条目-*611606-微RNA 96;密尔96-OMIM公司
 
*611606

微RNA 96;密尔96


备选标题;符号

miRNA96基因
第96页


HGNC批准的基因符号:密尔96

细胞遗传学位置:7季度32.2 基因组坐标(GRCh38):7:129,774,692-129,774,769 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
7季度32.2 耳聋,常染色体显性遗传50 613074 AD公司

文本

描述

微RNA(miRNAs),如MIR96,是18到24个核苷酸的非编码调节性RNA,影响目标mRNAs的翻译和稳定性。MIR183型(611608)、MIR96和MIR182(611607)串联转录为单个多顺反子初级转录本(Xu等人,2007年).


克隆和表达

使用定量PCR和Northern印迹分析,Weston等人(2006)检测到成熟的Mirn183、Mirn96和Mirn182在小鼠内耳中表达,但在大脑或心脏中没有表达。RT-PCR检测到内耳和成人眼睛中编码这些miRNAs的初级转录物。原位杂交将Mirn183、Mirn96和Mirn182定位于耳蜗内外毛细胞以及前庭内啡肽嵴、胞囊和球囊的毛细胞。

通过微阵列分析和定量RT-PCR,Xu等人(2007)发现Mirn183、Mirn96和Mirn182在成年小鼠视网膜中高度表达。定性RT-PCR显示,从出生后第1天到成年,这些miRNAs在小鼠视网膜中的表达至少增加了10倍。成年小鼠视网膜的原位杂交显示,这些miRNAs在内核层的感光细胞和中间神经元中表达,在神经节细胞层中很少或没有表达。RT-PCR还显示Mirn183、Mirn96和Mirn182在小鼠嗅上皮和舌上皮中的表达。Xu等人(2007)注意到Mirn183、Mirn96和Mirn182具有显著的同一性,特别是在它们的种子序列中。


基因功能

Xu等人(2007)观察到Mirn182和Mirn96表达的昼夜变化,这与Adcy6的表达几乎相反(600294),一种推定的靶mRNA。报告基因分析证实,Mirn182和Mirn96靶向Adcy6的3-端UTR。Mitf的3素数UTR(156845)还包含假定的Mirn182和Mirn96结合位点,Mitf报告子的表达在Mirn 182或Mirn96存在时减少。当2个miRNAs被共同转染时,缺乏加性抑制,这表明它们在Adcy6和Mitf中竞争相同的靶位点。

使用表达阵列和定量RT-PCR,Krol等人(2010年)表明Mir211的表达(613753),米尔204(610942)和Mir183/Mir96/Mir182簇分别在小鼠视网膜的光适应和暗适应过程中被可逆上调和下调。光适应后这些miRNAs的积累增加与昼夜节律无关。这些和其他miRNAs在视网膜神经元中的半衰期似乎比杆双极细胞或Muller胶质细胞短得多。在培养的啮齿动物神经元和小鼠胚胎干细胞源性神经元中观察到类似的miRNA快速衰减。抑制剂研究表明,miRNA的转换受神经元活动的刺激。在硅片分析中鉴定出Atp1b3(601867),Slc1a1(133550)和Paip2b(611018)作为视网膜中Mir183/Mir96/Mir182簇的潜在靶点。小鼠视网膜中Slc1a1的表达随着暗适应增加而增加,伴随着Mir183/Mir96/Mir182的低表达。报告基因分析和其他研究证实了Mir183/Mir96/Mir182簇对Slc1a1 mRNA的调节。

Upton等人(2012年)发现持续的IRE1-alpha(604033)RNase激活导致选择的微小RNA(miR17,609416; miR34a,611172; miR96;和miR125b,610105)通常抑制caspase-2的翻译(600639)mRNA,从而大幅提高线粒体凋亡途径的启动蛋白酶的蛋白水平。在无细胞系统中,重组IRE1-alpha在不同于DICER的位置内切开microRNA前体(606241). 因此,Upton等人(2012年)结论是IRE1-alpha通过终止microRNA的生物生成来调节促凋亡蛋白的翻译,而非编码RNA是内质网应激反应的一部分。

Wang等人(2013)发现MIR185(615576)、MIR96和MIR223(300694)肝清道夫受体SRBI(SCARB1;601040),其在人类肝细胞系中高密度脂蛋白胆固醇(HDLC)的摄取中起作用。SRBI的3-端UTR包含MIR96、MIR185和MIR223的独立结合位点,并且这3种miRNA在抑制含有SRBI 3-端UTR的报告基因的表达方面显示出相加作用。转染MIR185和MIR96模拟物(而非MIR223模拟物)可显著降低佛波酯刺激的人类THP-1巨噬细胞样细胞中的SRBI mRNA水平,并抑制HDLC摄取。在apoE中(107741)-高脂饮食、肝脏Srbi升高的敲除小鼠与Mir96和Mir185含量降低的小鼠相一致(啮齿动物Srbi的3质点UTR没有Mir223靶点)。Wang等人(2013)结论是,这些miRNAs通过抑制SRBI的表达,在调节胆固醇摄取方面发挥作用。


基因结构

Xu等人(2007)确定MIRN183-MIRN96-MIRN182集群的跨度约为4.3kb。5素上游区域包含一个CpG岛,并具有感官器官相关转录因子的结合位点,包括OLF1(EBF;164343),OTX1(600036)和PAX2(167409).


映射

通过基因组序列分析,Xu等人(2007)将MIRN183-MIRN96-MIRN182簇定位到染色体7q32.2。他们将小鼠簇映射到染色体6A3的一个区域,该区域与人类染色体7q32.2具有同源性。


分子遗传学

Mencia等人(2009年)在MIR96(一种在内耳毛细胞中表达的miRNA)的种子区发现杂合点突变,导致常染色体显性进行性聋。已鉴定的突变对MIR96的生物发生有强烈影响,并导致mRNA靶向性显著降低。Mencia等人(2009年)提出这些突变改变了MIR96在维持毛细胞正常功能所需的基因表达谱中的调节作用。


动物模型

Lewis等人(2009年)报道了一种新的ENU诱导的小鼠突变体“dimenuendo”(Dmdo),在Mirn96的种子区发生了单碱基变化。杂合子表现为进行性听力丧失和毛细胞异常,而纯合子没有耳蜗反应。大多数microRNAs被认为通过与mRNAs上的特定位点结合来下调目标基因,所以种子突变会导致目标基因上调。微阵列分析显示96个转录本在纯合子中的表达显著改变;特别是Slc26a5(604943),月(164795)、Gfi1(600871),Ptprq公司(603317)和Pitpnm1(608794)被下调。超几何P值分析表明,突变体中有数百个基因上调。具有与突变种子互补的靶位点的不同基因被下调。

Schluter等人(2018)分析纯合型Dmdo/Dmdo小鼠,发现与野生型同窝小鼠相比,由于细胞尺寸减小,听觉后脑核团的大小显著减小,表明Dmdo/Dmdo小鼠发育停滞。进一步的分析表明,这些效应是Dmdo突变的听觉特异性效应,而不是更广泛的现象。梯形体内侧核(MNTB)的电生理分析表明,Dmdo突变选择性地影响MNTB神经元的放电行为,因为与对照动物的单一放电模式相比,Dmdo/Dmdo MNTB中更多的神经元在去极化时以持续放电模式作出反应。免疫反应性分析表明,这种观察到的放电模式是由于Dmdo/Dmdo小鼠中电压门控钾通道表达减少所致。突触囊泡糖蛋白-2(SV2A)的免疫标记;185860)结果表明,Held的Dmdo/Dmdo花萼成熟的突触结构发生了形态学变化,导致突触发育受阻,改变了突触传递中高频的短期可塑性,从而影响诱发的突触传递。


ALLELIC变体( 2精选示例):

.0001失聪,自动控制50

在一个5代西班牙大家族中,分离出常染色体显性非综合征进行性聋(DFNA50;613074),最初由描述Modamio-Hoybjor等人(2004年),Mencia等人(2009年)在MIR96前体序列的核苷酸13处发现了杂合子G-to-a转换。该突变取代了成熟序列保守的7核苷酸种子区内的第四个核苷酸。这种突变与家族中的表型完全分离,在462名非血缘关系正常的西班牙对照中未检测到。


.0002失聪,自动控制50

在一个分离非综合征进行性常染色体显性遗传性听力损失的西班牙3代家族中(DFNA50;613074),Mencia等人(2009年)在MIR96前体序列的核苷酸14处鉴定了杂合的C-to-a转变。该变体取代成熟序列保守种子区的第五个核苷酸。该突变与家族中的表型分离,在462名正常耳聋的西班牙对照中未发现。


参考文献

  1. Krol,J.、Busskamp,V.、Markiewicz,I.、Stadler,M.B.、Ribi,S.、Richter,J.,Duebel,J.和Bicker,S.,Fehling,H.J.、Schubeler,D.、Oertner,T.G.、Schratt,G.、Bibel,M.、Roska,B.、Filipowicz和W。光调节视网膜微RNA的特征揭示了快速转换是神经元微RNA的一个共同特性。手机141:618-6312010。[公共医学:20478254,相关引文][全文]

  2. Lewis,M.A.,Quint,E.,Glazier,A.M.,Fuchs,H.,De Angelis,M.H.,Langford,C.,van Dongen,S.,Abreu-Goodger,C.,Piipari,M.,Redshaw,N.,Dalmay,T.,Moreno-Pelayo,M.A.,Enright,A.J.,Steel,K.P。ENU诱导的miR-96突变与小鼠进行性听力损失相关。自然遗传学。41: 614-618, 2009.[公共医学:19363478,图像,相关引文][全文]

  3. Mencia,A.,Modamio-Hoybjor,S.,Redshaw,N.,Morin,M.,Mayo-Merino,F.,Olavarita,L.,Aguirre,L.A.,del Castillo,I.,Steel,K.P.,Dalmay,T.,Moreno,F.和Moreno-Pelayo,M.A。人类miR-96种子区的突变与非综合征性进行性听力损失有关。自然遗传学。41: 609-613, 2009.[公共医学:19363479,相关引文][全文]

  4. Modamio-Hoybjor,S.、Moreno-Pelayo,M.A.、Mencia,A.、del Castillo,I.、Chardenoux,S.,Morais,D.、Lathrop,M.、Petit,C.、Moreno,F。常染色体显性非综合征性耳聋的一个新基因座DFNA50位于DFNB17和DFNB13耳聋基因座之间的第7q32号染色体上。医学遗传学杂志。41:e14,2004年。注:电子文章。[公共医学:14757864,相关引文][全文]

  5. Schluter,T.、Berger,C.、Rosengauer,E.、Fieth,P.、Krohs,C.、Ushakov,K.、Steel,K.P.、Avraham,K.B.、Hartmann,A.K.、Felmy,F.、Nothwang,H。miR-96是听觉后脑正常发育所必需的。嗯,鼹鼠。遗传学。27: 860-874, 2018.[公共医学:29325119,相关引文][全文]

  6. Upton,J.-P.、Wang,L.、Han,D.、Wang、E.S.、Huskey,N.E.、Lim,L.,Truitt,M.、McManus,M.T.、Ruggero,D.、Goga,A.、Papa,F.R.、Oakes,S.A。IRE1α在内质网应激期间切割选定的微小RNA,以解除促凋亡半胱氨酸蛋白酶2的翻译。《科学》338:818-8222012。[公共医学:23042294,图像,相关引文][全文]

  7. Wang,L.,Jia,X.-J.,Jiang,H-J.,Du,Y.,Yang,F.,Si,S.-Y.,Hong,B。MicroRNAs 185、96和223通过转录后抑制抑制选择性高密度脂蛋白胆固醇摄取。摩尔。单元格。生物学33:1956-19642013年。[公共医学:23459944,图像,相关引文][全文]

  8. Weston,M.D.,Pierce,M.L.,Rocha-Sanchez,S.,Beisel,K.W.,Soukup,G.A。小鼠内耳中的MicroRNA基因表达。大脑研究1111:95-1042006。[公共医学:16904081,相关引文][全文]

  9. Xu,S.、Witmer,P.D.、Lumayag,S.,Kovacs,B.、Valle,D。小鼠视网膜的MicroRNA(miRNA)转录组和感觉器官特异性miRNA簇的鉴定。生物学杂志。化学。282: 25053-25066, 2007.[公共医学:17597072,相关引文][全文]


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*611606

微RNA 96;密尔96


备选标题;符号

miRNA96基因
第96页


HGNC批准的基因符号:MIR96

细胞遗传学位置:7q32.2 基因组坐标(GRCh38): 7:129,774,692-129,774,769 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
7季度32.2 耳聋,常染色体显性遗传50 613074 常染色体显性

文本

描述

微RNA(miRNAs),如MIR96,是18到24个核苷酸的非编码调节性RNA,影响目标mRNAs的翻译和稳定性。MIR183(611608)、MIR96和MIR182(611607)作为单个多顺反子初级转录物串联转录(Xu等人,2007)。


克隆和表达

使用定量PCR和Northern blot分析,Weston等人(2006年)在小鼠内耳中检测到成熟Mirn183、Mirn96和Mirn182的表达,但在大脑或心脏中没有。RT-PCR检测到内耳和成人眼睛中编码这些miRNAs的初级转录物。原位杂交将Mirn183、Mirn96和Mirn182定位于耳蜗内外毛细胞以及前庭内啡肽嵴、胞囊和球囊的毛细胞。

通过微阵列分析和定量RT-PCR,Xu等人(2007年)发现Mirn183、Mirn96和Mirn182在成年小鼠视网膜中高度表达。定性RT-PCR显示,从出生后第1天到成年,这些miRNAs在小鼠视网膜中的表达至少增加了10倍。成年小鼠视网膜的原位杂交显示,这些miRNAs在内核层的感光细胞和中间神经元中表达,在神经节细胞层中很少或没有表达。RT-PCR还显示Mirn183、Mirn96和Mirn182在小鼠嗅上皮和舌上皮中的表达。Xu等人(2007年)指出,Mirn183、Mirn96和Mirn182具有重要的同源性,特别是在其种子序列中。


基因功能

Xu等人(2007年)观察到Mirn182和Mirn96表达的昼夜变化,这与假定的靶mRNA Adcy6(600294)的表达几乎相反。报告基因分析证实,Mirn 182和Miln96靶向Adcy6的3原质UTR。Mitf(156845)的3-质体UTR也包含假定的Mirn182和Mirn96结合位点,Mitf报告子的表达在Mirn182或Mirn96存在时减少。当2个miRNAs被共同转染时,缺乏加性抑制,这表明它们在Adcy6和Mitf中竞争相同的靶位点。

Krol等人(2010)使用表达阵列和定量RT-PCR显示,在光适应和暗适应期间,Mir211(613753)、Mir204(610942)和Mir183/Mir96/Mir182簇的表达分别在小鼠视网膜中可逆上调和下调。光适应后这些miRNAs的积累增加与昼夜节律无关。这些和其他miRNAs在视网膜神经元中的半衰期似乎比杆双极细胞或Muller胶质细胞短得多。在培养的啮齿动物神经元和小鼠胚胎干细胞源性神经元中观察到类似的miRNA快速衰减。抑制剂研究表明,miRNA的转换受神经元活动的刺激。在电子分析中,确定Atp1b3(601867)、Slc1a1(133550)和Paip2b(611018)为视网膜中Mir183/Mir96/Mir182簇的潜在靶点。小鼠视网膜中Slc1a1的表达随着暗适应增加而增加,伴随着Mir183/Mir96/Mir182的低表达。报告基因分析和其他研究证实了Mir183/Mir96/Mir182簇对Slc1a1 mRNA的调节。

Upton等人(2012年)发现,持续的IRE1-alpha(604033)RNase激活会导致选择的小RNA(miR17,609416;miR34a,611172;miR96;和miR125b,610105)迅速衰退,这些小RNA通常会抑制caspase-2(600639)mRNA的翻译,从而大幅提高线粒体凋亡途径的启动蛋白酶的蛋白质水平。在无细胞系统中,重组IRE1-alpha在不同于DICER(606241)的位置内切开microRNA前体。因此,Upton等人(2012年)得出结论,IRE1-alpha通过终止microRNA的生物生成来调节促凋亡蛋白的翻译,而非编码RNA是内质网应激反应的一部分。

Wang等人(2013年)发现,MIR185(615576)、MIR96和MIR223(300694)下调肝脏清道夫受体SRBI(SCARB1;601040)的表达,该受体在人类肝细胞系中对高密度脂蛋白胆固醇(HDLC)的摄取中起作用。SRBI的3-端UTR包含MIR96、MIR185和MIR223的独立结合位点,并且这3种miRNA在抑制含有SRBI 3-端UTR的报告基因的表达方面显示出相加作用。转染MIR185和MIR96模拟物(而非MIR223模拟物)可显著降低佛波酯刺激的人类THP-1巨噬细胞样细胞中的SRBI mRNA水平,并抑制HDLC摄取。在高脂肪饮食的apoE(107741)基因敲除小鼠中,肝脏Srbi升高与Mir96和Mir185含量降低相一致(啮齿动物Srbi的3质点UTR没有Mir223靶点)。Wang等人(2013年)得出结论,这些miRNAs通过抑制SRBI的表达,在调节胆固醇摄取方面发挥作用。


基因结构

Xu等人(2007)确定了MIRN183-MIRN96-MIRN182簇的跨度约为4.3kb。5素上游区域包含一个CpG岛,并具有感官器官相关转录因子的结合位点,包括OLF1(EBF;164343)、OTX1(600036)和PAX2(167409)。


映射

通过基因组序列分析,Xu等人(2007)将MIRN183-MIRN96-MIRN182簇映射到染色体7q32.2。他们将小鼠簇映射到染色体6A3的一个区域,该区域与人类染色体7q32.2具有同源性。


分子遗传学

Mencia等人(2009年)在MIR96(一种在内耳毛细胞中表达的miRNA)的种子区域发现了杂合点突变,导致常染色体显性进行性聋。已鉴定的突变对MIR96的生物发生有强烈影响,并导致mRNA靶向性显著降低。Mencia等人(2009年)提出,这些突变改变了MIR96在维持毛细胞正常功能所需的基因表达谱中的调节作用。


动物模型

Lewis等人(2009年)报告了一种新的ENU诱导的小鼠突变体“dimenuendo”(Dmdo),在Mirn96的种子区发生了单碱基变化。杂合子表现为进行性听力丧失和毛细胞异常,而纯合子没有耳蜗反应。大多数microRNAs被认为通过与mRNAs上的特定位点结合来下调目标基因,所以种子突变会导致目标基因上调。微阵列分析显示96个转录本在纯合子中的表达显著改变;值得注意的是,Slc26a5(604943)、Ocm(164795)、Gfi1(600871)、Ptprq(603317)和Pitpnm1(608794)下调。超几何P值分析表明,突变体中有数百个基因上调。具有与突变种子互补的靶位点的不同基因被下调。

Schluter等人(2018年)分析了纯合型Dmdo/Dmdo小鼠,发现与野生型同卵鼠相比,由于细胞尺寸减小,听觉后脑核的大小显著减小,表明Dmdo/Dmdo小鼠发育停滞。进一步的分析表明,这些效应是Dmdo突变的听觉特异性效应,而不是更广泛的现象。梯形体内侧核(MNTB)的电生理分析表明,Dmdo突变选择性地影响MNTB神经元的放电行为,因为与对照动物的单一放电模式相比,Dmdo/Dmdo MNTB中更多的神经元在去极化时以持续放电模式作出反应。免疫反应性分析表明,这种观察到的放电模式是由于Dmdo/Dmdo小鼠中电压门控钾通道表达减少所致。突触囊泡糖蛋白-2(SV2A;185860)的免疫标记显示,Held的Dmdo/Dmdo花萼的成熟突触结构发生了形态学变化,导致突触发育受阻,改变了突触传递中高频的短期可塑性,从而影响诱发的突触传递。


ALLELIC变体 2个选定示例):

.0001失聪,自动控制50

MIR96,13G-A
单号:rs587776522,临床变量:RCV000000913

在一个分离常染色体显性非综合征进行性听力损失的5代西班牙大家族(DFNA50;613074)中,最初由Modamio-Hoybjor等人描述。(2004),Mencia等人(2009)在MIR96前体序列的核苷酸13处鉴定出杂合的G-to-a转换。该突变取代了成熟序列保守的7核苷酸种子区内的第四个核苷酸。这种突变与家族中的表型完全分离,在462名非血缘关系正常的西班牙对照中未检测到。


.0002失聪,自动控制50

MIR96、14C-A
单号:rs587776523,临床变量:RCV000000914

在一个分离非综合征进行性常染色体显性遗传性耳聋(DFNA50;613074)的3代西班牙家系中,Mencia等人(2009年)在MIR96前体序列的核苷酸14处发现了杂合子C-a转换。该变体取代成熟序列保守种子区的第五个核苷酸。该突变与家族中的表型分离,在462名正常耳聋的西班牙对照中未发现。


参考文献

  1. Krol,J.、Busskamp,V.、Markiewicz,I.、Stadler,M.B.、Ribi,S.、Richter,J.,Duebel,J.和Bicker,S.,Fehling,H.J.、Schubeler,D.、Oertner,T.G.、Schratt,G.、Bibel,M.、Roska,B.、Filipowicz和W。光调节视网膜微RNA的特征揭示了快速转换是神经元微RNA的一个共同特性。手机141:618-6312010。[公共医学:20478254][全文:https://doi.org/10.1016/j.cell.2010.03.039]

  2. Lewis,M.A.,Quint,E.,Glazier,A.M.,Fuchs,H.,De Angelis,M.H.,Langford,C.,van Dongen,S.,Abreu-Goodger,C.,Piipari,M.,Redshaw,N.,Dalmay,T.,Moreno-Pelayo,M.A.,Enright,A.J.,Steel,K.P。ENU诱导的miR-96突变与小鼠进行性听力损失相关。自然遗传学。41: 614-618, 2009.[公共医学:19363478][全文:https://doi.org/10.1038/ng.369]

  3. Mencia,A.,Modamio-Hoybjor,S.,Redshaw,N.,Morin,M.,Mayo-Merino,F.,Olavarita,L.,Aguirre,L.A.,del Castillo,I.,Steel,K.P.,Dalmay,T.,Moreno,F.和Moreno-Pelayo,M.A。人类miR-96种子区的突变与非综合征性进行性听力损失有关。自然遗传学。41: 609-613, 2009.[公共医学:19363479][全文:https://doi.org/10.1038/ng.355]

  4. Modamio-Hoybjor,S.、Moreno-Pelayo,M.A.、Mencia,A.、del Castillo,I.、Chardenoux,S.,Morais,D.、Lathrop,M.、Petit,C.、Moreno,F。常染色体显性非综合征性耳聋的一个新基因座DFNA50位于DFNB17和DFNB13耳聋基因座之间的第7q32号染色体上。医学遗传学杂志。41:e14,2004年。注:电子文章。[公共医学:14757864][全文:https://doi.org/10.1136/jmg.2003.01250]

  5. Schluter,T.、Berger,C.、Rosengauer,E.、Fieth,P.、Krohs,C.、Ushakov,K.、Steel,K.P.、Avraham,K.B.、Hartmann,A.K.、Felmy,F.、Nothwang,H。miR-96是听觉后脑正常发育所必需的。嗯,鼹鼠。遗传学。27: 860-874, 2018.[公共医学:29325119][全文:https://doi.org/10.1093/hmg/ddy007]

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贡献者:
Bao Lige-更新时间:2018年8月15日
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创建日期:
Patricia A.Hartz:2007年11月20日

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