条目-*612584-球形输送机2;SPNS2型-OMIM公司
 
*612584

球形运输机2;SPNS2型


备选标题;符号

果蝇属蜘蛛,同源,2


HGNC批准的基因符号:SPNS2型

细胞遗传学位置:17页13.2 基因组坐标(GRCh38):17:4,498,881-4,539,035 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
17页13.2 ?耳聋,常染色体隐性遗传115 618457 应收账

文本

描述

SPNS2作为1-磷酸鞘氨醇(S1P)转运蛋白发挥作用。它似乎在心脏发育、淋巴细胞追踪和听觉功能中发挥作用(总结如下Chen等人,2014年).


克隆和表达

Kawahara等人(2009年)据报道,人类SPNS2含有548个氨基酸,与斑马鱼SPNS2具有显著同源性。


映射

Hartz(2009)根据SPNS2序列的比对(GenBankBC041772号)基因组序列(构建36.1)。


基因功能

Kawahara等人(2009年)结果表明,含有12个跨膜结构域的斑马鱼Spns2在转染中国仓鼠卵巢细胞的膜上表达。斑马鱼或人SPNS2的过度表达增加了S1P向培养基中的释放。Kawahara等人(2009年)结论是SPNS2在S1P分泌中起S1P转运体的作用。

Mendoza等人(2017年)表明1-磷酸鞘氨醇(S1P)不仅对原始T细胞的循环至关重要,而且对其生存也至关重要。使用转基因小鼠模型,Mendoza等人(2017年)证明淋巴管内皮细胞通过转运体SPNS2分泌S1P支持T细胞存活(612584),该S1P通过S1P1R(S1PR1;601974)对S1P1R的需求与受体在引导淋巴结排出方面的既定作用无关。S1P信号维持原始T细胞的线粒体含量,为细胞持续迁移提供能量。


分子遗传学

一名2岁女孩患有严重感音神经性聋(DFNB115;618457),Ingham等人(2019年)确定SPNS2基因突变的复合杂合性,移码突变(612584.0001)和一个3 bp的帧内删除(612584.0002),在gnomAD数据库中均未找到这两个数据库。此外,作者使用1000个基因组数据集输入的数据,对英国1958年出生队列中6099名出生于1周内的人的44至45岁年龄段测得的听觉阈值与小鼠中37个与耳聋相关的候选基因的基因组标记进行了测试。包括SPSN2在内的11个测试基因显示,在1 kHz或4 kHz或两种频率下,标记与阈值有显著关联,表明这些基因可能在人类听力的正常变异中发挥作用。


动物模型

Kawahara等人(2009年)发现斑马鱼Spns2中N-乙基-N-亚硝基脲诱导的arg153-to-ser突变导致心脏裂。人类SPNS2的表达,但不表达人类SPNS1(612583),扭转了缺陷。通过S1P注射或在胚胎外组织卵黄合胞层中重新引入斑马鱼Spns2也挽救了缺陷。Kawahara等人(2009年)结论是SPNS2调节心肌前体迁移。

Chen等人(2014)发现缺乏Spns2的小鼠出现了渐进性听力损失。听力损伤最早可在2周龄时以高频检测到,到3周龄时,阈值在各种频率下进一步提高。Spns2缺乏小鼠的Corti器官中的感觉毛细胞也呈现进行性退化。进一步分析表明,Spns2缺陷小鼠的血管纹结构缺陷导致了内耳电位(EP)的快速下降,这先于感觉毛细胞的退化,并与听觉敏感性的丧失平行。与EP水平降低一致,作者观察到Spns2缺乏小鼠侧壁中参与正常EP形成和维持的关键蛋白表达降低。使用条件性Spns2敲除小鼠,作者证明了Spns2缺陷小鼠的缺陷是由内耳局部释放S1P的缺陷引起的,而不是Spns2的系统性缺陷。


ALLELIC变体( 2精选示例):

.0001失聪,自体移植115(1名患者)

SPSN2,2-BP DEL/1-BP INS,1066CC/T
   RCV000623687。。。

一名2岁女孩患有严重感音神经性聋(DFNB115;618457),Ingham等人(2019年)确定了SPSN2基因中2-bp缺失/1-bp插入(c.1066_1067delCCinsT)的复合杂合性,导致预测的移码,导致SPSN2中过早终止密码子(Pro356CysfsTer35)和框内3-bp缺失(c.955_957delTCC),导致1个残基(S319del;618410.0002). 她的未受影响的父母都是其中一个突变的杂合子,这两个突变都没有在gnomAD数据库中发现。


.0002失聪,自体移植115(1名患者)

为了讨论SPSN2基因中的框内3-bp缺失(c.955_957delTCC),导致1个残基(ser319del;S319del)缺失,该残基在一名2岁严重感音神经性聋女孩(DFNB115;618457)由Ingham等人(2019年),请参阅618410.0001.


参考文献

  1. Chen,J.、Ingham,N.、Kelly,J.,Jadeja,S.、Goulding,D.、Pass,J.和Mahajan,V.B.、Tsang,S.H.、Nijnik,A.、Jackson,I.J.、White,J.K.、Forge,A.、Jagger,D.、Steel,K.P。Spinster同源物2(Spns2)缺陷会导致早期进展性听力损失。公共科学图书馆-遗传学。2014年10月10日,e1004688。注:电子文章。[公共医学:25356849,相关引文][全文]

  2. P.A.哈特兹。个人沟通。马里兰州巴尔的摩,2009年2月6日。

  3. Ingham,N.J.、Pearson,S.A.、Vancollie,V.E.、Rook,V.、Lewis,M.A.、Chen,J.、Buniello,A.、Martelletti,E.、Preite,L.、Lam,C.C.、Weiss,F.D.、Powis,Z.、Suwannarat,P.、Lelliott,C.J.、Dawson,S.J.、White,J.K.、Steel,K.P。鼠标屏幕显示了小鼠和人类听力损失背后的多个新基因。《公共科学图书馆·生物》。17:e30001942019年。注:电子文章。[公共医学:30973865,相关引文][全文]

  4. 川原,A.,西施,T.,久野,Y.,福井,H.,山口,A.,Mochizuki,N。鞘脂转运蛋白Spns2在斑马鱼心肌前体的迁移中发挥作用。《科学》323:524-5272009。[公共医学:19074308,相关引文][全文]

  5. Mendoza,A.,Fang,V.,Chen,C.,Serasinghe,M.,Verma,A.,Muller,J.,Chaluvadi,V.S.,Dustin,M.L.,Hla,T.,Elemento,O.,Chipuk,J.E.,Schwab,S.R。淋巴内皮S1P促进原始T细胞的线粒体功能和存活。《自然》546:158-1612017。[公共医学:28538737,相关引文][全文]


Marla J.F.O'Neill-更新时间:2019年3月6日
Ada Hamosh-更新时间:2019年10月5日
Matthew B.Gross-更新日期:2018年6月13日
Bao Lige-更新时间:2018年6月13日
创建日期:
Patricia A.Hartz:2009年2月6日
阿洛佩兹:2019年3月6日
阿洛佩兹:2019年10月5日
mgross:2018年6月13日
mgross:2018年6月13日
麦克奥尔顿:2015年6月2日
mgross:2009年2月6日

*612584

球形运输机2;SPNS2型


备选标题;符号

果蝇属蜘蛛,同源,2


HGNC批准的基因符号:SPNS2

细胞遗传学位置:17p13.2 基因组坐标(GRCh38): 17:4,498,881-4,539,035 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
17页13.2 ?耳聋,常染色体隐性遗传115 618457 常染色体隐性

文本

描述

SPNS2作为1-磷酸鞘氨醇(S1P)转运蛋白发挥作用。它似乎在心脏发育、淋巴细胞追踪和听觉功能中发挥作用(Chen等人,2014年总结)。


克隆和表达

Kawahara等人(2009年)报告称,人类SPNS2含有548个氨基酸,与斑马鱼SPNS2具有显著同源性。


映射

Hartz(2009)根据SPNS2序列(GenBank BC041772)与基因组序列(构建36.1)的比对,将SPNS2基因映射到染色体17p13.2。


基因功能

Kawahara等人(2009年)表明,斑马鱼Spns2包含12个跨膜结构域,在转染的中国仓鼠卵巢细胞的膜上表达。斑马鱼或人类SPNS2的过度表达增加了S1P在培养基中的释放。Kawahara等人(2009年)得出结论,SPNS2在S1P分泌中作为S1P转运体发挥作用。

Mendoza等人(2017年)表明,1-磷酸鞘氨醇(S1P)不仅对原始T细胞的循环至关重要,而且对其生存也至关重要。Mendoza等人(2017)使用转基因小鼠模型证明,淋巴管内皮细胞通过转运体SPNS2(612584)分泌S1P来支持T细胞的生存,该S1P通过T细胞上的S1P1R(S1PR1;601974)发出信号,S1P1R的需求与受体在引导淋巴结排出方面的既定作用无关。S1P信号维持幼稚T细胞的线粒体含量,为细胞提供持续迁移的能量。


分子遗传学

Ingham等人(2019年)在一名患有严重感音神经性耳聋的2岁女孩(DFNB115;618457)中,确定了SPNS2基因突变的复合杂合性、移码突变(612584.001)和3 bp帧内缺失(612594.002),这三者均未在gnomAD数据库中发现。此外,作者使用1000个基因组数据集输入的数据,对英国1958年出生队列中6099名出生于1周内的人的44至45岁年龄段测得的听觉阈值与小鼠中37个与耳聋相关的候选基因的基因组标记进行了测试。包括SPSN2在内的11个测试基因显示,在1 kHz或4 kHz或两种频率下,标记与阈值有显著关联,表明这些基因可能在人类听力的正常变异中发挥作用。


动物模型

Kawahara等人(2009年)发现,N-乙基-N-亚硝基脲诱导斑马鱼Spns2的arg153-to-ser突变导致心脏裂。人SPNS2的表达,而不是人SPNS1(612583)的表达,逆转了缺陷。通过S1P注射或在胚胎外组织卵黄合胞层中重新引入斑马鱼Spns2也挽救了缺陷。Kawahara等人(2009年)得出结论,SPNS2调节心肌前体迁移。

Chen等人(2014年)发现,Spns2缺乏小鼠出现了渐进性听力损失。听力损伤最早可在2周龄时以高频检测到,到3周龄时,阈值在各种频率下进一步提高。Spns2缺乏小鼠的Corti器官中的感觉毛细胞也呈现进行性退化。进一步分析表明,Spns2缺陷小鼠的血管纹结构缺陷导致了内耳电位(EP)的快速下降,这先于感觉毛细胞的退化,并与听觉敏感性的丧失平行。与EP水平降低一致,作者观察到Spns2缺乏小鼠侧壁中参与正常EP形成和维持的关键蛋白表达降低。利用条件性Spns2基因敲除小鼠,作者证明,Spns2缺乏小鼠的缺陷是由于缺乏内耳局部释放S1P所致,而非Spns2的全身缺乏。


ALLELIC变体 2个选定示例):

.0001失聪,自体移植115(1名患者)

SPSN2,2-BP DEL/1-BP INS,1066CC/T
SNP:rs1555537637,临床变量:RCV000623687、RCV000782132

Ingham等人(2019)在一名患有严重感音神经性耳聋(DFNB115;618457)的2岁女孩身上发现了SPSN2基因中2 bp缺失/1 bp插入(c.1066_1067delCCinsT)的复合杂合性,导致了预计会导致提前终止密码子(Pro356CysfsTer35)的移码,以及SPSN2基因中的框内3 bp缺失(c.955_957delTCC),导致1个残基缺失(S319del;618410.0002)。她的未受影响的父母都是其中一个突变的杂合子,这两个突变都没有在gnomAD数据库中发现。


.0002死亡,自体凹陷115(1名患者)

SPSN2,3-BP DEL,955TCC
单核苷酸多态性:rs749994718,gnomAD:rs749994718,临床变量:RCV000622741、RCV000782133

Ingham等人(2019年)在一名患有严重感音神经性聋(DFNB115;618457)的2岁女孩身上发现,SPSN2基因中的框内3-bp缺失(c.955_957delTCC)导致1个残基(ser319del;S319del)缺失,这是一种复合杂合状态,请参见618410.0001。


参考文献

  1. Chen,J.、Ingham,N.、Kelly,J.,Jadeja,S.、Goulding,D.、Pass,J.和Mahajan,V.B.、Tsang,S.H.、Nijnik,A.、Jackson,I.J.、White,J.K.、Forge,A.、Jagger,D.、Steel,K.P。Spinster同源物2(Spns2)缺陷会导致早期进展性听力损失。公共科学图书馆-遗传学。2014年10月10日,e1004688。注:电子文章。[公共医学:25356849][全文:https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1004688]

  2. P.A.哈特兹。个人沟通。马里兰州巴尔的摩,2009年2月6日。

  3. Ingham,N.J.、Pearson,S.A.、Vancolie,V.E.、Rook,V.、Lewis,M.A.、Chen,J.、Buniello,A.、Martelletti,E.、Preite,L.、Lam,C.C.、Weiss,F.D.、Powis,Z.、Suwannarat,P.、Lelliott,C.J.、Dawson,S.J.、White,J.K.、Steel,K.P。鼠标屏幕显示了小鼠和人类听力损失背后的多个新基因。《公共科学图书馆·生物》。17:e30001942019年。注:电子文章。[PubMed:30973865][全文:https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3000194]

  4. 川原,A.,西施,T.,久野,Y.,福井,H.,山口,A.,Mochizuki,N。鞘磷脂转运蛋白Spns2在斑马鱼心肌前体细胞迁移中起作用。《科学》323:524-5272009。[PubMed:19074308][全文:https://doi.org/10.1126/science.1167449]

  5. Mendoza,A.、Fang,V.、Chen,C.、Serasinghe,M.、Verma,A.、Muller,J.、Chaluvadi,V.S.、Dustin,M.L.、Hla,T.、Elemento,O.、Chipuk,J.E.、Schwab,S.R。淋巴内皮S1P促进原始T细胞的线粒体功能和存活。《自然》546:158-1612017。[公共医学:28538737][全文:https://doi.org/10.1038/nature22352]


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Marla J.F.O'Neill-更新时间:2019年3月6日
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