条目-*608370-硬脂酰钴脱水酶5;SCD5型-OMIM公司
 
*608370

硬脂酰钴脱水酶5;SCD5型


备选标题;符号

ACYL-CoA脱氧酶4;ACOD4型
脂肪酸脱水酶4;FADS4系统


HGNC批准的基因符号:SCD5型

细胞遗传学位置:第4季度21.22   基因组坐标(GRCh38):4:82,629,539-82,798,796 (来自NCBI)


基因表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第4季度21.22 ?耳聋,常染色体显性79 619086 AD公司

文本

说明

硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD;酶代码EC1.14.99.5)是内质网的一种完整膜蛋白,催化饱和脂肪酸形成单不饱和脂肪酸。SCD可能是能量代谢的关键调节器,在肥胖和血脂异常中发挥作用。在小鼠中已鉴定出四种SCD亚型,即Scd1到Scd4。相反,只有2种SCD亚型,SCD1(604031)和SCD5已在人类中鉴定。SCD1与所有4种小鼠SCD亚型以及大鼠SCD1和Scd2具有约85%的氨基酸同源性。相比之下,SCD5与啮齿动物SCD的同源性有限,似乎是灵长类特有的(Wang等人,2005年).


克隆和表达

通过分析4号染色体的一个区域,该区域与一例家族性唇裂患者的平衡性心周倒置有关(参见608371),贝拉吉等人(2003年)克隆了SCD5,他们称之为ACOD4。推导出的330-氨基酸蛋白的预测分子量为37.6 kD。与其他SCD一样,SCD5包含一个独特的N末端,其后是一个5跨膜区和3个催化组氨酸盒,被认为可以结合酶活性所需的非血红素铁。Northern blot分析检测到3.0kb转录物在胎脑中高水平表达,在胎肾中低水平表达。在胎儿肺或任何检查的成人组织中均未检测到SCD5表达。

通过对豚鼠耳蜗连续切片的免疫组织化学分析,Lu等人(2020)在血管纹、螺旋突起后面的耳蜗外侧壁细胞以及Corti器官的内外毛细胞中观察到表达,在螺旋神经节细胞的细胞质中表达最强。在人胎儿耳蜗中,SCD5在螺旋神经节细胞和Corti器官中表达。


基因结构

贝拉吉等人(2003年)确定SCD5基因包含5个外显子,跨度约169kb。


映射

通过FISH和基因组序列分析,贝拉吉等人(2003年)将SCD5基因定位到染色体4q21.1。


分子遗传学

在一个5代中国大家族中,常染色体显性非综合征进行性感音神经性耳聋4号染色体定位(DFNA79;619086),Lu等人(2020)鉴定了SCD5基因中的杂合错义突变(W209S;608370.0001)这与疾病隔离,在对照组中未发现。


ALLELIC变体( 1选定示例):

.0001失聪,自动控制79(1个家族)

在一个5代中国大家族(家族60)中,分离出常染色体显性非综合征进行性感音神经性耳聋4号染色体定位(DFNA79;619086),Lu等人(2020)确定SCD5基因第2外显子中c.626G-c颠倒(c.626G-c,NM_001037582)的杂合性,导致trp209-to-ser(W209S)在第三跨膜结构域内的高度保守残基处发生替换。该突变与疾病分离,在100名对照组或81名散发性听力损失患者中未发现;然而,在1000个基因组和ExAC数据库中发现了较低的次要等位基因频率(分别为0.0002和0.00008)。对转染HEI-OC1细胞的分析表明,与野生型SCD5相比,W209S突变体的细胞增殖率更低。


参考文献

  1. Beraghi,S.、Zhou,M.、Talmadge,C.B.、Went-Sumegi,N.、Davis,J.R.、Huang,D.、Saal,H.、Seemayer,T.A.、Sumegi,J。唇裂家系中一个被中心周围反转inv(4)(p13.1q21.1)破坏的新基因的鉴定和特征。基因309:11-212003。[公共医学:12727354,相关引文][全文]

  2. Lu,X.、Zhang,Y.、Chen,L.、Wang,Q.、Zeng,Z.、Dong,C.、Qi,Y.、Liu,Y。全外显子组测序确定SCD5是常染色体显性非综合征性耳聋的一个新的致病基因。欧洲。医学遗传学杂志。63: 103855, 2020. 注:电子文章。[公共医学:31972369,相关引文][全文]

  3. Wang,J.,Yu,L.,Schmidt,R.E.,Su,C.,Huang,X.,Gould,K.,Cao,G。灵长类特有的新型人类硬脂酰辅酶a去饱和酶HSCD5的特征。生物化学。生物物理学。Res.社区。332: 735-742, 2005.[公共医学:15907797,相关引文][全文]


Marla J.F.O'Neill-更新日期:2020年9月11日
Matthew B.Gross-更新时间:2005年11月4日
Patricia A.Hartz-更新时间:2005年10月20日
创建日期:
Patricia A.Hartz:2003年12月31日
脱发:2023年8月11日
阿洛佩兹:2020年9月11日
mgross:2005年4月11日
米格罗斯:2005年11月4日
特里:2005年10月20日
卡罗尔:2003年12月31日
卡罗尔:2003年12月31日

*608370

硬脂酰钴脱水酶5;SCD5型


备选标题;符号

ACYL-CoA脱氧酶4;ACOD4型
脂肪酸脱水酶4;FADS4系统


HGNC批准的基因符号:SCD5

细胞遗传学位置:4q21.22   基因组坐标(GRCh38):4:82629539-82798796 (来自NCBI)


基因表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第4季度21.22 ?耳聋,常染色体显性79 619086 常染色体显性

文本

说明

硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD;EC 1.14.99.5)是内质网的一种完整膜蛋白,可催化饱和脂肪酸形成单不饱和脂肪酸。SCD可能是能量代谢的关键调节器,在肥胖和血脂异常中发挥作用。在小鼠中已鉴定出四种SCD亚型,即Scd1到Scd4。相比之下,在人类中仅鉴定出2种SCD亚型,即SCD1(604031)和SCD5。SCD1与所有4种小鼠SCD亚型以及大鼠SCD1和Scd2具有约85%的氨基酸同源性。相比之下,SCD5与啮齿动物SCD的同源性有限,似乎是灵长类特有的(Wang等人,2005年)。


克隆和表达

贝拉吉等人(2003年)通过分析与家族性唇裂病例相关的4号染色体平衡着丝粒间倒置相关的一个区域,克隆了SCD5,他们称之为ACOD4。推导出的330-氨基酸蛋白的预测分子量为37.6 kD。与其他SCD一样,SCD5含有一个独特的N末端,后面是一个5-跨膜区和3个催化组氨酸盒,被认为可以结合酶活性所需的非血红素铁。Northern印迹分析检测到3.0kb转录物在胎儿大脑中高水平表达,在胎儿肾脏中低水平表达。在胎儿肺或任何检查的成人组织中均未检测到SCD5表达。

通过对豚鼠耳蜗连续切片的免疫组织化学分析,Lu等人(2020年)观察到血管纹、螺旋突起后耳蜗外侧壁细胞和Corti器官内外毛细胞中的表达,其中螺旋神经节细胞的细胞质中表达最强。在人胎儿耳蜗中,SCD5在螺旋神经节细胞和Corti器官中表达。


基因结构

Beraghi等人(2003年)确定SCD5基因包含5个外显子,跨度约169 kb。


映射

通过FISH和基因组序列分析,Beraghi等人(2003年)将SCD5基因定位到染色体4q21.1。


分子遗传学

Lu等人(2020年)在一个中国5代大家族中,分离了常染色体显性非综合征进行性感音神经性耳聋4号染色体(DFNA79;619086),在SCD5基因(W209S;608370.0001)中发现了一个杂合错义突变,该突变与疾病分离,在对照组中未发现。


ALLELIC变体 1选定示例):

.0001失聪,自动控制79(1个家族)

SCD5、TRP209SER
SNP:rs192654796,gnomAD:rs192654796,临床变量:RCV001264778

在一个分离常染色体显性非综合征进行性感音神经性耳聋4号染色体定位的5代中国大家族(60家系)中(DFNA79;619086),Lu等人(2020)在SCD5基因外显子2中发现了c.626G-c颠换(c.626G-c,NM_001037582)的杂合性,导致trp209-to-ser(W209S)第三跨膜结构域内高度保守残基的取代。该突变与疾病分离,在100名对照组或81名散发性听力损失患者中未发现;然而,在1000个基因组和ExAC数据库中发现了较低的次要等位基因频率(分别为0.0002和0.00008)。对转染HEI-OC1细胞的分析表明,与野生型SCD5相比,W209S突变体的细胞增殖率更低。


参考文献

  1. Beraghi,S.、Zhou,M.、Talmadge,C.B.、Went-Sumegi,N.、Davis,J.R.、Huang,D.、Saal,H.、Seemayer,T.A.、Sumegi,J。唇裂家系中一个被中心周围反转inv(4)(p13.1q21.1)破坏的新基因的鉴定和特征。基因309:11-212003。[公共医学:12727354][全文:https://doi.org/10.1016/s0378-1119(03)00461-x]

  2. Lu,X.,Zhang,Y.,Chen,L.,Wang,Q.,Zeng,Z.,Dong,C.,Qi,Y。全外显子组测序确定SCD5是常染色体显性非综合征性耳聋的新致病基因。欧洲。医学遗传学杂志。63: 103855, 2020. 注:电子文章。[公共医学:31972369][全文:https://doi.org/10.1016/j.ejmg.2020.103855]

  3. Wang,J.,Yu,L.,Schmidt,R.E.,Su,C.,Huang,X.,Gould,K.,Cao,G。灵长类特有的新型人类硬脂酰辅酶a去饱和酶HSCD5的特征。生物化学。生物物理学。Res.社区。332: 735-742, 2005.[公共医学:15907797][全文:https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2005.05.013]


贡献者:
Marla J.F.O'Neill-更新日期:2020年9月11日
Matthew B.Gross-更新时间:2005年11月4日
Patricia A.Hartz-更新时间:2005年10月20日

创建日期:
Patricia A.Hartz:2003年12月31日

编辑历史记录:
脱发:2023年8月11日
阿洛佩兹:2020年9月11日
mgross:2005年4月11日
米格罗斯:2005年11月4日
特里:2005年10月20日
卡罗尔:2003年12月31日
卡罗尔:2003年12月31日