条目-*608792-GIPC PDZ域包含家族,成员3;GIPC3型-OMIM公司
 
*608792

GIPC PDZ域名包含家庭,成员3;GIPC3型


备选标题;符号

GAIP C-末端侵入蛋白3


HGNC批准的基因符号:GIPC3型

细胞遗传学位置:19页13.3 基因组坐标(GRCh38):19:3,585,478-3,593,541 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
19页13.3 耳聋,常染色体隐性遗传15 601869 应收账

文本

克隆和表达

通过胎肺RNA的基因组序列分析和RT-PCR,Saitoh等人(2002年)获得编码GIPC3。预测的312-氨基酸蛋白包含一个N端GIPC同源结构域(GH1)、一个中心PDZ结构域和一个C端GH2结构域。GIPC3与GIPC1具有59.9%的氨基酸同源性(605072),55.3%认同GIPC2(619089)和57.2%与爪蟾科米特的身份相同。Northern blot分析检测到4.5-kb GIPC3转录本几乎普遍表达,在小肠中表达最高。RNA斑点杂交分析显示,GIPC3在空肠、淋巴结、顶叶、胎儿脾脏和胎儿胸腺中的表达最高。Northern blot分析检测到GIPC3在宫颈癌、黑色素瘤和慢性粒细胞白血病细胞系以及所检测的7个胃癌细胞系中的2个中的表达。


基因结构

Saitoh等人(2002年)确定GIPC3基因包含6个外显子。


映射

通过基因组序列分析,Saitoh等人(2002年)将GIPC3基因定位到染色体19p13.3。


分子遗传学

在一个印度和荷兰常染色体隐性遗传语言前发病感音神经性耳聋家系的受累成员中(DFNB15;601869),Charizopoulou等人(2011年)在GIPC3基因(L262R,608792.0001和W301X,608792.0002)。该基因在Charizopoulou等人(2011年)发现小鼠基因Gipc3的突变与小鼠的常染色体隐性聋有关(见动物模型)。

Rehman等人(2011年)在GIPC3基因中鉴定出7种不同的纯合子突变,包括1个移码和6个错义(参见。,601869.0003-601869.0006)在7个无血缘关系的巴基斯坦常染色体隐性遗传非综合征性耳聋家族的受累成员中,包括之前报道的2个患有DFNB72的家族Ain等人(2007)除1个突变外,其他所有突变(R189C;601869.0006)位于GH1或GH2域中。


动物模型

通过定位克隆常染色体隐性遗传早发性年龄相关听力损失小鼠模型(ahl5),Charizopoulou等人(2011年)在Gipc3基因第2外显子中发现一个纯合G115R突变,影响蛋白质的PDZ结构域。Gipc3基因的突变也被发现是小鼠幼年听源性单基因癫痫(jams1)表型的基础,在该表型中,受影响的小鼠在生命早期表现出癫痫易感性,并随着年龄的增长而消失。G115R突变导致Gipc3蛋白减少。突变小鼠的组织病理学研究显示,外毛细胞和内毛细胞的静纤毛束结构不规则,Corti器官的迟发性变性从底部开始,向顶端发展。同时,螺旋神经节表现出严重的神经元丢失,在耳蜗底部和中尖区最为明显。这些数据表明,Gipc3是头发束出生后成熟以及毛细胞和螺旋神经节长期存活所必需的。突变小鼠的内外毛细胞均显示出机械传递缺陷,这与钾通道活性缺陷有关。听源性癫痫易感性和后期抵抗与听源性脑干反应振幅的增加和随后的下降相关。在野生型小鼠中,Gipc3定位于内外毛细胞、耳蜗螺旋神经节神经元、前庭毛细胞和前庭神经节神经元的细胞质。


ALLELIC变体( 6精选示例):

.0001耳聋,自动耳塞15

常染色体隐性遗传性耳聋(DFNB15;601869) (Chen等人,1997年),Charizopoulou等人(2011年)在GIPC3基因的第5外显子中发现了纯合785T-G颠倒,导致GH2结构域中一个高度保守的残基发生了leu262-arg(L262R)替换。322条控制染色体未检测到突变。该耳聋为非综合征性,且为语言前发病。


.0002耳聋,自动耳塞15

荷兰常染色体隐性聋(DFNB15;601869),基因座DFNB95已被分配到该基因座,Charizopoulou等人(2011年)在GIPC3基因第6外显子中发现了纯合903G-a转换,导致trp301-to-ter(W301X)替换和蛋白质最后12个残基的丢失。312条控制染色体未发现突变。听力损失是双侧性的,感觉神经性的,在婴儿期发病早。


.0003耳聋,自动耳塞15

GIPC3,1-BP DUP,685G
   RCV000023734型

与DFNB15有血缘关系的巴基斯坦家庭的受影响成员(601869),Rehman等人(2011年)在GIPC3基因第4外显子中发现一个纯合1-bp重复(685dupG),导致GH2结构域移码和提前终止。572条控制染色体未发现突变。该家族此前曾被报道Ain等人(2007),并映射到基因座DFNB72。


.0004耳聋,自动耳塞15

患有DFNB15的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员(601869),Rehman等人(2011年)在GIPC3基因第5外显子中鉴定出纯合767G-a转换,导致GH2结构域中保守残基的gly256-to-asp(G256D)替换。572条控制染色体未发现突变。该家族此前曾被报道Ain等人(2007),并映射到基因座DFNB72。


.0005耳聋,自动耳塞15

患有DFNB15的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员(601869),Rehman等人(2011年)在GIPC3基因的外显子1中鉴定出纯合136G-a转换,导致GH1结构域中保守残基的gly46-to-arg(G46R)替换。590条控制染色体未发现突变。


.0006耳聋,自动耳塞15

患有DFNB15的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员(601869),Rehman等人(2011年)在GIPC3基因第3外显子中鉴定出纯合565C-T转换,导致PDZ结构域中保守残基的arg189-to-cys(R189C)替换。590条控制染色体未发现突变。


参考文献

  1. Ain,Q.,Nazli,S.,Riazuddin,S。常染色体隐性遗传非综合征性耳聋基因座DFNB72位于染色体19p13.3上。嗯,遗传学。122: 445-450, 2007.[公共医学:17690910,相关引文][全文]

  2. Charizopoulou,N.、Lelli,A.、Schraders,M.、Ray,K.、Hildebrand,M.S.、Ramesh,A.、Srisailapathy,C.R.、Oostrik,J.、Admiraal,R.J.C.、Neely,H.R.、Latoche,J.R.、Smith,R.J.H.、Northup,J.K.、Kremer,H.、Holt,J.R.、Noben Trauth,K。Gipc3突变与小鼠和人类的听源性癫痫和感音神经性听力损失相关。自然社区。2: 201, 2011. 注:电子文章。[公共医学:21326233,图像,相关引文][全文]

  3. Chen,A.、Wayne,S.、Bell,A.、Ramesh,A.、Srisailapathy,C.R.、Scott,D.A.、Sheffield,V.C.、Van Hauwe,P.、Zbar,R.I.、Ashley,J.、Lovett,M.、Van Camp,G.、Smith,R.J.、。常染色体隐性遗传非综合征性耳聋的新基因定位于染色体3q或19p。美国医学遗传学杂志。71: 467-471, 1997.[公共医学:9286457,相关引文]

  4. Rehman,A.U.、Gul,K.、Morell,R.J.、Lee,K.,Ahmed,Z.M.、Riazuddin,S.、Ali,R.A.、Shahzad,M.、Jaleel,A.、Andrade,P.B.、Khan,S.N.、Khan。GIPC3的突变会导致非综合征性听力损失DFNB72,但不会导致DFNB81,DFNB81也映射到染色体19p。嗯,遗传学。130: 759-765, 2011.[公共医学:21660509,图像,相关引文][全文]

  5. Saitoh,T.、Mine,T.和Katoh,M。人GIPC3的分子克隆和特征分析,GIPC3是一个与人GIPC1和GIPC2同源的新基因。国际期刊Oncol。20: 577-582, 2002.[公共医学:11836571,相关引文]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2011年7月27日
创建日期:
劳拉·L·巴克斯特:2004年9月7日
mgross:2020年9月11日
卡罗尔:2013年9月25日
卡罗尔:2012年6月11日
卡罗尔:2011年11月23日
wwang:2011年7月28日
ckniffin:2011年7月27日
mgross:2004年7月9日

*608792

GIPC PDZ域名包含家庭,成员3;GIPC3型


备选标题;符号

GAIP C-末端侵入蛋白3


HGNC批准的基因符号:GIPC3

细胞遗传学位置:19p13.3 基因组坐标(GRCh38): 19:3,585,478-3,593,541 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
19页13.3 耳聋,常染色体隐性遗传15 601869 常染色体隐性

文本

克隆和表达

通过对胎肺RNA的基因组序列分析和RT-PCR,Saitoh等人(2002年)获得了编码GIPC3的全长cDNA。预测的312-氨基酸蛋白包含一个N端GIPC同源结构域(GH1)、一个中心PDZ结构域和一个C端GH2结构域。GIPC3与GIPC1(605072)具有59.9%的氨基酸同源性,与GIPC2(619089)具有55.3%的同源性,而与爪蟾科米特具有57.2%的同源性。Northern blot分析检测到4.5-kb GIPC3转录本几乎普遍表达,在小肠中表达最高。RNA斑点杂交分析显示,GIPC3在空肠、淋巴结、顶叶、胎儿脾脏和胎儿胸腺中的表达最高。Northern blot分析检测到GIPC3在宫颈癌、黑色素瘤和慢性粒细胞白血病细胞系以及所检测的7个胃癌细胞系中的2个中的表达。


基因结构

Saitoh等人(2002年)确定GIPC3基因包含6个外显子。


映射

通过基因组序列分析,Saitoh等人(2002年)将GIPC3基因映射到染色体19p13.3。


分子遗传学

Charizopoulou等人(2011)在一个患有舌前发病的常染色体隐性感音神经性耳聋的印度和荷兰家庭的受影响成员中发现了GIPC3基因中的2种不同的纯合突变(分别为L262R,608792.0001和W301X,608792.0002)。Charizopoulou等人(2011年)发现小鼠基因Gipc3的突变与小鼠常染色体隐性聋有关,因此选择该基因进行研究(见动物模型)。

Rehman等人(2011年)在7个患有常染色体隐性遗传非综合征性耳聋的巴基斯坦非血缘亲属的受影响成员中,在GIPC3基因中发现了7种不同的纯合子突变,包括1个移码和6个错义,包括Ain等人先前报道的2个DFNB72家族(2007)。除1个突变外(R189C;601869.0006)均位于GH1或GH2结构域。


动物模型

通过定位克隆常染色体隐性遗传早发性年龄相关听力损失小鼠模型(ahl5),Charizopoulou等人(2011年)在Gipc3基因外显子2中发现了一个纯合G115R突变,影响蛋白质的PDZ结构域。Gipc3基因的突变也被发现是小鼠幼年听源性单基因癫痫(jams1)表型的基础,在该表型中,受影响的小鼠在生命早期表现出癫痫易感性,并随着年龄的增长而消失。G115R突变导致Gipc3蛋白减少。突变小鼠的组织病理学研究显示,外毛细胞和内毛细胞的静纤毛束结构不规则,Corti器官的迟发性变性从底部开始,向顶端发展。同时,螺旋神经节表现出严重的神经元丢失,在耳蜗底部和中尖区最为明显。这些数据表明,Gipc3是头发束出生后成熟以及毛细胞和螺旋神经节长期存活所必需的。突变小鼠的内外毛细胞均显示出机械传递缺陷,这与钾通道活性缺陷有关。听源性癫痫易感性和后期抵抗与听源性脑干反应振幅的增加和随后的下降相关。在野生型小鼠中,Gipc3定位于内外毛细胞、耳蜗螺旋神经节神经元、前庭毛细胞和前庭神经节神经元的细胞质。


ALLELIC变体 6个精选示例):

.0001耳聋,自动耳塞15

GIPC3、LEU262ARG
单号:rs387906999,临床变量:RCV000023732

在一个患有常染色体隐性聋(DFNB15;601869)的印度近亲家族的受累成员中(Chen等人,1997年),Charizopoulou等人(2011年)在GIPC3基因第5外显子中发现了纯合785T-G颠倒,导致GH2结构域中高度保守残基的leu262-to-arg(L262R)替换。322条控制染色体未检测到突变。该耳聋为非综合征性,且为语言前发病。


.0002耳聋,自动耳塞15

GIPC3、TRP301TER
SNP:rs387907000,临床变量:RCV000023733

Charizopoulou等人(2011年)在一个常染色体隐性聋荷兰家系(DFNB15;601869)的受影响成员中发现了GIPC3基因第6外显子中的纯合903G-a转换,导致trp301-ter(W301X)替换和最后12个蛋白残基的丢失。312条控制染色体未发现突变。听力损失是双侧性的,感觉神经性的,在婴儿期发病早。


.0003耳聋,自动耳塞15

GIPC3,1-BP DUP,685G
SNP:rs748150647,gnomAD:rs748150647,临床变量:RCV000023734

在患有DFNB15(601869)的巴基斯坦血亲家庭的受影响成员中,Rehman等人(2011年)在GIPC3基因第4外显子中发现了纯合1 bp重复(685dupG),导致了GH2结构域的移码和过早终止。572条控制染色体未发现突变。Ain等人(2007年)曾报道过该家族,并将其定位于DFNB72位点。


.0004耳聋,自动耳塞15

GIPC3、GLY256ASP
SNP:rs387907001,临床变量:RCV000023735

在患有DFNB15(601869)的巴基斯坦近亲家族的受影响成员中,Rehman等人(2011年)在GIPC3基因第5外显子中发现了纯合767G-a过渡,导致GH2结构域保守残基中的gly256-to-asp(G256D)替代。在572条对照染色体中未发现突变。Ain等人(2007年)曾报道过该家族,并将其定位于DFNB72位点。


.0005耳聋,自动耳塞15

GIPC3,GLY46ARG公司
单号:rs946085339,gnomAD:rs946085339,临床变量:RCV000023736

在患有DFNB15(601869)的巴基斯坦近亲家族的受影响成员中,Rehman等人(2011年)在GIPC3基因的外显子1中发现了纯合136G-a转换,导致GH1结构域保守残基中的gly46-to-arg(G46R)替换。590条控制染色体未发现突变。


.0006耳聋,自动耳塞15

GIPC3、ARG189CYS
SNP:rs387907002,gnomAD:rs387907002,临床变量:RCV000023737

在一个患有DFNB15(601869)的巴基斯坦血亲家族的受影响成员中,Rehman等人(2011)在GIPC3基因的外显子3中发现了纯合565C-T转换,导致PDZ结构域中保守残基中的arg189到cys(R189C)取代。590条控制染色体未发现突变。


参考文献

  1. Ain,Q.,Nazli,S.,Riazuddin,S。常染色体隐性遗传非综合征性耳聋基因座DFNB72位于染色体19p13.3上。嗯,遗传学。122: 445-450, 2007.[公共医学:17690910][全文:https://doi.org/10.1007/s00439-007-0418-z]

  2. Charizopoulou,N.、Lelli,A.、Schraders,M.、Ray,K.、Hildebrand,M.S.、Ramesh,A.、Srisailapathy,C.R.、Oostrick,J.、Admiraal,R.J.C.、Neely,H.R.、Latoche,J.R.,Smith,R.H.、Northup,J.K.、Kremer,H.、Holt,J.R、Noben-Trauth,K。Gipc3突变与小鼠和人类的听源性癫痫和感音神经性听力损失相关。自然社区。2: 201, 2011. 注:电子文章。[公共医学:21326233][全文:https://doi.org/10.1038/ncomms1200]

  3. Chen,A.、Wayne,S.、Bell,A.、Ramesh,A.、Srisailapathy,C.R.、Scott,D.A.、Sheffield,V.C.、Van Hauwe,P.、Zbar,R.I.、Ashley,J.、Lovett,M.、Van Camp,G.、Smith,R.J.、。常染色体隐性遗传非综合征性耳聋的新基因定位于染色体3q或19p。美国医学遗传学杂志。71: 467-471, 1997.[公共医学:9286457]

  4. Rehman,A.U.、Gul,K.、Morell,R.J.、Lee,K.,Ahmed,Z.M.、Riazuddin,S.、Ali,R.A.、Shahzad,M.、Jaleel,A.、Andrade,P.B.、Khan,S.N.、Khan。GIPC3的突变会导致非综合征性听力损失DFNB72,但不会导致DFNB81,DFNB81也映射到染色体19p。嗯,遗传学。130: 759-765, 2011.[公共医学:21660509][全文:https://doi.org/10.1007/s00439-011-1018-5]

  5. Saitoh,T.、Mine,T.和Katoh,M。与人GIPC1和GIPC2同源的新基因人GIPC3的分子克隆和鉴定。国际期刊Oncol。20: 577-582, 2002.[公共医学:11836571]


贡献者:
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