL,1207C
   RCV000656357型

为了讨论PDZD7基因第8外显子中的1-bp缺失(c.1207delC),导致移码,预计会导致过早终止密码子(His403IlefsTer36),该密码子在2名患有非综合征性听力损失(DFNB57)的中国同胞(CN-0501754家系)中发现处于复合杂合状态;618003)由Guan等人(2018),请参阅612971.0001.


参考文献

  1. Booth,K.T.、Azaiez,H.、Kahrizi,K.、Simpson,A.C.、Tollefson,W.T.A.、Sloan,C.M.、Meyer,N.C.、Babanejad,M.、Ardalani,F.、Arzhangi,S.、Schnieders,M.J.、Najmabadi,H.和Smith,R.J.H。PDZD7和听力损失:不仅仅是一种调节剂。美国医学遗传学杂志。167A:2957-29652015年。[公共医学:26416264,相关引文][全文]

  2. Ebermann,I.、Phillips,J.B.、Liebau,M.C.、Koenekoop,R.K.、Schermer,B.、Lopez,I.,Schafer,E.、Roux,A.-F.、Dafinger,C.、Bernd,A.、Zrenner,E.、Claustres,M、Blanco,B.、Nurnberg,G.、Nurn伯格,P.、Ruland,R.、Westerfield,M.、Benzing,T.、Bolz,H.J。PDZD7是视网膜疾病的调节剂,也是消化道Usher综合征的促成因素。临床杂志。投资。120: 1812-1823, 2010. 注:勘误表:J.Clin。投资。仅121:821,2011年。[公共医学:20440071,图像,相关引文][全文]

  3. Guan,J.,Wang,H.,Lan,L.,Wang-L.,Yang,J.、Xie,L.、Yin,Z.、Xiong,W.、Zhao,L.和Wang,D.、Wang,Q。两个非综合征性耳聋中国家系中新的隐性PDZD7双等位基因突变。美国医学遗传学杂志。176A:99-1062018年。[公共医学:29048736,相关引文][全文]

  4. 施耐德,E.,马克,T.,达瑟,A.,弗雷·马恩,G.,拜尔,V.,法卡斯,R.,施耐德-拉兹克,B.,科尔施密特,N.,格罗斯曼,B.,鲍斯,K。近亲家族中PDZD7通过相互易位的纯合性破坏:Usher综合征蛋白相互作用组的一个新成员导致先天性听力损伤。嗯,鼹鼠。遗传学。18: 655-666, 2009.[公共医学:19028668,相关引文][全文]

  5. Vona,B.、Lechno,S.、Hofrichter,M.A.H.、Hopf,S.,Lassig,A.K.、Haaf,T.、Keilmann,A.、Zechner,U.、Bartsch,O。PDZD7作为非综合征性听力损失基因的确认。耳朵听。37:e238-e246,2016年。注:电子文章。[公共医学:26849169,相关引文][全文]

  6. 邹,J.,郑,T.,任,C.,Askew,C.,Liu,X.-P.,Pan,B.,Holt,J.R.,Wang,Y.,Yang,J。PDZD7的缺失破坏了耳蜗毛细胞中的Usher综合征2型蛋白复合物,并导致小鼠听力损失。嗯,鼹鼠。遗传学。23: 2374-2390, 2014.[公共医学:24334608,相关引文][全文]


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阿洛佩兹:2016年10月17日
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特里:2011年5月3日
卡罗尔:2011年4月27日
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*612971

PDZ域-包含7;PDZD7型


HGNC批准的基因符号:PDZD7

细胞遗传学位置:10q24.31 基因组坐标(GRCh38): 10:101,007,679-101,031,129 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
10季度24.31 {Usher综合征IIA型视网膜疾病,}修饰语 276901 常染色体隐性
耳聋,常染色体隐性遗传57 618003 常染色体隐性
Usher综合征,IIC型,GPR98/PDZD7双基因 605472 常染色体隐性;双基因显性

文本

克隆和表达

Schneider等人(2009年)利用位置克隆从t(10;11)易位的连接片段中鉴定PDZD7基因。他们鉴定了4种PDZD7亚型;亚型A和B包含2个PDZ结构域,较短的亚型C和D分别不包含PDZ结构区和1个PDZ域。RT-PCR分析检测到PDZD7在人类皮质中表达,而在人类内耳中表达较弱。


基因结构

Schneider等人(2009年)报告称,PDZD7由16个外显子组成,跨越23.3kb,产生4种不同的转录物。A和B亚型分别由外显子2至8或9编码,C和D亚型分别由外显子6至13和外显子13至16编码。


映射

通过定位克隆,Schneider等人(2009年)将PDZD7基因映射到染色体10q24.3。


基因功能

通过GST下拉分析和Western blot分析,Schneider等人(2009)表明PDZD7与HEK293T细胞中的SANS(USH1G;607696)相互作用。小鼠视网膜GST下拉试验表明PDZD7也与和谐蛋白相互作用(USH1C;605242)。

Ebermann等人(2010年)对人类胎儿大脑进行了酵母2杂交筛选,观察到PDZD7的PDZ2结构域与GPR98(602851)的C末端细胞内结构域的相互作用,包括其PDZ结合基序。免疫共沉淀研究证实了这种相互作用,并揭示其由PDZD7的PDZ2结构域和GPR98的PDZ结合基序介导。此外,共免疫沉淀研究表明PDZD7的第一和第二个PDZ结构域与USH2A(608400)相互作用;没有C末端PDZ结合基序的USH2A的截短版本显示交互作用减少。


细胞遗传学

Schneider等人(2009年)在一名非综合征型先天性感音神经性听力障碍男孩中发现了一个纯合子互惠46,XY t(10;11),t(10,11)易位。8岁时检查未显示任何视网膜色素变性或前庭功能障碍的迹象。父母和他们的其他4个孩子都是杂合子易位携带者。FISH分析将断点定位在PDZD7基因内含子10中的染色体10q24.3上,并定位在染色体11q23.3上,与其他2个非综合征性耳聋基因RDX(179410)和TECTA(602574)非常接近(小于5Mb)。10q24.3断点会破坏PDZD7的C和D亚型的开放阅读框架。Schneider等人(2009年)认为,PDZD7基因可导致非综合征常染色体隐性聋,也是Usher综合征的主要候选基因(见276900)。Vona等人(2016年)对该患者进行了随访,其15岁以下的听力测试显示稳定的倾斜感音神经性聋。在15.5岁时进行彻底的眼科检查,没有发现视网膜变性疾病的迹象。


分子遗传学

Usher综合征IIA型视网膜疾病的修饰

Ebermann等人(2010年)对2名患有USH2A的法裔加拿大姐妹(276901)进行了PDZD7基因分析,并在其中1名姐妹中发现了新发移码突变(612971.0001)的杂合性,这些姐妹患有早期和更严重的视网膜疾病。作者得出结论,PDZD7是USH2A患者的视网膜疾病调节剂。

Usher综合征IIC型,GPR98/PDZD7 Digenic

在一名患有II型Usher综合征的51岁德国男子(见USH2C,605472)中,Usher综合症基因USH2A(608400)、WHRN(607928)和CLRN1(606397)突变为阴性,Ebermann等人(2010年)在GPR98基因(602851.0010)中发现了杂合移码突变以及PDZD7基因中的杂合移码突变(612971.0002)。在GPR98或PDZD7中未检测到第二个突变等位基因。

耳聋,常染色体隐性57

在4个不相关的伊朗家庭中,将常染色体隐性非综合征性听力损失定位到10号染色体(DFNB57;618003),Booth等人(2015)确定了PDZD7基因突变的纯合性或复合杂合性(612971.0003-612971.0007)这与每个家庭的疾病完全隔离,在种族匹配的对照组中没有发现。这些患者的眼科检查没有发现异常。

在一名患有非综合征性听力损失的德国女孩中,Vona等人(2016)确定了PDZD7基因中无义突变(Q550X;612971.0008)和1 bp缺失(612971.00 009)的复合杂合性。12岁时的眼科评估,包括眼底镜检查、眼底自体荧光、视网膜电图和光学相干断层扫描,显示视网膜健康。

在分离常染色体隐性遗传非综合征性耳聋的2个无关中国家庭的受累成员中,Guan等人(2018)确定了PDZD7基因突变的纯合子或复合杂合子(612971.0001、612971.010和612971.011)。这两个家族中的突变与疾病分离,在1751名中国对照组中未发现。作者指出,其中一个突变(c.166_167insC;612971.001)以前曾被报道为Usher综合征的视网膜表型修饰物(Ebermann等人,2010)。2名携带c.166_167insC复合杂合基因并伴有另一个移码突变(612971.0011)的中国同胞,其经典Usher综合征基因突变为阴性,在22岁和19岁时分别没有夜盲症或视野缺陷。


动物模型

Ebermann等人(2010年)对斑马鱼中的pdzd7进行了表征,并确定了2个同源基因pdzd7a和pdzd5b,它们在内耳的视网膜细胞和机械感觉毛细胞中表达。对高表达的直系同源物pdzd7a的功能研究表明,其定位于感光细胞的连接纤毛区域以及幼鱼内耳毛细胞和神经肥大的顶端区域。在睫状体基底部有较强的pdzd7a定位,并且成人视网膜中的感光细胞外段标记更为弥散,表明发育后功能。pdzd7a的吗啉基敲低产生Usher样症状,这在斑马鱼Usher基因突变中已有描述,包括盘旋、惊吓反射减少和立体纤毛紊乱。单独使用时,半强度吗啉基因敲除不会损害平衡或视网膜细胞存活,而联合使用部分pdzd7a;gpr98基因敲低导致Usher样盘旋和视网膜变性。此外,在联合部分pdzd7a中未观察到Usher-like表型;ush2a击倒。然而,单独敲除ush2a或pdzd7a都会产生类似的中等程度的光感受器细胞死亡,并且当胚胎接受全剂量ush2a吗啉结合半剂量pdzd7吗啉的治疗时,这种退化会显著增加。在这些视网膜中观察到的细胞死亡仅限于感光细胞,而视网膜在其他方面形态正常。

Zou等人(2014年)产生了Pdzd7基因敲除小鼠,并观察到这些小鼠患有先天性重度耳聋,通过听觉脑干反应、畸变产物耳声发射和耳蜗微音器测试进行评估,但通过行为评估,前庭功能正常。Pdzd7-null小鼠的静纤毛束紊乱,耳蜗外毛细胞的机械传导电流和敏感性降低。野生型和Pdzd7-null小鼠的免疫染色实验表明,Pdzd 7可确定USH2(参见276901)蛋白复合物的定位,该复合物由USH2A(608400)、GPR98(ADGRV1;602851)和WHRN(607928)组成,可能通过与3种蛋白的直接相互作用,定位到发育中耳蜗毛细胞的踝关节。相反,在USH突变小鼠模型中的实验表明,Pdzd7定位到脚踝链接需要USH2蛋白。然而,在Pdzd7-/-光感受器中,3个USH2蛋白在睫状膜复合体处保持不变,在1个月大的基因敲除小鼠中,视杆和视锥细胞的视网膜电图反应正常。作者得出结论,尽管USH2复合体的组织在光感受器中似乎有所不同,但PDZD7在发育耳蜗毛细胞的踝关节USH2复合物的组织中显然起着重要作用。


等位基因变体 11个精选示例):

.0001ⅡA型USHER综合征视网膜疾病

耳聋,自动耳塞57,包括
PDZD7,1-BP INS,166C({dbSNP rs760796701})
单号:rs587776894,临床变量:RCV000023974、RCV000656379、RCV001008540

Usher综合征IIA型视网膜疾病

Ebermann等人(2010年)分析了2名患有USH2A(276901)的法裔加拿大姐妹的PDZD7基因,她们纯合子的USH2A基因发生移码突变(608400.0003),并在其中1名姐妹的PDZ D7基因中发现了额外从头1 bp插入(166insC)的杂合性,患有早期和更严重的视网膜疾病。PDZD7突变在受影响较小的姐妹或254名对照中不存在。

耳聋,常染色体隐性遗传57

在一名患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003)的中国兄弟姐妹(CN-0501754家系)中,Guan等人(2018)确定了PDZD7基因外显子2中先前报告的1-bp插入(c.166_167insC)和外显子8中的1-bp缺失(c.1207delC;612971.0011)的复合杂合性,这两种都会导致移码,预计会导致提前终止密码子(分别为Arg56ProfsTer24和His403IlefsTer36)。未受影响的父母各有1个突变是杂合子,这两个突变都没有在1751名中国对照中发现。ExAC或gnomAD数据库中未发现1-bp缺失,而gnomAD数据中15/276238名个体的1-bp插入呈杂合状态(次要等位基因频率,0.0000543)。受影响的中国同胞在典型的Usher综合征基因突变为阴性,他们分别在22岁和19岁时没有夜盲症或视野缺陷。


.0002 USHER综合征,IIC型,GPR98/PDZD7 DIGENIC

PDZD7,9-BP INS,NT2194
临床变量:RCV000023975

在一名51岁患有Usher综合征的德国男性患者(见USH2C;605472)中,Ebermann等人(2010年)在PDZD7基因中发现了一个9 bp杂合缺失(2194_2203del),在GPR98基因中发现一个杂合移码突变(602851.010)。在GPR98或PDZD7中未检测到第二个突变等位基因。他的未受影响的妹妹是PDZD7突变的杂合子,但没有携带GPR98突变;在405名对照组中未发现PDZD7突变。


.0003耳聋,自动耳塞57

PDZD7、GLY103ARG
SNP:rs148695069,gnomAD:rs148695069,临床变量:RCV000656349、RCV001051892、RCV003989572

在患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003)的伊朗血亲家族(L-445)的4名受累同胞中,Booth等人(2015)确定了PDZD7基因中c.307G-c颠换的纯合子(c.307G-c,NM_001195263.1),导致PDZ1结构域内保守残基处的gly103-to-arg(G103R)替换。该突变与家族疾病完全分离,在300个种族匹配的对照组或1000个基因组项目数据库中未发现,但在Exome Variant Server和ExAC数据库中分别存在0.012%和0.008%的次要等位基因频率。


.0004耳聋,自动耳塞57

PDZD7,MET285ARG公司
SNP:rs1554835827,临床变量:RCV000656350

在一个患有非综合征性耳聋(DFNB57;618003)的伊朗家系(L-755)的3名受累同胞中,Booth等人(2015)确定了PDZD7基因突变的复合杂合性:第一个是c.854T-G颠倒(c.854T-G,NM_001195263.1),导致PDZ2域中的met285-to-arg(M285R)替代,第二次是c.1500C-a颠倒,导致了tyr500-ter(Y500X)的替代。这些突变与家族中的疾病完全隔离,在300个种族匹配的对照组或ExAC数据库中未发现。


.0005耳聋,自动耳塞57

PDZD7、TYR500TER
SNP:rs953422571,临床变量:RCV000656351

Booth等人(2015)对PDZD7基因中的c.1500C-A颠倒(c.1500C-A,NM_001195263.1)进行了讨论,该颠倒导致了tyr500-ter(Y500X)替代,这是在3名患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003)的伊朗同胞(L-755家族)中发现的复合杂合状态,见612971.004。


.0006耳聋,自动耳塞57

PDZD7、GLN526TER
SNP:rs1554834186,临床变量:RCV000656352

在患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003)的伊朗血亲家族(L-8900092)的2名受累同胞中,Booth等人(2015)确定了PDZD7基因中c.1576C-T转换的纯合子(c.1576C-T,NM_001195263.1),导致gln526-to-ter(Q526X)替代。在300个种族匹配的对照组或ExAC数据库中未发现突变;无法从家庭成员那里获得DNA。


.0007耳聋,自动耳塞57

PDZD7、GLY228ARG
SNP:rs753034799,gnomAD:rs753034799,临床变量:RCV000656353、RCV002536314、RCV004547829

Booth等人(2015)在患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003)的伊朗血亲家族(L-8600482)的3名受累同胞中,确定了PDZD7基因中c.682G-a过渡的纯合子(c.682G-a,NM_001195263.1),导致PDZ2域中的gly228-to-arg(G228R)替换。该突变与家族中的疾病完全隔离,在300个种族匹配的对照组或1000基因组项目、Exome Variant Server或ExAC数据库中均未发现该突变。


.0008耳聋,自动耳塞57

PDZD7、GLN550TER
单核苷酸多态性:rs1554834161,临床变量:RCV000656354、RCV003424263

在一名患有非综合征性听力损失的12岁德国女孩(DFNB57;618003)中,Vona等人(2016年)确定了PDZD7基因第10外显子中c.1648C-T转换(c.1648C-T,NM_001195263.1)的复合杂合性,导致gln550-to-ter(Q550X)替换,以及外显子14中的1-bp缺失(c.2107delA;612971.009),导致移码,预计会导致提前终止密码子(Ser703ValfsTer20)。她的未受影响的父母和兄弟都是其中一个突变的杂合子,但在耳聋变异、ExAC、Exome变异服务器或Leiden开放变异数据库中均未发现这两个突变。然而,此前曾在405名对照组的3名相关个体中报告过c.2107delA变异体(Ebermann等人,2010年);Vona等人(2016)计算出缺失的次要等位基因频率为0.000018。


0.0009耳聋,常染色体隐性遗传57

PDZD7,1-BP DEL,2107A({dbSNP rs397516633})
单核苷酸多态性:rs397516633,gnomAD:rs397516633,临床变量:RCV000599609、RCV000656355、RCV001849292、RCV002490502、RCV004549450

关于PDZD7基因第14外显子中的1-bp缺失(c.2107delA,NM_001195263.1)的讨论,导致移码,预计会导致过早终止密码子(Ser703ValfsTer20),Vona等人(2016年)在一名非综合征性听力损失(DFNB57;618003)的德国女孩中发现该密码子处于复合杂合状态,参见612971.0008。


.0010耳聋,自动耳塞57

PDZD7、ARG66LEU
单号:rs1426679303,临床变量:RCV000656356

在一名患有非综合征性耳聋(DFNB57;618003)的中国同胞兄弟(CN-1507352家系)中,Guan等人(2018年)确定了PDZD7基因第2外显子中c.197G-T颠换的纯合子,导致在高度保守的残基上发生arg66-to-leu(R66L)替换。他们未受影响的父母是该突变的杂合子,这在1751名中国对照组或ExAC或gnomAD数据库中均未发现。


.0011耳聋,自动耳塞57

PDZD7,1-BP DEL,1207C
SNP:rs1554835103,临床变量:RCV000656357

关于PDZD7基因第8外显子中的1-bp缺失(c.1207delC)引起的移码,预测会导致过早终止密码子(His403IlefsTer36)的讨论,Guan等人(2018)在2名患有非综合征性听力损失(DFNB57;618003)的中国同胞(CN-0501754家族)中发现了复合杂合状态,见612971.0001。


参考文献

  1. Booth,K.T.、Azaiez,H.、Kahrizi,K.、Simpson,A.C.、Tollefson,W.T.A.、Sloan,C.M.、Meyer,N.C.、Babanejad,M.、Ardalani,F.、Arzhangi,S.、Schnieders,M.J.、Najmabadi,H.和Smith,R.J.H。PDZD7和听力损失:不仅仅是一个修饰语。美国医学遗传学杂志。167A:2957-29652015年。[PubMed:26416264][全文:https://doi.org/10.1002/ajmg.a.37274]

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Marla J.F.O'Neill-更新时间:2018年1月6日
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