*607314 目录
HGNC批准的基因符号:驾驶室2
细胞遗传学位置:11问题13.2 基因组坐标(GRCh38):11:67,518,912-67,523,446 (来自NCBI)
使用从牛Cabp2序列设计的引物,Haeseleer等人(2000年)用视网膜cDNA文库PCR克隆人CABP2。推导出的221氨基酸蛋白质的计算分子量为24.8 kD,包含一个N末端肉豆蔻酰化信号和3个EF末端,对应于钙调蛋白的EF末端1、3和4(参见114180); CABP2中部分删除了EF-hand 2。他们还克隆了小鼠Cabp2,并鉴定了一个较短的变异体,该变异体编码一个160氨基酸蛋白质,计算分子量约为18kD。CABP2与CABP1有72%的相似性(605563)与钙调蛋白的相似性为56%。人类CABP2与牛和小鼠同源物也有91%到98%的相似性。Northern blot分析仅在视网膜中检测到1.5kb和1.3kb转录物的弱表达。一些小鼠组织的RT-PCR仅在视网膜中检测到表达。Sokal等人(2000年)证实了CABP2表达的这些结果。
Haeseleer等人(2000年)确定CABP2基因包含6个外显子,跨度约为5kb。
通过FISH,Haeseleer等人(2000年)将CABP2基因定位到染色体11q13.1。Sokal等人(2000年)注意到CABP4基因(608965)也映射到11号染色体,但它距离CABP2基因至少40 kb。
Haeseleer等人(2000年)确定CABP2在体外是肉豆蔻酰化的。他们还发现,从牛视网膜纯化的短形式CABP2刺激CAMK2(参见114078)在Ca(2+)的存在下。CABP2还抑制G蛋白偶联受体激酶-5(GRK5;600870)-视紫红质介导的磷酸化(180380),尽管其与GRK5的亲和力低于CABP1。
在3个无血缘关系的伊朗近亲家庭中分离出常染色体隐性聋(DFNB93;614899),Schrauwen等人(2012)确定CABP2基因剪接位点突变的纯合子(607314.0001)这在每个家庭中都与疾病隔离,而在对照组中没有发现。突变蛋白在等温滴定量热法中改变了Ca(2+)结合,对Ca(v)1.3 Ca(2+)通道的调节作用较弱。
分离常染色体隐性聋(DFNB93;614899),Schrauwen等人(2012)在CABP2基因内含子6的5素供体位点鉴定出637+1G-T颠倒的纯合子。该突变在每个家族中与疾病分离,在100名伊朗对照组中未发现。单倍型分析表明,这可能是从古代共同祖先遗传而来的创始人突变;共享区域的小尺寸表明突变可能有数百年甚至数千年的历史。对转染COS-7细胞制备的cDNA进行分析,结果显示只有177-bp的PCR产物,与外显子6的完全跳过一致,预计这将导致移码和密码子F164提前终止(Phe164Serfs*4)。野生型和F164X截短型CABP2的等温滴定量热法表明,野生型CAPP2的吸热Ca(2+)结合反应与截短蛋白的结合较弱,表明Ca(2+)结合发生了变化,可能会干扰其作为钙(2+)传感器的作用。HEK293T细胞转染研究表明,突变型CABP2对Ca(v)1.3 Ca(2+)通道负反馈调节的抑制作用弱于野生型;此外,野生型CABP2显著抑制电流密度,而突变型没有影响。
Haeseleer,F.、Sokal,I.、Verlinde,C.L.M.J.、Erdjument-Bromage,H.、Tempst,P.、Pronin,A.N.、Benovic,J.L.、Fariss,R.N.、Palczewski,K。与钙调素相似的新型钙结合蛋白(CABP)亚家族的五个成员。生物学杂志。化学。275: 1247-1260, 2000.[公共医学:10625670,图像,相关引文][全文]
Schrauwen,I.、Helfmann,S.、Inagaki,A.、Predoehl,F.、Tabatabaiefar,M.A.、Picher,M.M.、Sommen,M.、Seco,C.Z.、Oostrik,J.、Kremer,H.、Dheedene,A.、Claes,C.、Fransen,E.、Chaleshtori,M.H.、Coucke,P.、Lee,A.、Moser,T.、Van Camp,G。耳蜗毛细胞中表达的CABP2突变会导致常染色体隐性遗传性听力损伤。Am.J.Hum.遗传学。91: 636-645, 2012.[公共医学:22981119,图像,相关引文][全文]
Sokal,I.,Li,N.,Verlinde,C.L.M.J.,Haeseler,F.,Baehr,W.,Palczewski,K。视网膜中的钙结合蛋白:从人类疾病的发现到病因。生物化学。生物物理学。《学报》1498:233-2512000年。[公共医学:11108966,相关引文][全文]
HGNC批准的基因符号:CABP2
细胞遗传学位置:11q13.2 基因组坐标(GRCh38): 11:67,518,912-67,523,446 (来自NCBI)
利用从牛Cabp2序列设计的引物,Haeseler等人(2000年)通过PCR和视网膜cDNA文库克隆了人Cabp2。推导出的221个氨基酸的蛋白质具有24.8kD的计算分子量,并且包含N-末端肉豆蔻酰化信号和3个EF手,其对应于钙调素的EF手1、3和4(参见114180);CABP2中部分删除了EF-hand 2。他们还克隆了小鼠Cabp2,并鉴定了一个较短的变异体,该变异体编码一个160氨基酸蛋白质,计算分子量约为18kD。CABP2与CABP1(605563)的相似性为72%,与钙调蛋白的相似性则为56%。人类CABP2与牛和小鼠同源物也有91%到98%的相似性。Northern blot分析仅在视网膜中检测到1.5kb和1.3kb转录物的弱表达。一些小鼠组织的RT-PCR仅在视网膜中检测到表达。Sokal等人(2000年)证实了CABP2表达的这些结果。
通过FISH,Haeseler等人(2000年)将CABP2基因映射到染色体11q13.1。Sokal等人(2000年)指出,CABP4基因(608965)也映射到11号染色体,但它距离CABP2基因至少40 kb。
Haeseler等人(2000年)确定CABP2在体外是肉豆蔻酰化的。他们还发现,从牛视网膜纯化的短型CABP2在Ca(2+)存在下刺激CAMK2(参见114078)。CABP2还抑制G蛋白偶联受体激酶-5(GRK5;600870)介导的视紫红质(180380)磷酸化,尽管其与GRK5的亲和力低于CABP1。
Schrauwen等人(2012年)在3个分离常染色体隐性耳聋(DFNB93;614899)的无血缘关系的伊朗近亲家族中,确定了CABP2基因(607314.001)中剪接位点突变的纯合子,该基因与每个家族中的疾病分离,在对照组中未发现。突变蛋白在等温滴定量热法中改变了Ca(2+)结合,对Ca(v)1.3 Ca(2+)通道的调节作用较弱。
Schrauwen等人(2012年)在分离常染色体隐性聋的3个无血缘关系的伊朗近亲家族(DFNB93;614899)的受影响成员中,确定了CABP2基因内含子6的5个主要供体位点637+1G-T颠换的纯合子。该突变在每个家族中与疾病分离,在100名伊朗对照组中未发现。单倍型分析表明,这可能是从古代共同祖先遗传而来的创始人突变;共享区域的小尺寸表明突变可能有数百年甚至数千年的历史。对转染COS-7细胞制备的cDNA进行分析,结果显示只有177-bp的PCR产物,与外显子6的完全跳过一致,预计这将导致移码和密码子F164提前终止(Phe164Serfs*4)。野生型和F164X截短型CABP2的等温滴定量热法表明,野生型CAPP2的吸热Ca(2+)结合反应与截短蛋白的结合较弱,表明Ca(2+)结合发生了变化,可能会干扰其作为钙(2+)传感器的作用。HEK293T细胞转染研究表明,突变型CABP2对Ca(v)1.3 Ca(2+)通道负反馈调节的抑制作用弱于野生型;此外,野生型CABP2显著抑制电流密度,而突变型没有影响。
Haeseleer,F.、Sokal,I.、Verlinde,C.L.M.J.、Erdjument-Bromage,H.、Tempst,P.、Pronin,A.N.、Benovic,J.L.、Fariss,R.N.、Palczewski,K。与钙调素相似的新型钙结合蛋白(CABP)亚家族的五个成员。生物学杂志。化学。275: 1247-1260, 2000.[PubMed:10625670][全文:https://doi.org/10.1074/jbc.275.2.1247]
Schrauwen,I.,Helfmann,S.,Inagaki,A.,Predoehl,F.,Tabatabaiefar,M.A.,Picher,M.M.,Sommen,M.,Seco,C.Z.,Oostrick,J.,Kremer,H.,Dheedene,A.,Claes,C.,Fransen,E.,Chaleshori,M.H.,Coucke,P.,Lee,A.,Moser,T.,Van Camp,G。耳蜗毛细胞中表达的CABP2突变会导致常染色体隐性遗传性听力损伤。Am.J.Hum.遗传学。91: 636-645, 2012.[PubMed:22981119][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2012.08.018]
Sokal,I.,Li,N.,Verlinde,C.L.M.J.,Haeseler,F.,Baehr,W.,Palczewski,K。视网膜中的钙结合蛋白:从人类疾病的发现到病因。生物化学。生物物理学。《学报》1498:233-2512000年。[公共医学:11108966][全文:https://doi.org/10.1016/0167-4889(00)00099-9]
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